More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1350 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1350  type III secretion protein  100 
 
 
94 aa  189  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.134414  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1187  type III secretion exporter  53.7 
 
 
119 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0679661 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3620  type III secretion protein  59.26 
 
 
91 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514646  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2339  type III secretion proteins, related to flagellar biosynthesis protein FlhB  60.76 
 
 
89 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0300907  normal  0.34109 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1578  type III secretion protein  61.25 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0759274  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0648  hypothetical protein  62.96 
 
 
89 aa  94.7  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0891258 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3125  type III secretion proteins, related to flagellar biosynthesis protein FlhB  59.74 
 
 
88 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.743402 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1808  flagellar protein FhlB-like protein  56.98 
 
 
119 aa  94.4  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2793  flagellar protein FhlB-like protein  51.22 
 
 
114 aa  94  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.48705  normal  0.231466 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3399  type III secretion protein  53.57 
 
 
88 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.885656  normal  0.18275 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0864  FlhB domain-containing protein  49.45 
 
 
93 aa  91.3  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.119652  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0935  FlhB domain-containing protein  49.45 
 
 
93 aa  91.3  4e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1400  type III secretion proteins, related to flagellar biosynthesis protein FlhB  57.5 
 
 
89 aa  91.3  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301854  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3655  hypothetical protein  48.81 
 
 
114 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1464  FlhB domain-containing protein  48.31 
 
 
102 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1538  flagellar protein FhlB-like protein  50 
 
 
112 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0996  FlhB domain-containing protein  49.45 
 
 
93 aa  90.1  9e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.480741  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2505  hypothetical protein  49.41 
 
 
88 aa  89.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2899  FlhB domain-containing protein  47.19 
 
 
102 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.152734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3041  FlhB domain-containing protein  47.19 
 
 
102 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.595282 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2909  FlhB domain-containing protein  47.19 
 
 
102 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2635  hypothetical protein  49.41 
 
 
88 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1645  FlhB domain-containing protein  43.68 
 
 
104 aa  89  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.961468  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19930  FlhB domain protein  45.98 
 
 
95 aa  89  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4329  FlhB domain-containing protein  48.78 
 
 
112 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3395  FlhB domain-containing protein  48.31 
 
 
107 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127036  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2549  FlhB domain-containing protein  43.82 
 
 
103 aa  88.6  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3854  flagellar biosynthetic FlhB domain-containing protein  46.67 
 
 
111 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.119948  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3637  FlhB domain protein  50 
 
 
107 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1575  FlhB domain-containing protein  48.78 
 
 
112 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45410  FlhB domain-containing protein  45.56 
 
 
111 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2809  FlhB domain-containing protein  40.86 
 
 
104 aa  86.3  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0839  FlhB domain-containing protein  49.38 
 
 
87 aa  85.1  3e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1393  FlhB domain-containing protein  44.83 
 
 
118 aa  85.1  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.372355  normal  0.17507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2788  flhB-related protein  55.13 
 
 
90 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1369  FlhB domain-containing protein  47.19 
 
 
103 aa  84  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.708638  hitchhiker  0.000555431 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1864  flagellar protein FhlB-like protein  47.62 
 
 
98 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.989751 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1388  FlhB domain-containing protein  44.05 
 
 
102 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1962  flagellar protein FhlB cytoplasmic domain-containing protein  48.1 
 
 
106 aa  82.8  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2270  FlhB domain-containing protein  47.06 
 
 
100 aa  82  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.381312  normal  0.112647 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1376  FlhB domain-containing protein  43.82 
 
 
103 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3039  FlhB domain-containing protein  45.05 
 
 
111 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00505506 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1309  FlhB domain-containing protein  43.82 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3199  FlhB domain-containing protein  46.07 
 
 
102 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1353  FlhB domain-containing protein  43.21 
 
 
99 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0752  flagellar protein FhlB-like protein  48.1 
 
 
104 aa  80.5  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1181  FlhB domain-containing protein  50 
 
 
87 aa  80.1  0.000000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1330  FlhB domain-containing protein  45.68 
 
 
87 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.391906  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3034  flagellar biosynthetic protein (FlhB)-like protein  53.09 
 
 
100 aa  79.3  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0574  conserved hypothetical protein, possible flagellar biosynthesis protein  46.84 
 
 
96 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03076  uncharacterized C-terminal FlhB domain-containing protein  41.3 
 
 
105 aa  77.8  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0068  FlhB domain-containing protein  44.32 
 
 
92 aa  77.4  0.00000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3258  FlhB domain-containing protein  46.43 
 
 
110 aa  77  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3898  hypothetical protein  46.51 
 
 
112 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.230986  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3417  hypothetical protein  52.7 
 
 
82 aa  76.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1814  cytoplasmic domain of flagellar protein FhlB-like protein  47.83 
 
 
92 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0287709 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1105  hypothetical protein  54.44 
 
 
90 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.372697  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1003  flagellar biosynthesis  48.28 
 
 
94 aa  74.3  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126325 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0778  flagellar biosynthetic protein  51.95 
 
 
93 aa  73.6  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0907025 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0759  flagellar biosynthesis  45.57 
 
 
94 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2404  cytoplasmic domain of flagellar protein FhlB-like protein  49.41 
 
 
100 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3034  FlhB domain-containing protein  48.68 
 
 
88 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1316  flagellar biosynthetic protein FlhB  55.42 
 
 
366 aa  73.6  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0719  flagellar biosynthesis protein  42.68 
 
 
98 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0524995  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0976  flagellar protein FhlB-like protein  42.17 
 
 
92 aa  72  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285688  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0789  flagellar biosynthetic protein FlhB  53.57 
 
 
374 aa  71.6  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000340873  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0429  cytoplasmic domain of flagellar protein FhlB-like protein  44.58 
 
 
125 aa  71.2  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.904356  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0972  FlhB domain protein  47.19 
 
 
87 aa  71.2  0.000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0587  flagellar biosynthesis protein FlhB  48.81 
 
 
354 aa  70.5  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0138  FlhB domain-containing protein  45.68 
 
 
83 aa  70.5  0.000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2893  flagellar related protein  55.81 
 
 
114 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1980  putative flagellar biosynthetic protein  53.25 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1351  flagellar protein with uncharacterized cytoplasmic FhlB domain-like protein  57.32 
 
 
98 aa  70.1  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1098  flagellar biosynthesis protein  42.17 
 
 
90 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0859628  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31030  flagellar biosynthesis pathway, component FlhB  51.19 
 
 
422 aa  68.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  55 
 
 
363 aa  68.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1163  flagellar biosynthesis protein FlhB  46.99 
 
 
351 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0793  FlhB domain protein  46.05 
 
 
87 aa  67.8  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0720642  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4196  flagellar biosynthesis protein FlhB  48.81 
 
 
354 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1596  flagellar protein FhlB  48.19 
 
 
124 aa  67  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2399  flagellar protein FhlB-like protein  45.45 
 
 
122 aa  67  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.303724  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2029  flagellar protein FhlB-like protein  47.06 
 
 
101 aa  67  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00113086  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1836  flagellar protein FhlB-like cytoplasmic domain-containing protein  47.83 
 
 
117 aa  67  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000219189  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2498  type III secretion exporter  51.16 
 
 
355 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.116579  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2594  type III secretion exporter  53.09 
 
 
355 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144753  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0739  flagellar biosynthesis protein FlhB  52.44 
 
 
379 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3161  FlhB domain-containing protein  51.19 
 
 
94 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.623186  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1359  type III secretion exporter  51.76 
 
 
355 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1160  FlhB domain-containing protein  45.33 
 
 
86 aa  66.2  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000262881  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1121  FlhB domain-containing protein  45.33 
 
 
86 aa  66.2  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111049  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1476  flagellar biosynthesis  44.19 
 
 
89 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911114  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  53.66 
 
 
380 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4140  flagellar biosynthetic protein FlhB  53.66 
 
 
382 aa  65.5  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1631  flagellar biosynthetic protein FlhB  49.37 
 
 
350 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4066  flagellar biosynthetic protein FlhB  46.32 
 
 
387 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0379  flagellar biosynthesis protein FlhB  50 
 
 
357 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  47.56 
 
 
381 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4178  flagellar biosynthetic protein FlhB  46.32 
 
 
387 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232408  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0369  FlhB domain-containing protein  50.65 
 
 
90 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.550946  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0426  flagellar biosynthesis protein FlhB  48.81 
 
 
352 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>