163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0398 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0398  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  345  2e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.904592 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2413  hypothetical protein  66.07 
 
 
168 aa  216  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0881  hypothetical protein  53.28 
 
 
141 aa  163  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569107  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0228  hypothetical protein  52.94 
 
 
139 aa  160  8.000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  58.7 
 
 
142 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0689  hypothetical protein  55.15 
 
 
140 aa  159  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.885793  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0431  hypothetical protein  57.72 
 
 
140 aa  156  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0111877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  54.07 
 
 
141 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  53.33 
 
 
141 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  52.55 
 
 
141 aa  151  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  52.55 
 
 
141 aa  151  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0474  hypothetical protein  62.5 
 
 
137 aa  148  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  51.45 
 
 
142 aa  142  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0702  hypothetical protein  57.38 
 
 
137 aa  141  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0603  hypothetical protein  54.84 
 
 
142 aa  140  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0112  hypothetical membrane spanning protein  55.28 
 
 
139 aa  140  9e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4570  hypothetical protein  54.03 
 
 
142 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2084  hypothetical protein  54.47 
 
 
139 aa  137  6e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0831  hypothetical protein  48.91 
 
 
141 aa  134  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08470  hypothetical protein  53.72 
 
 
140 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  54.55 
 
 
140 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5103  hypothetical protein  51.61 
 
 
142 aa  132  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.605175  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1258  hypothetical protein  60.15 
 
 
140 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2151  hypothetical protein  49.61 
 
 
144 aa  124  5e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1862  hypothetical protein  49.61 
 
 
144 aa  123  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.521367  normal  0.897697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3443  hypothetical protein  38.51 
 
 
182 aa  120  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3618  hypothetical protein  44.2 
 
 
148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3722  hypothetical protein  50.41 
 
 
136 aa  115  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0547  hypothetical protein  45.07 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1493  hypothetical protein  47.5 
 
 
140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2188  hypothetical protein  51.59 
 
 
144 aa  110  7.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.110489  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3301  hypothetical protein  45.31 
 
 
143 aa  110  9e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0835749  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1490  hypothetical protein  46.67 
 
 
140 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0427  hypothetical protein  39.86 
 
 
146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2765  hypothetical protein  35.43 
 
 
194 aa  108  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4297  hypothetical protein  41.01 
 
 
143 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.818431  normal  0.0309723 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0394  hypothetical protein  38.57 
 
 
146 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.776643  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0293  hypothetical protein  41.18 
 
 
143 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0299  hypothetical protein  37.86 
 
 
146 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4625  hypothetical protein  44.78 
 
 
148 aa  105  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1468  hypothetical protein  35.86 
 
 
187 aa  104  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200067  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2740  hypothetical protein  39.72 
 
 
140 aa  104  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1259  hypothetical protein  42.96 
 
 
148 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1496  hypothetical protein  39.29 
 
 
146 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3754  hypothetical protein  38.46 
 
 
184 aa  102  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182605  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2569  hypothetical protein  40 
 
 
140 aa  101  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.83321 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01598  hypothetical protein  40.15 
 
 
142 aa  101  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2979  hypothetical protein  40 
 
 
140 aa  101  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0625  hypothetical protein  42.11 
 
 
140 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1040  hypothetical protein  39.13 
 
 
141 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  39.29 
 
 
143 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0938  hypothetical protein  36.81 
 
 
183 aa  100  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0411  hypothetical protein  39.44 
 
 
150 aa  99.4  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2830  hypothetical protein  45.16 
 
 
140 aa  99.8  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179032  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0579  hypothetical protein  42.11 
 
 
140 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0175  hypothetical protein  41.35 
 
 
140 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0658  hypothetical protein  41.35 
 
 
140 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431582  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1594  hypothetical protein  39.44 
 
 
150 aa  99.4  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2969  hypothetical protein  45.97 
 
 
140 aa  99  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1825  hypothetical protein  39.13 
 
 
144 aa  98.6  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0349545 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2584  hypothetical protein  40 
 
 
140 aa  98.6  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681885  hitchhiker  0.00000000000477128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1925  hypothetical protein  44.8 
 
 
149 aa  97.8  7e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.975462  normal  0.614491 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3744  hypothetical protein  40.6 
 
 
140 aa  97.4  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3376  hypothetical protein  40.6 
 
 
138 aa  97.4  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0317356  hitchhiker  0.000000000730541 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03675  hypothetical protein  38.2 
 
 
182 aa  97.4  9e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14931  hypothetical protein  40.44 
 
 
195 aa  97.4  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1774  hypothetical protein  38.13 
 
 
146 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.151606  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0849  hypothetical protein  36.64 
 
 
203 aa  96.7  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0214356 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1495  hypothetical protein  38.13 
 
 
146 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0553  hypothetical protein  39.85 
 
 
140 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0385  hypothetical protein  38.73 
 
 
150 aa  97.1  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2728  hypothetical protein  38.97 
 
 
140 aa  97.1  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4259  hypothetical protein  39.71 
 
 
178 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0104  hypothetical protein  38.17 
 
 
187 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.805138  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0646  hypothetical protein  42.86 
 
 
142 aa  96.3  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.191935  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0107  hypothetical protein  38.17 
 
 
187 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0246  hypothetical protein  40.85 
 
 
144 aa  95.9  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.163595  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0580  hypothetical protein  39.85 
 
 
138 aa  95.5  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08831  hypothetical protein  35.96 
 
 
186 aa  95.5  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.152227  hitchhiker  0.0000304653 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0478  hypothetical protein  36.57 
 
 
195 aa  95.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.594708 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1270  hypothetical protein  38.85 
 
 
141 aa  95.1  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1565  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0093 domain protein)  36.3 
 
 
149 aa  94  8e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4270  hypothetical protein  37.4 
 
 
197 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2533  hypothetical protein  39.01 
 
 
141 aa  92.8  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3933  hypothetical protein  41.6 
 
 
178 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2425  transmembrane protein  43.8 
 
 
137 aa  92  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0258  hypothetical protein  38.85 
 
 
141 aa  92  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3804  hypothetical protein  44.09 
 
 
142 aa  90.9  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000216317  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09781  hypothetical protein  39.47 
 
 
188 aa  90.9  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.711198  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0162  hypothetical protein  38.85 
 
 
140 aa  90.9  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0779497  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3572  hypothetical protein  36.99 
 
 
175 aa  90.1  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0349  hypothetical protein  39.26 
 
 
136 aa  89.4  2e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0384  hypothetical protein  35.86 
 
 
186 aa  89.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0211901 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09801  hypothetical protein  39.47 
 
 
188 aa  89.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0391  hypothetical protein  36.23 
 
 
140 aa  89  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0919  hypothetical protein  38.6 
 
 
188 aa  89  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.113823  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0855  hypothetical protein  39.29 
 
 
178 aa  88.2  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275391  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0101  hypothetical protein  38.69 
 
 
140 aa  88.2  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.761518  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4233  hypothetical protein  40.85 
 
 
146 aa  87.8  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.225935 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1985  hypothetical protein  37.86 
 
 
178 aa  87.4  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>