50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1896 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1896  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 
196 aa  399  1e-110  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000163278  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5536  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  61.83 
 
 
188 aa  238  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794333  normal  0.986186 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1602  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  62.21 
 
 
180 aa  214  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.038144  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4730  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  49.1 
 
 
181 aa  174  7e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0819226  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0286  exonuclease  38.1 
 
 
192 aa  117  2e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.887668  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0403  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  37.57 
 
 
201 aa  105  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3951  exonuclease  38.82 
 
 
180 aa  101  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152362  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0199  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  36.84 
 
 
227 aa  97.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1246  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  37.5 
 
 
279 aa  97.1  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44130  hypothetical protein  38.6 
 
 
183 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3753  hypothetical protein  37.43 
 
 
183 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2512  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  37.65 
 
 
182 aa  94  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105502  normal  0.618089 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0198  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.34 
 
 
178 aa  93.6  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183058  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1832  exonuclease  36.26 
 
 
181 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.408826 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2023  exonuclease, putative  36.26 
 
 
180 aa  92  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0659436  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3813  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  37.43 
 
 
183 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431588  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02516  hypothetical protein  35.29 
 
 
176 aa  91.3  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3566  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  36.84 
 
 
181 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4247  exonuclease  35.75 
 
 
183 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.351378  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1621  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  36.26 
 
 
183 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.586954  normal  0.0773532 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0992  hypothetical protein  34.71 
 
 
176 aa  89.4  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003555  hypothetical protein  34.71 
 
 
176 aa  88.6  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.014978  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29850  Exonuclease  36.63 
 
 
185 aa  88.6  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1823  putative exonuclease  31.18 
 
 
184 aa  83.6  2e-15  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000276682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5021  sporulation inhibitor KapD  30.38 
 
 
207 aa  75.5  4e-13  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4780  sporulation inhibitor KapD  30.38 
 
 
207 aa  75.5  4e-13  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5142  sporulation inhibitor KapD  30.38 
 
 
207 aa  75.5  4e-13  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4620  sporulation inhibitor KapD  29.75 
 
 
207 aa  75.5  5e-13  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5054  sporulation inhibitor KapD  30.38 
 
 
207 aa  75.1  7e-13  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5049  sporulation inhibitor KapD  30.38 
 
 
207 aa  75.1  7e-13  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4642  sporulation inhibitor KapD  30.38 
 
 
207 aa  74.7  9e-13  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2846  exonuclease  32.35 
 
 
194 aa  74.3  1e-12  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5042  sporulation inhibitor KapD  29.75 
 
 
207 aa  72.8  3e-12  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0192  sporulation inhibitor KapD  29.75 
 
 
207 aa  72.8  3e-12  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4732  sporulation inhibitor KapD  27.39 
 
 
207 aa  71.6  7e-12  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3013  sporulation inhibitor KapD  25.58 
 
 
206 aa  70.5  1e-11  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3521  sporulation inhibitor KapD  28.32 
 
 
207 aa  66.6  2e-10  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2192  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.73 
 
 
186 aa  63.2  2e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1356  hypothetical protein  45.45 
 
 
86 aa  61.2  9e-09  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.875905 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3552  exonuclease  25.16 
 
 
281 aa  51.6  8e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  8.04471e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3241  exonuclease  26.11 
 
 
281 aa  51.2  9e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.43121e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1671  exonuclease  25.62 
 
 
281 aa  50.1  2e-05  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.09537e-09  decreased coverage  8.31519e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3556  exonuclease  24.52 
 
 
281 aa  49.7  2e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.21125e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3247  exonuclease  23.87 
 
 
281 aa  48.1  8e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  8.08174e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3296  exonuclease  23.87 
 
 
281 aa  48.1  8e-05  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.13376e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3332  exonuclease  23.87 
 
 
281 aa  48.1  8e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  1.15219e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3547  exonuclease  23.87 
 
 
281 aa  48.1  8e-05  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.95667e-42 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08055  RNA binding protein (Arp), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02160)  29.63 
 
 
609 aa  47.4  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690514  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2950  sporulation inhibitor KapD  25.97 
 
 
209 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3646  exonuclease  22.35 
 
 
281 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  2.20885e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>