50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1896 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1896  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 		 196 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000163278  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5536  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  61.83 
 
 		 188 aa  238  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794333  normal  0.986186 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1602  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  62.21 
 
 		 180 aa  214  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.038144  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4730  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  49.1 
 
 		 181 aa  174  7e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0819226  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0286  exonuclease  38.1 
 
 		 192 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.887668  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0403  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  37.57 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3951  exonuclease  38.82 
 
 		 180 aa  101  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152362  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1246  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  37.5 
 
 		 279 aa  97.1  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0199  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  36.84 
 
 		 227 aa  97.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44130  hypothetical protein  38.6 
 
 		 183 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3753  hypothetical protein  37.43 
 
 		 183 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2512  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  37.65 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105502  normal  0.618089 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0198  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.34 
 
 		 178 aa  93.6  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183058  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1832  exonuclease  36.26 
 
 		 181 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.408826 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3813  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  37.43 
 
 		 183 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431588  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2023  exonuclease, putative  36.26 
 
 		 180 aa  92  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0659436  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02516  hypothetical protein  35.29 
 
 		 176 aa  91.3  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3566  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  36.84 
 
 		 181 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1621  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  36.26 
 
 		 183 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.586954  normal  0.0773532 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4247  exonuclease  35.75 
 
 		 183 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.351378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0992  hypothetical protein  34.71 
 
 		 176 aa  89.4  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003555  hypothetical protein  34.71 
 
 		 176 aa  88.6  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.014978  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29850  Exonuclease  36.63 
 
 		 185 aa  88.6  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1823  putative exonuclease  31.18 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000276682  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5142  sporulation inhibitor KapD  30.38 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5021  sporulation inhibitor KapD  30.38 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4780  sporulation inhibitor KapD  30.38 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4620  sporulation inhibitor KapD  29.75 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5049  sporulation inhibitor KapD  30.38 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5054  sporulation inhibitor KapD  30.38 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4642  sporulation inhibitor KapD  30.38 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2846  exonuclease  32.35 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5042  sporulation inhibitor KapD  29.75 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0192  sporulation inhibitor KapD  29.75 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4732  sporulation inhibitor KapD  27.39 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3013  sporulation inhibitor KapD  25.58 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3521  sporulation inhibitor KapD  28.32 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2192  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.73 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1356  hypothetical protein  45.45 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.875905 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3552  exonuclease  25.16 
 
 		 281 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000804471  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3241  exonuclease  26.11 
 
 		 281 aa  51.2  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000143121  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3556  exonuclease  24.52 
 
 		 281 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000521125  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1671  exonuclease  25.62 
 
 		 281 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000109537  decreased coverage  8.31519e-23 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3296  exonuclease  23.87 
 
 		 281 aa  48.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.1337599999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3547  exonuclease  23.87 
 
 		 281 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.95667e-42 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3332  exonuclease  23.87 
 
 		 281 aa  48.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000115219  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3247  exonuclease  23.87 
 
 		 281 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808174  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08055  RNA binding protein (Arp), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02160)  29.63 
 
 		 609 aa  47.4  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3646  exonuclease  22.35 
 
 		 281 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2950  sporulation inhibitor KapD  25.97 
 
 		 209 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>