281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2561 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_2561  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
142 aa  293  8e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0826465  hitchhiker  0.00133765 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2573  4'-phosphopantetheinyl transferase  81.06 
 
 
137 aa  232  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0256708 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  81.68 
 
 
137 aa  230  5e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0306  4'-phosphopantetheinyl transferase  80.92 
 
 
137 aa  229  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0520  4'-phosphopantetheinyl transferase  81.4 
 
 
150 aa  221  3e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0198  4'-phosphopantetheinyl transferase  71.22 
 
 
139 aa  213  8e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0421  4'-phosphopantetheinyl transferase  68.79 
 
 
139 aa  192  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364619  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3872  4'-phosphopantetheinyl transferase  66.17 
 
 
133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798491  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0680  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.19 
 
 
139 aa  173  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1409  4'-phosphopantetheinyl transferase  63.85 
 
 
133 aa  171  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0910  4'-phosphopantetheinyl transferase  62.79 
 
 
135 aa  169  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.123899  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.78 
 
 
158 aa  165  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.33 
 
 
136 aa  165  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.58 
 
 
136 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.58 
 
 
136 aa  164  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.14 
 
 
134 aa  163  5.9999999999999996e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.14 
 
 
134 aa  163  5.9999999999999996e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0948  holo-acyl-carrier-protein synthase  58.91 
 
 
133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0996  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.96 
 
 
134 aa  161  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638191  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  56.82 
 
 
142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1149  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.96 
 
 
134 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1734  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.36 
 
 
133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2872  holo-acyl-carrier-protein synthase  65.25 
 
 
133 aa  159  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0141678 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2443  holo-acyl-carrier-protein synthase  58.91 
 
 
140 aa  158  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1920  4'-phosphopantetheinyl transferase  60.15 
 
 
139 aa  157  4e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0993  holo-acyl-carrier-protein synthase  55.81 
 
 
145 aa  157  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0239531 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2970  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.4 
 
 
146 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4685  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.89 
 
 
139 aa  154  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1072  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2610  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.78 
 
 
141 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0757866  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7365  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.78 
 
 
132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2649  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.04 
 
 
139 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.045044  normal  0.0107297 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0471  4'-phosphopantetheinyl transferase  49.62 
 
 
133 aa  147  7e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2638  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.26 
 
 
139 aa  146  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3457  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.58 
 
 
136 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal  0.605589 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3879  4'-phosphopantetheinyl transferase  54.2 
 
 
135 aa  144  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0532  holo-acyl-carrier-protein synthase  53.44 
 
 
134 aa  142  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0694245  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6616  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.69 
 
 
135 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.495084  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0375  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.39 
 
 
136 aa  134  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457034  normal  0.658443 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2253  4'-phosphopantetheinyl transferase  55.22 
 
 
139 aa  134  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154355  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1249  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.86 
 
 
127 aa  100  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  43.41 
 
 
126 aa  100  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.54 
 
 
141 aa  97.8  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.69 
 
 
126 aa  96.3  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.46 
 
 
126 aa  95.1  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.09 
 
 
126 aa  93.2  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.62 
 
 
126 aa  91.3  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.41 
 
 
126 aa  90.1  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1406  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.15 
 
 
130 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.09 
 
 
126 aa  87.4  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
126 aa  85.5  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3057  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.56 
 
 
130 aa  85.9  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3050  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 
126 aa  84.7  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0986537  normal  0.022176 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1072  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.58 
 
 
126 aa  84.3  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.8 
 
 
126 aa  84.3  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.72 
 
 
126 aa  84  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.72 
 
 
126 aa  84  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 
126 aa  84  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.819519 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 
126 aa  84  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2820  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 
126 aa  84  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 
126 aa  84  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02457  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.62 
 
 
126 aa  84  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.62 
 
 
126 aa  84  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02421  hypothetical protein  40.62 
 
 
126 aa  84  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  40 
 
 
138 aa  84  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 
126 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1107  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.77 
 
 
122 aa  83.6  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.454224  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.84 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1876  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.09 
 
 
125 aa  83.2  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1200  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.59 
 
 
543 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174413  decreased coverage  0.00601757 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0278  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  37.01 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2781  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.06 
 
 
126 aa  82  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2928  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.06 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768725  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1753  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.82 
 
 
130 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2849  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.06 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.575353  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0594  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.96 
 
 
132 aa  81.3  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105656 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2716  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.06 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3631  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.58 
 
 
132 aa  80.9  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2615  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.35 
 
 
130 aa  80.9  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3262  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.35 
 
 
130 aa  80.9  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.033674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3799  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.06 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2718  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.06 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.94 
 
 
123 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.46 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0738  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  34.35 
 
 
127 aa  80.1  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0932  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.24 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0531027  normal  0.041098 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
125 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
125 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.94 
 
 
126 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0235  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.06 
 
 
118 aa  77  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.72 
 
 
129 aa  77  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  35.16 
 
 
125 aa  77  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0470  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.68 
 
 
131 aa  77  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1384  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.92 
 
 
130 aa  77  0.00000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.72 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1760  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.62 
 
 
125 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0376  4'-phosphopantetheinyl transferase  46.15 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0997  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.947514  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5257  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.8 
 
 
131 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.907319 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0250  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.4 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0218  holo-acyl-carrier-protein synthase  36 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.299586  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>