More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0629 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0629  chaperone protein DnaJ  100 
 
 
393 aa  803    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  48.09 
 
 
377 aa  332  6e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0129  chaperone protein DnaJ  44.84 
 
 
372 aa  332  8e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3390  chaperone protein DnaJ  46.49 
 
 
375 aa  331  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0009  chaperone protein DnaJ  46.83 
 
 
376 aa  328  8e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0447538  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  47.88 
 
 
376 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0211  chaperone protein DnaJ  44.44 
 
 
385 aa  327  2.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1082  chaperone protein DnaJ  49.18 
 
 
369 aa  327  3e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248799  normal  0.102661 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3573  chaperone protein DnaJ  47.7 
 
 
385 aa  325  1e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.856531  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  48.48 
 
 
389 aa  324  2e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1988  chaperone protein DnaJ  48.6 
 
 
379 aa  324  2e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.731806  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1195  chaperone protein DnaJ  47.67 
 
 
373 aa  324  2e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  46.63 
 
 
381 aa  322  7e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  48.32 
 
 
374 aa  322  9.999999999999999e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  47.78 
 
 
379 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  47.78 
 
 
379 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  45.55 
 
 
380 aa  320  3e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  47.78 
 
 
379 aa  320  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  45.68 
 
 
376 aa  320  3e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2577  chaperone protein DnaJ  47.22 
 
 
385 aa  319  5e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00027839 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  45.4 
 
 
376 aa  319  6e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  46.11 
 
 
379 aa  319  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  46.11 
 
 
379 aa  319  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  45.4 
 
 
376 aa  319  6e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  46.11 
 
 
379 aa  319  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  46.11 
 
 
379 aa  319  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  46.11 
 
 
379 aa  319  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  46.65 
 
 
375 aa  319  7e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  45.4 
 
 
376 aa  318  7.999999999999999e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  45.4 
 
 
376 aa  318  9e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  45.4 
 
 
376 aa  318  9e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  45.4 
 
 
376 aa  318  9e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  45.4 
 
 
376 aa  318  9e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  46.74 
 
 
375 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0025  chaperone protein DnaJ  48.37 
 
 
380 aa  318  1e-85  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  45.13 
 
 
376 aa  317  2e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2956  chaperone protein DnaJ  43.77 
 
 
382 aa  317  2e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  47.9 
 
 
379 aa  317  2e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  47.9 
 
 
379 aa  317  2e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0005  chaperone protein DnaJ  48.1 
 
 
382 aa  317  2e-85  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  46.93 
 
 
378 aa  317  2e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  46.65 
 
 
378 aa  317  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0680  chaperone protein DnaJ  45.28 
 
 
374 aa  317  3e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  42.97 
 
 
381 aa  316  4e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4415  chaperone protein DnaJ  45.92 
 
 
375 aa  316  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340124  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0308  chaperone protein DnaJ  44.8 
 
 
380 aa  315  8e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4095  chaperone protein DnaJ  45.01 
 
 
376 aa  315  8e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2834  chaperone protein DnaJ  44.09 
 
 
382 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2784  chaperone protein DnaJ  46.52 
 
 
379 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0106  chaperone protein DnaJ  46.9 
 
 
373 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  46.37 
 
 
375 aa  313  2.9999999999999996e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1756  chaperone protein DnaJ  46.34 
 
 
384 aa  313  2.9999999999999996e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.426165  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4463  chaperone protein DnaJ  45.04 
 
 
374 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1172  chaperone protein DnaJ  43.82 
 
 
382 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4727  chaperone protein DnaJ  47.28 
 
 
374 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4482  chaperone protein DnaJ  44.77 
 
 
374 aa  312  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0973  chaperone protein DnaJ  47.21 
 
 
377 aa  312  5.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  44.57 
 
 
382 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1492  chaperone protein DnaJ  43.84 
 
 
365 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0235261  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  47.01 
 
 
374 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0706  chaperone protein DnaJ  47.28 
 
 
374 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421383  hitchhiker  0.00995799 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0009  chaperone protein DnaJ  44.29 
 
 
385 aa  311  1e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111301  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1539  molecular chaperone protein DnaJ  46.42 
 
 
372 aa  311  2e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0617832  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  45.4 
 
 
377 aa  310  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3570  chaperone protein DnaJ  44.26 
 
 
383 aa  311  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  46.96 
 
 
380 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3573  chaperone protein DnaJ  45.99 
 
 
374 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4327  chaperone DnaJ  45.04 
 
 
371 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0104761  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  45.4 
 
 
377 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1899  chaperone protein DnaJ  48.04 
 
 
383 aa  310  2.9999999999999997e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.61643  normal  0.626034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0764  chaperone protein DnaJ  45.83 
 
 
397 aa  309  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252459  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3504  chaperone protein DnaJ  45.99 
 
 
374 aa  310  4e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000140999  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2303  chaperone protein DnaJ  44.77 
 
 
384 aa  309  4e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0682598  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3187  chaperone protein DnaJ  44.2 
 
 
385 aa  309  4e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.117357 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3531  chaperone protein DnaJ  45.7 
 
 
372 aa  309  5e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053078  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2961  chaperone protein DnaJ  44.2 
 
 
385 aa  309  5e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.271615 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0352  chaperone protein DnaJ  43.02 
 
 
379 aa  309  5.9999999999999995e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0192  chaperone protein DnaJ  42.16 
 
 
375 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0040  chaperone protein DnaJ  47.86 
 
 
372 aa  308  1.0000000000000001e-82  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  43.97 
 
 
382 aa  308  1.0000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6271  chaperone protein DnaJ  44.44 
 
 
387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3143  chaperone protein DnaJ  44.17 
 
 
383 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3242  chaperone DnaJ  45.38 
 
 
378 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  46.63 
 
 
386 aa  306  3e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1327  chaperone protein DnaJ  42.39 
 
 
381 aa  306  3e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.869234  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  44.59 
 
 
377 aa  307  3e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  44.33 
 
 
372 aa  306  4.0000000000000004e-82  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  46.09 
 
 
377 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2970  chaperone protein DnaJ  47.14 
 
 
376 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  45.21 
 
 
370 aa  306  6e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3623  chaperone protein DnaJ  45.92 
 
 
375 aa  305  7e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0978  chaperone protein DnaJ  46.26 
 
 
381 aa  305  9.000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352568  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0789  chaperone protein DnaJ  43.63 
 
 
377 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1127  chaperone protein DnaJ  47.41 
 
 
378 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  45.65 
 
 
382 aa  304  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0441  chaperone protein DnaJ  44.24 
 
 
378 aa  304  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000821274  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3361  chaperone protein DnaJ  45.63 
 
 
374 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151638  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5232  chaperone protein DnaJ  46.7 
 
 
380 aa  304  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  43.48 
 
 
373 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0960  chaperone protein DnaJ  47.41 
 
 
377 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0112522  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>