105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1414 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1414  FenI protein  100 
 
 		 540 aa  1092    Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.0039371  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2561  protein of unknown function DUF187  60.28 
 
 		 538 aa  580  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.443654  normal  0.134171 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1159  protein of unknown function DUF187  54.01 
 
 		 551 aa  580  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6128  FenI protein  51.25 
 
 		 533 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0784566  normal  0.824593 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2076  hypothetical protein  50.42 
 
 		 528 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3506  protein of unknown function DUF187  50.4 
 
 		 547 aa  460  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.339986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2393  fenI protein  50.42 
 
 		 551 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1156  fenI protein  50.21 
 
 		 554 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.466056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5534  hypothetical protein  49.48 
 
 		 676 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2118  fenI protein  50.31 
 
 		 494 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115313  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1597  fenI protein  50.21 
 
 		 521 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0010634  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0258  fenI protein  50.21 
 
 		 521 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1973  putative lipoprotein  50.21 
 
 		 521 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1956  putative lipoprotein  49.79 
 
 		 521 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0388068  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2396  protein of unknown function DUF187  45.04 
 
 		 532 aa  445  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.00000000122661  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1956  protein of unknown function DUF187  46.32 
 
 		 534 aa  444  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0273789  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6227  hypothetical protein  49.13 
 
 		 550 aa  444  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4428  protein of unknown function DUF187  47.17 
 
 		 540 aa  428  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.998711  normal  0.0596861 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5682  FenI protein  47.82 
 
 		 520 aa  430  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.663135  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1770  protein of unknown function DUF187  43.51 
 
 		 538 aa  405  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2268  hypothetical protein  39.2 
 
 		 519 aa  397  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159912  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1788  hypothetical protein  40.41 
 
 		 517 aa  395  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2416  hypothetical protein  39.06 
 
 		 519 aa  392  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2494  hypothetical protein  39.14 
 
 		 519 aa  391  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2557  hypothetical protein  39.01 
 
 		 519 aa  392  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.190128  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2914  hypothetical protein  37.83 
 
 		 519 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.737021 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2289  hypothetical protein  37.88 
 
 		 519 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2252  hypothetical protein  37.88 
 
 		 519 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2210  hypothetical protein  37.68 
 
 		 519 aa  386  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0607732  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2477  hypothetical protein  37.88 
 
 		 519 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0818  hypothetical protein  40.34 
 
 		 717 aa  383  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5345  protein of unknown function DUF187  40.71 
 
 		 570 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0922  protein of unknown function DUF187  40.64 
 
 		 437 aa  373  1e-102  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1195  protein of unknown function DUF187  48.86 
 
 		 406 aa  371  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0723  protein of unknown function DUF187  43.99 
 
 		 509 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.00880657 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4145  protein of unknown function DUF187  40.67 
 
 		 519 aa  363  4e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.227733 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3734  protein of unknown function DUF187  40.71 
 
 		 508 aa  361  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.459123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0054  hypothetical protein  40.2 
 
 		 729 aa  342  9e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000080624  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4809  hypothetical protein  38.4 
 
 		 493 aa  342  1e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2221  protein of unknown function DUF187  42.34 
 
 		 997 aa  337  3.9999999999999995e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.155376  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1822  hypothetical protein  46.8 
 
 		 442 aa  332  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0539291  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0061  yngK protein  39.04 
 
 		 512 aa  326  7e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2122  hypothetical protein  40.96 
 
 		 523 aa  325  1e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2061  hypothetical protein  44.47 
 
 		 431 aa  325  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00233563  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2030  hypothetical protein  45.92 
 
 		 435 aa  320  5e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1798  putative lipoprotein  44.59 
 
 		 427 aa  317  5e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0730367 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1472  putative lipoprotein  44.59 
 
 		 427 aa  316  6e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1577  hypothetical protein  44.59 
 
 		 427 aa  316  6e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0031  hypothetical protein  42.55 
 
 		 393 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.110752  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01950  hypothetical protein  44.33 
 
 		 447 aa  312  9e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1754  putative lipoprotein  42.86 
 
 		 439 aa  311  2e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.63355  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2156  protein of unknown function DUF187  42.86 
 
 		 439 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360071  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1576  putative lipoprotein  42.86 
 
 		 439 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1680  putative lipoprotein  42.86 
 
 		 439 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01449  predicted liprotein  42.61 
 
 		 439 aa  309  9e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01462  hypothetical protein  42.61 
 
 		 439 aa  309  9e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0753  hypothetical protein  42.9 
 
 		 393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2356  protein of unknown function DUF187  42.62 
 
 		 431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.592468  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1354  hypothetical protein  44.9 
 
 		 431 aa  308  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.14222  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2104  putative lipoprotein  44.29 
 
 		 404 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2166  hypothetical protein  44.29 
 
 		 384 aa  306  6e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1682  putative lipoprotein  44.02 
 
 		 404 aa  306  7e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1451  hypothetical protein  42.01 
 
 		 393 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00978092  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1310  hypothetical protein  44.63 
 
 		 409 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2822  hypothetical protein  36.85 
 
 		 521 aa  296  9e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03377  YngK protein  46.46 
 
 		 378 aa  294  3e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0802  hypothetical protein  44.47 
 
 		 451 aa  291  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0259  hypothetical protein  40.62 
 
 		 669 aa  290  4e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1593  protein of unknown function DUF187  37.89 
 
 		 486 aa  272  1e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1349  protein of unknown function DUF187  36.85 
 
 		 508 aa  266  8e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4123  protein of unknown function DUF187  32.93 
 
 		 481 aa  256  6e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.543211  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2775  protein of unknown function DUF187  28.55 
 
 		 605 aa  246  6e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000508646  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2257  hypothetical protein  31.77 
 
 		 490 aa  218  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0476  yngK protein  31.99 
 
 		 515 aa  208  2e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0631  hypothetical protein  24.06 
 
 		 906 aa  93.6  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.835872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0133  hypothetical protein  27.6 
 
 		 395 aa  91.7  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288293  normal  0.118371 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1581  protein of unknown function DUF187  26.33 
 
 		 406 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.088417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3463  hypothetical protein  25 
 
 		 1099 aa  89.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.639127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0321  protein of unknown function DUF187  31.37 
 
 		 911 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.140793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3629  protein of unknown function DUF187  25.8 
 
 		 906 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2484  protein of unknown function DUF187  25.8 
 
 		 906 aa  84  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.979378 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2542  protein of unknown function DUF187  27.03 
 
 		 535 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1537  protein of unknown function DUF187  26.16 
 
 		 380 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3564  protein of unknown function DUF187  27.03 
 
 		 535 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.463453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2522  hypothetical protein  22.78 
 
 		 420 aa  76.6  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.233662 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4403  protein of unknown function DUF187  24.76 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal  0.600099 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3619  protein of unknown function DUF187  24.07 
 
 		 437 aa  73.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1033  protein of unknown function DUF187  25.61 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.419258  normal  0.471208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1072  hypothetical protein  25.17 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0972168 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3137  hypothetical protein  24.83 
 
 		 430 aa  67.8  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2134  hypothetical protein  24.48 
 
 		 536 aa  67  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1934  protein of unknown function DUF187  23.47 
 
 		 427 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1609  hypothetical protein  23.38 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0289476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2650  hypothetical protein  22.32 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.517664  normal  0.489073 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1769  hypothetical protein  21.89 
 
 		 760 aa  63.9  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1911  protein of unknown function DUF187  22.83 
 
 		 427 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0336  hypothetical protein  23.81 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.329121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09991  hypothetical protein  25.24 
 
 		 410 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.573849 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3586  hypothetical protein  22.57 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169957  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1370  hypothetical protein  24.65 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.837101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>