49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0096 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0096  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  342  2e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2201  hypothetical protein  59.3 
 
 
173 aa  175  3e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0336  hypothetical protein  51.81 
 
 
177 aa  166  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0308  hypothetical protein  51.81 
 
 
177 aa  166  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1622  membrane protein of uknown function UCP014873  55.62 
 
 
166 aa  164  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1649  membrane protein of uknown function UCP014873  55.62 
 
 
166 aa  164  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.983052  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3781  membrane protein of uknown function UCP014873  55 
 
 
172 aa  158  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.579535 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1506  membrane protein of uknown function UCP014873  54.82 
 
 
164 aa  156  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1648  membrane protein of unknown function UCP014873  51.28 
 
 
168 aa  147  9e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2287  hypothetical protein  53.02 
 
 
193 aa  147  9e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1389  hypothetical protein  51.79 
 
 
175 aa  147  1e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00355367  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5486  membrane protein of uknown function UCP014873  46.75 
 
 
176 aa  146  2e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648729  normal  0.796721 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3618  hypothetical protein  51.53 
 
 
172 aa  144  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0504408  normal  0.0132377 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1043  membrane protein of uknown function UCP014873  50.62 
 
 
187 aa  139  2e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0884518 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6898  hypothetical protein  44.38 
 
 
176 aa  138  5e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1351  membrane protein of uknown function UCP014873  47.06 
 
 
202 aa  135  3e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1191  hypothetical protein  47.06 
 
 
232 aa  135  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0472376 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0077  hypothetical protein  49.14 
 
 
179 aa  132  2e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1893  membrane protein of uknown function UCP014873  46.84 
 
 
163 aa  129  2e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2210  hypothetical protein  49.04 
 
 
166 aa  129  2e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.270065 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1917  membrane protein of uknown function UCP014873  46.84 
 
 
163 aa  129  2e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00615975  normal  0.88974 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0848  hypothetical protein  43.64 
 
 
173 aa  126  1e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5123  membrane protein of uknown function UCP014873  45.24 
 
 
206 aa  125  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.305727 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1980  hypothetical protein  39.76 
 
 
172 aa  124  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.426393  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0656  hypothetical protein  41.14 
 
 
182 aa  123  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.862782  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2386  hypothetical protein  41.46 
 
 
166 aa  122  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2446  hypothetical protein  50.57 
 
 
174 aa  121  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  5.26152e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1452  membrane protein of unknown function UCP014873  44 
 
 
163 aa  119  2e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1291  hypothetical protein  44.83 
 
 
169 aa  117  1e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1480  hypothetical protein  45.74 
 
 
301 aa  116  2e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.900362 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2887  hypothetical protein  40.66 
 
 
170 aa  114  7e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.709191  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3069  hypothetical protein  37.34 
 
 
168 aa  103  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.17224  normal  0.666956 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3072  hypothetical protein  37.5 
 
 
167 aa  103  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.328618 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2312  hypothetical protein  47.5 
 
 
165 aa  99.4  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0906747  normal  0.167452 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4746  membrane protein of uknown function UCP014873  33.13 
 
 
168 aa  99.4  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1820  membrane protein of uknown function UCP014873  36.81 
 
 
162 aa  89  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0164172  normal  0.327909 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0759  membrane protein of uknown function UCP014873  39.75 
 
 
165 aa  84  1e-15  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0592  hypothetical protein  47.19 
 
 
91 aa  82.8  2e-15  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0445  membrane protein of uknown function UCP014873  27.88 
 
 
163 aa  82  4e-15  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1527  membrane protein of uknown function UCP014873  40.99 
 
 
163 aa  80.5  1e-14  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561063  normal  0.816437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4566  membrane protein of uknown function UCP014873  37.28 
 
 
249 aa  79.7  2e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0758  membrane protein of uknown function UCP014873  39.87 
 
 
163 aa  72.4  3e-12  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4002  hypothetical protein  28.83 
 
 
148 aa  70.5  1e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3156  membrane protein of unknown function UCP014873  28.19 
 
 
197 aa  62.4  3e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.185071  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4067  membrane protein of uknown function UCP014873  32.08 
 
 
160 aa  57.8  8e-08  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.527907 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0847  membrane protein-like  26.67 
 
 
255 aa  53.9  1e-06  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0771  membrane protein of uknown function UCP014873  35.58 
 
 
168 aa  53.1  2e-06  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0854213 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3580  hypothetical protein  27.69 
 
 
213 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1377  membrane protein-like  45.95 
 
 
56 aa  43.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>