20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12568 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12568  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  249  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.724019  normal  0.141761 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11426  hypothetical protein  42.4 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3127099999999998e-21  normal  0.106237 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2343  PilT domain-containing protein  39.52 
 
 
133 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.487913  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2498  PilT protein domain protein  38.21 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1321  PIN domain protein  35.38 
 
 
130 aa  67  0.00000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.282385  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1380  PilT domain-containing protein  35.38 
 
 
128 aa  67  0.00000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.978498  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5766  PilT protein domain protein  34.4 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.300152  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3135  PilT domain-containing protein  30.83 
 
 
129 aa  53.9  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0599  PilT domain-containing protein  30.83 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0505  PilT protein domain protein  32.81 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0420  PilT protein domain protein  29.84 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4609  hypothetical protein  30.58 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.437369 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3585  PilT protein domain protein  30.51 
 
 
129 aa  45.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0397  PilT protein-like  27.43 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0414  PilT protein domain protein  26.02 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0681  hypothetical protein  28.81 
 
 
127 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000394475  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3865  PilT domain-containing protein  28.35 
 
 
126 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.870941  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4104  PilT protein-like  31.09 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393493  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0012  PilT protein domain-containing protein  45.76 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.948131 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2987  PilT protein domain protein  39.39 
 
 
137 aa  40.4  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>