141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2759 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_2759  acetyltransferase  100 
 
 
157 aa  319  8e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3514  acetyltransferase  41.29 
 
 
156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.191622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1357  GCN5-related N-acetyltransferase  36.13 
 
 
163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1387  GCN5-related N-acetyltransferase  35.26 
 
 
164 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678698  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1855  acetyltransferase  40.91 
 
 
164 aa  101  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00212517 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0963  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
160 aa  100  7e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
158 aa  90.9  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35373  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2666  GCN5-related N-acetyltransferase  31.52 
 
 
170 aa  84.7  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0312822  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0969  GCN5-related N-acetyltransferase  32.9 
 
 
156 aa  84.3  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1060  GCN5-related N-acetyltransferase  35.48 
 
 
161 aa  83.6  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271668  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3500  acetyltransferase  33.99 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.867974  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3495  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000137557  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.313385  normal  0.750925 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1914  GCN5-related N-acetyltransferase  32.03 
 
 
167 aa  79  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  32.68 
 
 
166 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1299  GCN5-related N-acetyltransferase  28.81 
 
 
180 aa  77  0.00000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1364  GCN5-related N-acetyltransferase  34.21 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139138 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3757  acetyltransferase  29.8 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000162031  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3157  GCN5-related N-acetyltransferase  34.21 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1538  GCN5-related N-acetyltransferase  30.12 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3372  GCN5-related N-acetyltransferase  32.03 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0851191  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2999  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3014  GCN5-related N-acetyltransferase  34.21 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3828  acetyltransferase, gnat family  29.8 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00017711  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0040  acetyltransferase  30.13 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2371  hypothetical protein  33.96 
 
 
320 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.896111  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1363  GCN5-related N-acetyltransferase  29.94 
 
 
169 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.933433  hitchhiker  0.000190742 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003587  acetyltransferase GNAT family  30.26 
 
 
155 aa  73.6  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02546  hypothetical protein  30.57 
 
 
159 aa  73.6  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3158  GCN5-related N-acetyltransferase  30.12 
 
 
203 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1218  acetyltransferase  29.34 
 
 
173 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.148458  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3000  GCN5-related N-acetyltransferase  29.94 
 
 
173 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1831  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0803543  normal  0.0847083 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3323  acetyltransferase  34.21 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3015  GCN5-related N-acetyltransferase  29.94 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2718  acetyltransferase  29.3 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1289  acetyltransferase  29.17 
 
 
173 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.057634  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1298  GCN5-related N-acetyltransferase  29.52 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0142  GCN5-related N-acetyltransferase  28.29 
 
 
162 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000142721  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1219  acetyltransferase  28.14 
 
 
173 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.846102 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3474  acetyltransferase  28.48 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000407854  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2665  GCN5-related N-acetyltransferase  32.68 
 
 
177 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0357871  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1219  acetyltransferase  33.55 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0886873  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1290  acetyltransferase  32.89 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0542587  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1109  GCN5-related N-acetyltransferase  30.13 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1220  acetyltransferase  33.55 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.850535 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1230  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 
166 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814852  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3324  acetyltransferase  27.54 
 
 
203 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2088  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 
166 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3557  GCN5-related N-acetyltransferase  28.93 
 
 
154 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05473  putative acyltransferase protein  33.76 
 
 
155 aa  67  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0190305 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  27.98 
 
 
166 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3685  GCN5-related N-acetyltransferase  30.32 
 
 
173 aa  63.9  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1425  GCN5-related N-acetyltransferase  30.49 
 
 
181 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.167968 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1473  acetyltransferase  29.03 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000250439  hitchhiker  0.00000579727 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3209  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 
184 aa  61.2  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179345 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2811  acetyltransferase  33.99 
 
 
178 aa  61.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1489  GCN5-related N-acetyltransferase  28.76 
 
 
166 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.170228  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3814  GCN5-related N-acetyltransferase  29.27 
 
 
177 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104394 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1001  acetyltransferase  22.29 
 
 
159 aa  57.4  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.219128  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1031  GCN5-related N-acetyltransferase  31.52 
 
 
160 aa  57.4  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2799  GCN5-related N-acetyltransferase  25.32 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3561  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 
174 aa  55.1  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0136  GCN5-related N-acetyltransferase  29.87 
 
 
167 aa  54.7  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1874  GCN5-related N-acetyltransferase  27.45 
 
 
166 aa  54.3  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545017  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0451  acetyltransferase  30.13 
 
 
156 aa  53.9  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.896782  normal  0.723991 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00229  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  29.41 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00232  hypothetical protein  29.41 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10761  GCN5-related N-acetyltransferase  22.15 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0414062  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0279  hypothetical protein  29.49 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10761  GCN5-related N-acetyltransferase  22.58 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.397538  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1433  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0288  hypothetical protein  30.52 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.867365  normal  0.217589 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10731  GCN5-related N-acetyltransferase  20 
 
 
158 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0229  hypothetical protein  27.81 
 
 
150 aa  49.7  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0261  hypothetical protein  27.81 
 
 
150 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0266  hypothetical protein  27.81 
 
 
150 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2430  GCN5-related N-acetyltransferase  37.93 
 
 
145 aa  48.1  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.795815  normal  0.63662 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29921  GCN5-related N-acetyltransferase  25.97 
 
 
161 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.777494 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0887  acetyltransferase  26.92 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000133756 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0733  GCN5-related N-acetyltransferase  25.9 
 
 
169 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.881941  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0855  GNAT family acetyltransferase  33.33 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3185  GCN5-related N-acetyltransferase  29.25 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.082232  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3289  GCN5-related N-acetyltransferase  25.9 
 
 
170 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.827106  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2040  GCN5-related N-acetyltransferase  30.85 
 
 
161 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0436  GCN5-related N-acetyltransferase  29.08 
 
 
143 aa  45.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189459  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2410  acetyltransferase, GNAT family  30.85 
 
 
165 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7229  GCN5-related N-acetyltransferase  30.23 
 
 
184 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.291199 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2936  putative acyltransferase  35.16 
 
 
299 aa  44.7  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1774  hypothetical protein  34.69 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3801  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 
172 aa  44.7  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.54281  decreased coverage  0.000138892 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2386  GCN5-related N-acetyltransferase  29.37 
 
 
154 aa  43.9  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2629  GCN5-related N-acetyltransferase  32.74 
 
 
298 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.688065  normal  0.423362 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4025  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 
157 aa  43.9  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636183  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4514  hypothetical protein  34.09 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4590  hypothetical protein  34.09 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.992434  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1251  GCN5-related N-acetyltransferase  23.78 
 
 
185 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>