51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1751 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1751  peptidase M14, carboxypeptidase A  100 
 
 		 304 aa  631  1e-180  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0043  peptidase M14, carboxypeptidase A  44.65 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0129  peptidase M14, carboxypeptidase A  39.37 
 
 		 424 aa  198  7e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.846597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1797  murein peptide amidase A  33.99 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1905  murein peptide amidase A  33.82 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001003  gamma-D-Glutamyl-meso-Diaminopimelate Amidase  32.37 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1769  murein peptide amidase A  30.88 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2320  murein peptide amidase A  35.77 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.836285  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2602  murein peptide amidase A  36.5 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1734  murein peptide amidase A  32.09 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.461062  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2299  murein peptide amidase A  32.6 
 
 		 242 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2614  murein peptide amidase A  32.5 
 
 		 235 aa  72.4  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.964461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07057  murein peptide amidase A  32.09 
 
 		 248 aa  72  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01314  hypothetical protein  32.04 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.107648  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1558  murein peptide amidase A  32.04 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1442  murein peptide amidase A  32.04 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2320  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.04 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.250489  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01303  murein peptide amidase A  32.04 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131141  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1970  murein peptide amidase A  32.04 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.996708  normal  0.386863 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1797  murein peptide amidase A  32.6 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1866  murein peptide amidase A  31.49 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.295718 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1652  murein peptide amidase A  30.94 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.609177  normal  0.0125995 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1804  murein peptide amidase A  30.94 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000928134 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1470  murein peptide amidase A  30.94 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1805  murein peptide amidase A  30.94 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.561164  normal  0.438296 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2149  murein peptide amidase A  31.95 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5494  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.52 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136631  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1536  murein peptide amidase A  31.49 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.62 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2643  zinc carboxypeptidase-related protein  29.89 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2718  zinc carboxypeptidase-related protein  29.89 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.792819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2604  zinc carboxypeptidase-related protein  29.89 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1742  zinc carboxypeptidase-related protein  30.56 
 
 		 342 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.212306  hitchhiker  0.00119795 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3295  putative carboxypeptidase  35.14 
 
 		 365 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.265399 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2282  zinc carboxypeptidase-related protein  27.59 
 
 		 346 aa  49.3  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.548754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2472  oxoglutarate dehydrogenase (succinyl-transferring)  27.65 
 
 		 341 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.319923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  33.03 
 
 		 821 aa  48.9  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1975  Zinc carboxypeptidase-related protein  27.07 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2354  zinc carboxypeptidase-related protein  27.59 
 
 		 341 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2903  hypothetical protein  28.81 
 
 		 337 aa  46.2  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0782  hypothetical protein  25.17 
 
 		 514 aa  45.8  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.84486  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3538  hypothetical protein  34.67 
 
 		 355 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0774  zinc carboxypeptidase-related protein  27.42 
 
 		 340 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0312  hypothetical protein  24.22 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4525  zinc carboxypeptidase-related protein  25.76 
 
 		 344 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.988976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  28 
 
 		 889 aa  44.3  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2645  hypothetical protein  39.44 
 
 		 259 aa  43.5  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.15753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3019  zinc carboxypeptidase-related protein  24 
 
 		 340 aa  43.5  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.266904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5008  deacylase-like protein  24.41 
 
 		 293 aa  43.5  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.2 
 
 		 406 aa  42.4  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000158618  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0051  putative carboxypeptidase  26.97 
 
 		 365 aa  42.4  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.203157 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>