More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0488 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B5522  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.62 
 
 
502 aa  648    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  hitchhiker  0.0000000000000322299 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0513  ATP synthase F1, alpha subunit  61.65 
 
 
501 aa  650    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0111  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.83 
 
 
503 aa  652    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16301  F0F1 ATP synthase subunit alpha  84.33 
 
 
505 aa  863    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3417  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.82 
 
 
502 aa  659    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.68 
 
 
501 aa  649    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0287666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.62 
 
 
502 aa  648    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0100  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.8 
 
 
501 aa  641    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5429  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.62 
 
 
502 aa  648    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.099904  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1426  ATP synthase F1, alpha subunit  61.69 
 
 
507 aa  646    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04831  F0F1 ATP synthase subunit alpha  86.93 
 
 
505 aa  884    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.62 
 
 
502 aa  648    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4990  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.62 
 
 
502 aa  648    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5007  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.62 
 
 
502 aa  648    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4497  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.07 
 
 
512 aa  649    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.694909  normal  0.0411828 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2846  ATP synthase F1, alpha subunit  61.21 
 
 
508 aa  635    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.525611 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.82 
 
 
502 aa  660    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3738  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.66 
 
 
502 aa  644    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0065  ATP synthase F1, alpha subunit  62.63 
 
 
508 aa  646    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0981  F0F1 ATP synthase subunit alpha  84.92 
 
 
504 aa  876    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4261  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.75 
 
 
502 aa  650    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00501837  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.64 
 
 
505 aa  650    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2611  F0F1 ATP synthase subunit alpha  75.99 
 
 
506 aa  792    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.169882  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5398  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.62 
 
 
502 aa  648    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2629899999999999e-45 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4486  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.67 
 
 
510 aa  642    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0947  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.51 
 
 
502 aa  640    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3133  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.51 
 
 
502 aa  640    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.02 
 
 
502 aa  650    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.67 
 
 
510 aa  642    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0488  F0F1 ATP synthase subunit alpha  100 
 
 
506 aa  1011    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294002  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7382  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.67 
 
 
509 aa  638    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187104  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2188  F0F1 ATP synthase subunit alpha  94.65 
 
 
506 aa  947    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.929468 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3408  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.62 
 
 
503 aa  652    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14914  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.22 
 
 
502 aa  640    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975811  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.62 
 
 
502 aa  648    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4793  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.5 
 
 
502 aa  676    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  84.33 
 
 
505 aa  864    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0336  F0F1 ATP synthase subunit alpha  82.14 
 
 
505 aa  848    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.120732  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2139  ATP synthase F1, alpha subunit  61.28 
 
 
507 aa  645    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2619  F0F1 ATP synthase subunit alpha  77.42 
 
 
503 aa  786    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  61.31 
 
 
507 aa  647    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4350  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.27 
 
 
510 aa  641    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18491  F0F1 ATP synthase subunit alpha  84.92 
 
 
504 aa  876    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.983268 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6637  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.42 
 
 
509 aa  637    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0712183 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1620  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.72 
 
 
504 aa  635    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0802007  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1736  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.85 
 
 
505 aa  657    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0176  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.08 
 
 
510 aa  636    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0601  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.03 
 
 
505 aa  646    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00209636  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16531  F0F1 ATP synthase subunit alpha  84.72 
 
 
505 aa  870    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.592214  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1468  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.28 
 
 
509 aa  638    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.184879 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0140  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.8 
 
 
501 aa  641    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.241383  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0557  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.08 
 
 
510 aa  636    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.114224 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0173  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.89 
 
 
510 aa  638    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0532  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.96 
 
 
510 aa  636    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0112  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.39 
 
 
501 aa  639    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0295232  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5485  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.62 
 
 
502 aa  648    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4334  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.9 
 
 
512 aa  642    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00117083  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5105  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.62 
 
 
502 aa  648    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3172  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.76 
 
 
502 aa  639    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0844597  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2759  ATP synthase F1, alpha subunit  64.27 
 
 
502 aa  674    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16411  F0F1 ATP synthase subunit alpha  84.72 
 
 
505 aa  870    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1640  ATP synthase F1, alpha subunit  62.25 
 
 
526 aa  638    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3383  F0F1 ATP synthase subunit alpha  77.82 
 
 
503 aa  799    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0111242  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0081  ATP synthase F1, alpha subunit  61.41 
 
 
507 aa  636    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2454  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.82 
 
 
502 aa  640    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2164  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.82 
 
 
502 aa  640    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2186  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.55 
 
 
502 aa  637    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2199  F0F1 ATP synthase subunit alpha  74.26 
 
 
505 aa  765    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2720  F0F1 ATP synthase subunit alpha  77.82 
 
 
503 aa  799    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.43 
 
 
502 aa  647    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  63 
 
 
501 aa  653    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2384  Sodium-transporting two-sector ATPase  62.35 
 
 
504 aa  635    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2804  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.49 
 
 
510 aa  641    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.370852  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0915  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.67 
 
 
505 aa  662    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0383852  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4167  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.4 
 
 
501 aa  667    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1492  F0F1 ATP synthase subunit alpha  74.06 
 
 
505 aa  781    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0642798  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15701  F0F1 ATP synthase subunit alpha  83.53 
 
 
504 aa  870    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.110948  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1467  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.42 
 
 
509 aa  639    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17820  ATP synthase F1, alpha subunit  62.45 
 
 
541 aa  666    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2829  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.64 
 
 
502 aa  652    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2584  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.77 
 
 
505 aa  659    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341955  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3460  ATP synthase F1, alpha subunit  61.68 
 
 
507 aa  640    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.823714  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3338  ATP synthase F1 subunit alpha  75.2 
 
 
506 aa  781    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1746  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.28 
 
 
509 aa  638    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  0.129066 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.75 
 
 
505 aa  663    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0604  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.41 
 
 
502 aa  639    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.41 
 
 
502 aa  639    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56305  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1679  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.53 
 
 
510 aa  634    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536422  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0406  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.81 
 
 
509 aa  634  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.102948 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0292  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.76 
 
 
507 aa  633  1e-180  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0605  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.49 
 
 
510 aa  631  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404784  normal  0.651766 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0430  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.49 
 
 
510 aa  634  1e-180  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1463  ATP synthase F1, alpha subunit  62.48 
 
 
509 aa  632  1e-180  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298107  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0267  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.89 
 
 
510 aa  634  1e-180  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.686525 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2400  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.68 
 
 
509 aa  634  1e-180  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.63 
 
 
502 aa  634  1e-180  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0270  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.36 
 
 
505 aa  634  1e-180  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.15 
 
 
526 aa  632  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6064  ATP synthase F1, alpha subunit  59.92 
 
 
512 aa  632  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2141  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.63 
 
 
502 aa  634  1e-180  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.588965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>