More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0415 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0415  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 		 322 aa  652    Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00469729  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3989  ribose-phosphate pyrophosphokinase  85.09 
 
 		 322 aa  570  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0998  ribose-phosphate pyrophosphokinase  76.64 
 
 		 325 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0169  ribose-phosphate pyrophosphokinase  74.22 
 
 		 326 aa  511  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8607  Ribose-phosphate diphosphokinase  73.91 
 
 		 325 aa  511  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1946  ribose-phosphate pyrophosphokinase  77.02 
 
 		 325 aa  509  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3154  ribose-phosphate pyrophosphokinase  71.34 
 
 		 326 aa  489  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.911142  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1052  ribose-phosphate pyrophosphokinase  72.98 
 
 		 325 aa  486  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0769  ribose-phosphate pyrophosphokinase  71.47 
 
 		 324 aa  481  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0793268  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3962  ribose-phosphate pyrophosphokinase  73.16 
 
 		 324 aa  479  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  69.88 
 
 		 326 aa  461  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03490  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.67 
 
 		 334 aa  434  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.489296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0909  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.56 
 
 		 347 aa  435  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30170  ribose-phosphate pyrophosphokinase  66.98 
 
 		 327 aa  433  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.35865  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32370  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.4 
 
 		 326 aa  430  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.531624  normal  0.459993 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0987  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.71 
 
 		 326 aa  428  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257813 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1942  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.89 
 
 		 327 aa  424  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.214071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1218  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.09 
 
 		 326 aa  418  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1288  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.78 
 
 		 326 aa  420  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000959513 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0881  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.58 
 
 		 327 aa  415  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.328682 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4527  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.02 
 
 		 324 aa  416  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0656  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.81 
 
 		 323 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13390  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.3 
 
 		 326 aa  413  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.271989  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05480  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.23 
 
 		 326 aa  408  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3195  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.81 
 
 		 325 aa  410  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1943  ribose-phosphate pyrophosphokinase  64.13 
 
 		 326 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.985471 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4249  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.17 
 
 		 326 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.154192  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4628  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.17 
 
 		 326 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.38327  normal  0.568111 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4335  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.17 
 
 		 326 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127739  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4783  ribose-phosphate pyrophosphokinase  63.17 
 
 		 326 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0789  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.49 
 
 		 326 aa  401  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1290  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.42 
 
 		 326 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.49 
 
 		 326 aa  401  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1545  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.54 
 
 		 325 aa  399  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.317921  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1015  ribose-phosphate diphosphokinase  62.34 
 
 		 344 aa  395  1e-109  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11035  ribose-phosphate pyrophosphokinase  62.22 
 
 		 326 aa  393  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2708  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.45 
 
 		 327 aa  388  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458748  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.19 
 
 		 337 aa  380  1e-104  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1175  ribose-phosphate diphosphokinase  54.69 
 
 		 337 aa  377  1e-103  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.475519 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0717  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.73 
 
 		 316 aa  367  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.156805  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.49 
 
 		 323 aa  348  5e-95  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.338199  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.1 
 
 		 327 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0126613  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.53 
 
 		 316 aa  325  6e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.2 
 
 		 325 aa  319  3e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.16 
 
 		 315 aa  318  6e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.48 
 
 		 315 aa  318  7e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.09 
 
 		 317 aa  315  6e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.76 
 
 		 317 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.77 
 
 		 317 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0895  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.91 
 
 		 331 aa  311  9e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0441838  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.45 
 
 		 317 aa  311  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.45 
 
 		 317 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.45 
 
 		 317 aa  311  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.45 
 
 		 317 aa  311  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.45 
 
 		 317 aa  311  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.45 
 
 		 317 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.45 
 
 		 317 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.45 
 
 		 317 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.45 
 
 		 317 aa  311  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.52 
 
 		 319 aa  309  4e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.68 
 
 		 314 aa  309  4e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.52 
 
 		 319 aa  308  8e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.03 
 
 		 316 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.34 
 
 		 321 aa  306  4.0000000000000004e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.52 
 
 		 318 aa  305  6e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.6 
 
 		 319 aa  301  1e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.88 
 
 		 313 aa  301  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.41 
 
 		 330 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.74 
 
 		 322 aa  300  3e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.03 
 
 		 315 aa  299  5e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03970  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.15 
 
 		 321 aa  298  9e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.579813 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.56 
 
 		 322 aa  297  1e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.25 
 
 		 318 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.25 
 
 		 318 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.23 
 
 		 314 aa  296  4e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.37 
 
 		 317 aa  295  6e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.69 
 
 		 329 aa  294  1e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  47.32 
 
 		 317 aa  293  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.2 
 
 		 359 aa  293  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.24 
 
 		 338 aa  292  6e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11861  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.84 
 
 		 331 aa  291  8e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.669789  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1439  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.65 
 
 		 325 aa  291  1e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11871  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.15 
 
 		 331 aa  289  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.903436  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.59 
 
 		 319 aa  289  5.0000000000000004e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246187 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.02 
 
 		 331 aa  288  6e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0272078 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2126  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.95 
 
 		 313 aa  288  6e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.059797  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.71 
 
 		 314 aa  288  7e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11701  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.37 
 
 		 331 aa  288  8e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0239  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.73 
 
 		 311 aa  288  8e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.98 
 
 		 330 aa  287  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.15 
 
 		 331 aa  287  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.319247  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2113  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.77 
 
 		 331 aa  286  2e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0740784  normal  0.462424 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.67 
 
 		 337 aa  286  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.6 
 
 		 338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.69 
 
 		 316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.45 
 
 		 315 aa  286  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.25 
 
 		 330 aa  285  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1371  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.88 
 
 		 331 aa  284  1.0000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.499997  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0670  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.67 
 
 		 331 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00572245  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15031  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.67 
 
 		 331 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>