252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0037 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0037  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
210 aa  433  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.763782 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0092  DSBA oxidoreductase  45.95 
 
 
216 aa  190  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  39.69 
 
 
206 aa  169  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3118  DSBA oxidoreductase  39.3 
 
 
210 aa  160  9e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbA  37.13 
 
 
216 aa  158  6e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405724  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0551  DSBA oxidoreductase  35.79 
 
 
220 aa  157  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  36.32 
 
 
211 aa  147  1e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3568  DSBA oxidoreductase  36.56 
 
 
212 aa  147  1e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47204  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  34.62 
 
 
211 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  32.38 
 
 
211 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01990  Thiol:disulfide interchange protein DsbA  34.12 
 
 
214 aa  136  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  33.81 
 
 
210 aa  135  6e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  33.81 
 
 
210 aa  134  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0575  DSBA oxidoreductase  32.41 
 
 
223 aa  133  2e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484961  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
210 aa  133  2e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0158  DSBA oxidoreductase  32.34 
 
 
216 aa  132  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.699641  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2116  DSBA oxidoreductase  32.37 
 
 
213 aa  130  2e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0341  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.92 
 
 
214 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  31.4 
 
 
214 aa  128  5e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3405  DSBA oxidoreductase  38.24 
 
 
275 aa  128  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2784  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.43 
 
 
216 aa  128  8e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.957137  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0383  DSBA oxidoreductase  30.56 
 
 
212 aa  127  1e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.290436 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0052  DSBA oxidoreductase  30.48 
 
 
213 aa  127  1e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0353  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.11 
 
 
212 aa  126  2e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0416  DSBA oxidoreductase  31.18 
 
 
218 aa  126  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.681014  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2289  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.11 
 
 
212 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1999  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.11 
 
 
212 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684259  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0428  Thiol:disulfide interchange protein dsbA precursor  31.11 
 
 
212 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2921  DSBA oxidoreductase  30 
 
 
212 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0590  thiol:disulfide interchange protein  31.11 
 
 
212 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0086  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.11 
 
 
212 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3097  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.11 
 
 
212 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2936  DSBA oxidoreductase  30 
 
 
212 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0408  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.11 
 
 
212 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358147  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0129  DSBA oxidoreductase  31.84 
 
 
206 aa  125  5e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0050  DSBA oxidoreductase  30.99 
 
 
207 aa  125  6e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0556342  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6264  DSBA oxidoreductase  29.44 
 
 
212 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2833  DSBA oxidoreductase  29.28 
 
 
213 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.483213 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2970  DSBA oxidoreductase  29.28 
 
 
213 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0345  DSBA oxidoreductase  29.44 
 
 
216 aa  124  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0120  hypothetical protein  31.84 
 
 
206 aa  124  7e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0780  thiol:disulfide interchange protein  37.23 
 
 
260 aa  124  7e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0334  DSBA oxidoreductase  29.44 
 
 
216 aa  124  7e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.227367  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2307  DSBA oxidoreductase  29.44 
 
 
212 aa  124  8e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0693  DSBA oxidoreductase  37.23 
 
 
260 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.33027  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2454  DSBA oxidoreductase  30.81 
 
 
215 aa  122  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2675  DSBA oxidoreductase  34.54 
 
 
211 aa  122  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0463  DSBA oxidoreductase  32.24 
 
 
215 aa  122  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0780144  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3703  DSBA oxidoreductase  31.05 
 
 
220 aa  122  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal  0.783834 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0151  thiol:disulfide interchange protein  32.09 
 
 
214 aa  121  7e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.517517  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1975  DSBA oxidoreductase  32.49 
 
 
215 aa  121  7e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4488  DSBA oxidoreductase  29.82 
 
 
220 aa  120  1e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0098  DSBA oxidoreductase  31.49 
 
 
212 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0775  DSBA oxidoreductase  35.37 
 
 
224 aa  119  5e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0129  DSBA oxidoreductase  28.92 
 
 
211 aa  118  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266261  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04434  thiol:disulfide interchange protein  38.24 
 
 
271 aa  115  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0671  DSBA oxidoreductase  30.84 
 
 
216 aa  115  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0077  hypothetical protein  32.8 
 
 
293 aa  114  7e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.453985  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2167  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 
233 aa  114  1e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4228  DSBA oxidoreductase  30.73 
 
 
221 aa  113  2e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210811 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0722  DSBA oxidoreductase  36.52 
 
 
208 aa  113  2e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0143  DSBA oxidoreductase  30.56 
 
 
218 aa  110  1e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1364  DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 
214 aa  110  2e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0435  DSBA oxidoreductase  30.48 
 
 
218 aa  109  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0135  DSBA oxidoreductase  30.05 
 
 
218 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1684  DSBA oxidoreductase  31 
 
 
215 aa  106  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0471  DSBA oxidoreductase  25.89 
 
 
212 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2850  DSBA oxidoreductase  29.61 
 
 
211 aa  104  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302061  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3404  DSBA oxidoreductase  31.35 
 
 
216 aa  104  9e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.766013  normal  0.487769 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0186  DSBA oxidoreductase  26.52 
 
 
212 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4247  putative thiol-disulfide interchange protein  26.52 
 
 
212 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.203216 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0285  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  28.77 
 
 
218 aa  99.8  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3864  twin-arginine translocation pathway signal  31.16 
 
 
218 aa  99.4  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.387076  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1512  DSBA oxidoreductase  28.14 
 
 
207 aa  98.2  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00919562 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  28.14 
 
 
207 aa  97.8  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2860  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  27.36 
 
 
207 aa  96.3  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04433  disulfide oxidoreductase  30.49 
 
 
216 aa  94.7  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1573  DSBA oxidoreductase  27.64 
 
 
217 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.64919e-09 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0779  thiol:disulfide interchange protein  29.94 
 
 
215 aa  88.6  7e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0557  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.45 
 
 
213 aa  87.4  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0137  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  22.39 
 
 
204 aa  87  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1709  DSBA oxidoreductase  25.63 
 
 
206 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.28483e-07 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2640  DSBA oxidoreductase  25.63 
 
 
206 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0692  DSBA oxidoreductase  29.34 
 
 
215 aa  85.9  4e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.487009  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0122  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  22.39 
 
 
204 aa  85.9  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25 
 
 
202 aa  83.2  2e-15  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2754  DSBA oxidoreductase  25.13 
 
 
206 aa  83.6  2e-15  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2675  DSBA oxidoreductase  25.13 
 
 
206 aa  83.6  2e-15  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26469  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0524  DSBA oxidoreductase  29.21 
 
 
201 aa  82.4  4e-15  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.716965 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2842  DSBA oxidoreductase  27.17 
 
 
208 aa  80.1  2e-14  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  1.81204e-05 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  25.82 
 
 
205 aa  79.3  3e-14  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0898  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  26.67 
 
 
225 aa  78.6  7e-14  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0333  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.13 
 
 
202 aa  77.4  1e-13  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.34 
 
 
204 aa  77.8  1e-13  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  23.5 
 
 
207 aa  76.6  2e-13  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2360  DSBA oxidoreductase  23.59 
 
 
207 aa  75.9  4e-13  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  24.74 
 
 
202 aa  75.9  4e-13  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  24.6 
 
 
203 aa  73.9  1e-12  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  25 
 
 
203 aa  73.9  2e-12  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1742  DsbA oxidoreductase  26.83 
 
 
210 aa  73.9  2e-12  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0147318  hitchhiker  1.64323e-05 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>