More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1794 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1794  succinyldiaminopimelate transaminase  100 
 
 		 392 aa  797    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.455812  decreased coverage  0.0036927 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0911  class I/II aminotransferase  64.99 
 
 		 400 aa  533  1e-150  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.638659  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0159  succinyldiaminopimelate transaminase  64.86 
 
 		 407 aa  528  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.899498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3869  succinyldiaminopimelate transaminase  64.27 
 
 		 392 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3918  succinyldiaminopimelate transaminase  64.01 
 
 		 392 aa  522  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000686397  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5101  succinyldiaminopimelate transaminase  65.8 
 
 		 390 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.26447 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2142  succinyldiaminopimelate transaminase  63.31 
 
 		 388 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0944  succinyldiaminopimelate transaminase  61.28 
 
 		 390 aa  503  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.989177  normal  0.168301 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  43.64 
 
 		 388 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  43.08 
 
 		 385 aa  340  2e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3010  aminotransferase class I and II  46.51 
 
 		 388 aa  337  2.9999999999999997e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0774933 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  39.69 
 
 		 389 aa  332  1e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  39.69 
 
 		 382 aa  331  2e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  40.53 
 
 		 382 aa  329  4e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  40.36 
 
 		 388 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  39.47 
 
 		 382 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  40.05 
 
 		 384 aa  327  3e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  38.9 
 
 		 385 aa  326  5e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1282  aminotransferase class I and II  41.05 
 
 		 409 aa  323  3e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  38.3 
 
 		 392 aa  323  3e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0168  aminotransferase class I and II  38.22 
 
 		 403 aa  323  5e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.391722  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  43.04 
 
 		 391 aa  322  6e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  42.38 
 
 		 391 aa  322  7e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0218  aspartate aminotransferase  38.11 
 
 		 401 aa  321  1.9999999999999998e-86  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  39.64 
 
 		 390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.01 
 
 		 389 aa  319  3.9999999999999996e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2411  aminotransferase  41.65 
 
 		 413 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.306249  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0292  aminotransferase class I and II  39.43 
 
 		 391 aa  318  7e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1219  aminotransferase, class I and II  38.96 
 
 		 395 aa  319  7e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  39.64 
 
 		 388 aa  318  7.999999999999999e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2093  aminotransferase, class I and II  39.58 
 
 		 397 aa  318  1e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474721  normal  0.0303336 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.64 
 
 		 388 aa  318  1e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1267  aspartate aminotransferase  39.39 
 
 		 404 aa  317  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259449 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  41.45 
 
 		 390 aa  317  2e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1438  aminotransferase class I and II  41.84 
 
 		 399 aa  316  4e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0371887  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.74 
 
 		 389 aa  316  5e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  40.31 
 
 		 400 aa  316  6e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1308  aspartate aminotransferase  38.72 
 
 		 400 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.698251  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2455  aminotransferase  40.36 
 
 		 393 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1106  aspartate aminotransferase  38.46 
 
 		 411 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.584654 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5431  aminotransferase  40.11 
 
 		 411 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1252  aminotransferase  39.39 
 
 		 396 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000164192  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2730  aminotransferase  39.03 
 
 		 394 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62400  aminotransferase  39.43 
 
 		 411 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1145  aspartate aminotransferase  39.53 
 
 		 402 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0864  aminotransferase  39.69 
 
 		 402 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.565347  normal  0.675575 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0632  aminotransferase class I and II  39.85 
 
 		 393 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0472  aminotransferase, class I/II  39.85 
 
 		 393 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2505  aminotransferase  41.18 
 
 		 407 aa  312  4.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.784571  normal  0.124527 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1263  aspartate aminotransferase  37.69 
 
 		 425 aa  312  7.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1027  aspartate aminotransferase  37.95 
 
 		 400 aa  311  1e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000262896  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0506  aminotransferase  40.87 
 
 		 406 aa  311  1e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0194715  normal  0.65304 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3401  aminotransferase  39.06 
 
 		 411 aa  311  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.313714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  38.8 
 
 		 412 aa  311  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4201  aminotransferase  39.48 
 
 		 405 aa  310  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1928  aminotransferase class I and II  38.11 
 
 		 390 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  41.04 
 
 		 394 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  40.31 
 
 		 402 aa  310  4e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1334  aminotransferase  38.36 
 
 		 411 aa  310  4e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1446  aminotransferase  38.36 
 
 		 411 aa  310  4e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2945  aminotransferase class I and II  39.18 
 
 		 425 aa  310  4e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0558031  hitchhiker  0.0087233 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0644  aminotransferase  39.59 
 
 		 402 aa  310  4e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.439805  normal  0.145502 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2726  aminotransferase  38.36 
 
 		 411 aa  310  4e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  41.04 
 
 		 394 aa  309  5e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4371  aminotransferase  38.9 
 
 		 402 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1410  aminotransferase  39.84 
 
 		 403 aa  309  5.9999999999999995e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0292  aspartate aminotransferase  38.06 
 
 		 402 aa  309  5.9999999999999995e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0854  aminotransferase  38.9 
 
 		 402 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  40.84 
 
 		 403 aa  308  6.999999999999999e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0957  aspartate aminotransferase  38.87 
 
 		 404 aa  308  6.999999999999999e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000423208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23430  Aminotransferase, class I and II  38.95 
 
 		 414 aa  308  6.999999999999999e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02289  hypothetical protein  38.54 
 
 		 412 aa  308  8e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.695528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1278  aminotransferase class I and II  38.54 
 
 		 412 aa  308  8e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02250  hypothetical protein  38.54 
 
 		 412 aa  308  8e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550748  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2668  aminotransferase  38.54 
 
 		 412 aa  308  8e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2516  aminotransferase  38.54 
 
 		 412 aa  308  8e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1411  aminotransferase class I and II  38.78 
 
 		 394 aa  308  9e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.80446 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3611  aminotransferase  38.54 
 
 		 412 aa  308  9e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.890867 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1299  aminotransferase  39.59 
 
 		 403 aa  308  9e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2593  aminotransferase  38.21 
 
 		 412 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2634  aminotransferase  38.21 
 
 		 412 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1295  aminotransferase  38.8 
 
 		 407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1774  aminotransferase  43 
 
 		 396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.472622  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2764  aminotransferase  38.21 
 
 		 412 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2659  aminotransferase  38.21 
 
 		 412 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1758  aminotransferase, class I and II  45 
 
 		 391 aa  308  1.0000000000000001e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.125179 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  37.34 
 
 		 382 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2545  aminotransferase  38.21 
 
 		 412 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0817  aminotransferase  38.9 
 
 		 402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.241529  normal  0.324364 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4268  aminotransferase  39.22 
 
 		 418 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1290  aminotransferase  38.72 
 
 		 412 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0126  aminotransferase  38.87 
 
 		 400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1923  aminotransferase  39.29 
 
 		 405 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.351936  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1466  aminotransferase  38.28 
 
 		 411 aa  306  3e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1823  aminotransferase  41.19 
 
 		 407 aa  306  3e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2748  aminotransferase  38.28 
 
 		 412 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0840  aminotransferase  38.64 
 
 		 402 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450019  normal  0.811052 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0501  aminotransferase  40.62 
 
 		 413 aa  305  7e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1415  aminotransferase  39.19 
 
 		 397 aa  305  9.000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5073  aminotransferase  38.87 
 
 		 409 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0054925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>