More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1383 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  100 
 
 
318 aa  623  1e-177  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2843  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  78.05 
 
 
288 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.089583  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2980  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  73.17 
 
 
304 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000460304  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0114  ATPase  68.53 
 
 
314 aa  385  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4954  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  70.86 
 
 
305 aa  372  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13080  MoxR-like ATPase  66.67 
 
 
316 aa  355  7.999999999999999e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2377  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  64.21 
 
 
305 aa  350  1e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160487  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3975  ATPase  63.44 
 
 
294 aa  345  5e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212397  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6198  ATPase  66.28 
 
 
292 aa  343  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0346062  normal  0.0544047 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1524  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  57.82 
 
 
299 aa  337  9.999999999999999e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.711967 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4313  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  66.67 
 
 
296 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322215  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2699  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  58.65 
 
 
314 aa  332  4e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5445  ATPase  60.14 
 
 
300 aa  330  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1752  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  59.35 
 
 
300 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27049  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2452  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  57.86 
 
 
302 aa  326  3e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2605  ATPase  58.21 
 
 
303 aa  322  4e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2166  ATPase  56.99 
 
 
296 aa  322  6e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1931  AAA family ATPase  60.84 
 
 
304 aa  321  9.000000000000001e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1485  ATPase  56.93 
 
 
309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809119  normal  0.0145294 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4324  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  58.58 
 
 
300 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.294108  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1290  ATPase  56.93 
 
 
309 aa  318  7.999999999999999e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0290732  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0327  ATPase  58.99 
 
 
304 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0239  ATPase  60.58 
 
 
291 aa  317  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2959  ATPase  56.16 
 
 
303 aa  316  3e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937893  hitchhiker  0.00986895 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0582  ATPase  60.15 
 
 
304 aa  316  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407257  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1633  ATPase  56.84 
 
 
302 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1770  ATPase  55.83 
 
 
304 aa  315  6e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5316  ATPase  56.67 
 
 
302 aa  315  7e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.397847 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1142  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.57 
 
 
300 aa  315  9e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3676  ATPase  56.88 
 
 
302 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4108  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  60.42 
 
 
294 aa  313  1.9999999999999998e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466442  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1758  AAA_5 ATPase  57.84 
 
 
301 aa  312  4.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088309  normal  0.628591 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1784  ATPase  57.09 
 
 
302 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  0.377483 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2356  hypothetical protein  57.5 
 
 
303 aa  311  7.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.952971 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3030  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  61.45 
 
 
308 aa  310  1e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0632  ATPase  62.55 
 
 
280 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0968  ATPase  56.64 
 
 
314 aa  309  4e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1452  ATPase  57.35 
 
 
296 aa  308  5.9999999999999995e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2203  AAA ATPase  54.23 
 
 
314 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.55218  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0471  ATPase  57.2 
 
 
300 aa  296  5e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.129382  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0367  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.26 
 
 
295 aa  291  9e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.473428  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0092  ATPase  56.88 
 
 
296 aa  291  9e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919057  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1466  hypothetical protein  53.98 
 
 
301 aa  289  4e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4354  putative ATPase  56.82 
 
 
295 aa  289  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2251  ATPase  54.24 
 
 
312 aa  289  4e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1415  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.48 
 
 
298 aa  287  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.144398 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4537  ATPase  53.79 
 
 
305 aa  288  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1351  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.48 
 
 
298 aa  287  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal  0.107862 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2036  ATPase  53.82 
 
 
307 aa  286  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0580414  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0422  ATPase  55.02 
 
 
305 aa  286  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0381294  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.47 
 
 
328 aa  285  7e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0362  ATPase  54.81 
 
 
298 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10375  oxidoreductase  51.96 
 
 
298 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136286  normal  0.912822 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1375  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.21 
 
 
298 aa  282  4.0000000000000003e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.842047  normal  0.382396 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0575  ATPase  50 
 
 
328 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5289  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.91 
 
 
298 aa  279  5e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2094  AAA_5 ATPase  55.11 
 
 
291 aa  278  9e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0212  ATPase  56.04 
 
 
288 aa  275  6e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0759  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.33 
 
 
323 aa  275  9e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.355314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4807  ATPase  52.82 
 
 
293 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1567  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.13 
 
 
322 aa  271  1e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.24742  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4712  AAA ATPase central domain protein  51.16 
 
 
324 aa  270  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0992582  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3567  ATPase  47.37 
 
 
316 aa  267  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.110663  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1565  ATPase  52.52 
 
 
293 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2768  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.77 
 
 
297 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0806  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.33 
 
 
319 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.243298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7758  ATPase  55.11 
 
 
283 aa  264  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1750  carbon monoxide dehydrogenase, coxD accessory protein  53.96 
 
 
299 aa  263  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.655706 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1229  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  50.75 
 
 
297 aa  262  6e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0033  putative ATPase  50.36 
 
 
297 aa  262  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.273348 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1604  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.15 
 
 
295 aa  262  6.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.084581  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2148  putative MoxR-like ATPase, CoxD  49.64 
 
 
297 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0344546  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0654  ATPase  49.82 
 
 
326 aa  258  6e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3933  ATPase  51.08 
 
 
294 aa  256  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0536  ATPase  49.1 
 
 
326 aa  256  4e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.996373  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0046  ATPase  47.37 
 
 
310 aa  256  4e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3537  ATPase  50.36 
 
 
295 aa  255  6e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3610  ATPase  50.36 
 
 
295 aa  255  6e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0405029  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3542  ATPase  49.82 
 
 
295 aa  255  7e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5255  ATPase  49.47 
 
 
302 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2645  ATPase  50.72 
 
 
291 aa  253  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2708  ATPase associated with various cellular activities, AAA-5  49.82 
 
 
306 aa  252  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.867096  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1955  ATPase  49.45 
 
 
315 aa  252  6e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2702  ATPase  48.4 
 
 
334 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0929755  normal  0.507457 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1213  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.45 
 
 
302 aa  250  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0634227  normal  0.99414 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12454  hypothetical protein  48.91 
 
 
291 aa  248  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.446115 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0102  ATPase  45.83 
 
 
311 aa  246  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1584  ATPase  46.72 
 
 
284 aa  246  4e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000201568  normal  0.651039 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2801  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.12 
 
 
306 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2894  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.76 
 
 
306 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2179  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.18 
 
 
291 aa  243  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000102447  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0825  ATPase  49.23 
 
 
300 aa  243  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00233341  normal  0.15397 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3196  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.81 
 
 
307 aa  243  3.9999999999999997e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.21 
 
 
321 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577187  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0558  AAA ATPase  45.58 
 
 
333 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.847744  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2810  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.35 
 
 
299 aa  238  8e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366113  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2182  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.18 
 
 
291 aa  238  1e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0291  ATPase  49.25 
 
 
299 aa  236  4e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0778  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.35 
 
 
413 aa  235  6e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4082  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.08 
 
 
294 aa  235  9e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.418511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>