More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1121 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  313  5e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  57.53 
 
 		 153 aa  175  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  51.33 
 
 		 153 aa  170  5.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  50.34 
 
 		 152 aa  167  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  50.34 
 
 		 152 aa  167  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  48.67 
 
 		 151 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  48.67 
 
 		 151 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  48 
 
 		 151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  51.72 
 
 		 153 aa  161  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  48 
 
 		 151 aa  160  7e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  48 
 
 		 151 aa  160  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  49.33 
 
 		 165 aa  160  7e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  48 
 
 		 151 aa  160  7e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  52.05 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  53.74 
 
 		 169 aa  157  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  51.68 
 
 		 165 aa  157  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  53.74 
 
 		 169 aa  157  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  52.38 
 
 		 152 aa  157  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  50 
 
 		 151 aa  157  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  53.06 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  48.67 
 
 		 151 aa  155  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  46.67 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  46.67 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  47.33 
 
 		 153 aa  155  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  49.33 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  46.67 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  46.67 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3563  hypothetical protein  47.33 
 
 		 151 aa  154  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.380474  hitchhiker  0.00000509959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  52.38 
 
 		 169 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  50.34 
 
 		 152 aa  153  7e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  49.66 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4492  hypothetical protein  51.02 
 
 		 158 aa  151  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126815  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  50.34 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3391  hypothetical protein  46 
 
 		 172 aa  152  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000810372  hitchhiker  0.000625033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  51.03 
 
 		 145 aa  152  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  49.66 
 
 		 152 aa  150  5e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  44 
 
 		 151 aa  150  8e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0723  protein of unknown function DUF150  49.66 
 
 		 151 aa  148  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  46.98 
 
 		 151 aa  147  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  48.98 
 
 		 173 aa  147  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  46.98 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  46.31 
 
 		 151 aa  143  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  45.64 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  47.33 
 
 		 154 aa  140  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  46.67 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  46.67 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  46.67 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  47.33 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  47.33 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  47.33 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  47.33 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  45.07 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  47.33 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  47.33 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  47.33 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  44.3 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  47.33 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  45.33 
 
 		 150 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  45.33 
 
 		 150 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  45.33 
 
 		 150 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  45.33 
 
 		 154 aa  137  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  45.33 
 
 		 154 aa  137  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  46.67 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  46 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  47.89 
 
 		 140 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  45.58 
 
 		 176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  41.72 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  47.18 
 
 		 140 aa  131  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  36.84 
 
 		 153 aa  130  5e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  44.67 
 
 		 191 aa  130  9e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  41.1 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  36.18 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  45.07 
 
 		 140 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1469  protein of unknown function DUF150  42.28 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000542376  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2817  hypothetical protein  44.74 
 
 		 196 aa  124  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  42.96 
 
 		 161 aa  123  9e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  42 
 
 		 152 aa  122  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  45.6 
 
 		 206 aa  120  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0155  hypothetical protein  39.02 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  43.45 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  42.25 
 
 		 151 aa  118  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  41.51 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0498  protein of unknown function DUF150  36.49 
 
 		 157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01301  hypothetical protein  44.6 
 
 		 176 aa  113  7.999999999999999e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3560  hypothetical protein  37.41 
 
 		 196 aa  113  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1099  hypothetical protein  39.22 
 
 		 171 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0072  hypothetical protein  37.01 
 
 		 166 aa  112  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.301721 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1159  protein of unknown function DUF150  39.22 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.710629  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0177  hypothetical protein  40.52 
 
 		 199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.020604  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2411  protein of unknown function DUF150  38.62 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0573  protein of unknown function DUF150  40.29 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.300735  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1227  protein of unknown function DUF150  39.22 
 
 		 171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0067  hypothetical protein  36.36 
 
 		 166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0201  hypothetical protein  39.87 
 
 		 215 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0967046  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1944  hypothetical protein  39.01 
 
 		 154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1662  hypothetical protein  38.3 
 
 		 154 aa  110  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  38.89 
 
 		 203 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1226  hypothetical protein  38.73 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00744714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3160  hypothetical protein  38.35 
 
 		 173 aa  107  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000242539  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0041  hypothetical protein  35.38 
 
 		 194 aa  107  8.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>