48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0024 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0024  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  794    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.750506 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0221  hypothetical protein  53.06 
 
 		 400 aa  435  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00105596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4530  hypothetical protein  56.25 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.355101 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0072  hypothetical protein  52.36 
 
 		 402 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4748  hypothetical protein  52.76 
 
 		 393 aa  423  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0074  hypothetical protein  52.36 
 
 		 402 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3059  hypothetical protein  50.89 
 
 		 415 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.788767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2384  hypothetical protein  48.18 
 
 		 400 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1119  hypothetical protein  47.75 
 
 		 398 aa  338  8e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0692981  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1338  hypothetical protein  47.23 
 
 		 392 aa  332  1e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.265714  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0040  hypothetical protein  39.32 
 
 		 392 aa  318  7.999999999999999e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10461  hypothetical protein  41.13 
 
 		 401 aa  312  7.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06691  hypothetical protein  38.95 
 
 		 388 aa  309  5e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.505956  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06301  hypothetical protein  38.9 
 
 		 390 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.949662  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18771  hypothetical protein  45.05 
 
 		 407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.445832 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06601  hypothetical protein  38.86 
 
 		 390 aa  306  3e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06601  hypothetical protein  39.06 
 
 		 392 aa  305  9.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0604  hypothetical protein  38.95 
 
 		 388 aa  302  5.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44864  predicted protein  42.42 
 
 		 492 aa  297  2e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30636  predicted protein  38.5 
 
 		 483 aa  231  1e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0819532  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18359  predicted protein  32.59 
 
 		 439 aa  206  7e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.523729  normal  0.0221416 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44556  predicted protein  34 
 
 		 484 aa  195  1e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37092  predicted protein  31.59 
 
 		 389 aa  159  6e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.307269  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_3566  predicted protein  30.3 
 
 		 342 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0529465  normal  0.0506785 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1815  hypothetical protein  31.14 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.668291  normal  0.837266 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4153  hypothetical protein  30.91 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.386846  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4521  hypothetical protein  31.55 
 
 		 244 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6868  hypothetical protein  28.23 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4635  hypothetical protein  28.74 
 
 		 245 aa  57  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2549  hypothetical protein  30.13 
 
 		 247 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5898  hypothetical protein  28.19 
 
 		 239 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4494  hypothetical protein  26.32 
 
 		 232 aa  53.9  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1991  hypothetical protein  30.14 
 
 		 232 aa  53.5  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3792  hypothetical protein  28.82 
 
 		 231 aa  53.1  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0522  hypothetical protein  28.74 
 
 		 231 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0480  hypothetical protein  28.08 
 
 		 230 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2922  hypothetical protein  30.13 
 
 		 247 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.625248  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4909  hypothetical protein  31.17 
 
 		 246 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal  0.108673 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0552  hypothetical protein  28.16 
 
 		 231 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1558  hypothetical protein  28.86 
 
 		 237 aa  50.8  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0437869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0547  hypothetical protein  27.17 
 
 		 231 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2269  hypothetical protein  29.45 
 
 		 230 aa  49.3  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1897  hypothetical protein  25.49 
 
 		 245 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.850537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1107  hypothetical protein  26.11 
 
 		 249 aa  47  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2453  hypothetical protein  25.68 
 
 		 231 aa  46.6  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4822  hypothetical protein  26.38 
 
 		 236 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.75667 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  29.79 
 
 		 544 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1174  hypothetical protein  29.45 
 
 		 237 aa  44.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.58275  normal  0.922982 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>