More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0055 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  100 
 
 		 65 aa  130  6e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  96.92 
 
 		 65 aa  126  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00601  50S ribosomal protein L35  83.08 
 
 		 65 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  83.08 
 
 		 65 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  83.08 
 
 		 65 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 		 65 aa  106  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18511  50S ribosomal protein L35  75.38 
 
 		 65 aa  100  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.752965  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18511  50S ribosomal protein L35  75.38 
 
 		 65 aa  100  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.428259  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18701  50S ribosomal protein L35  75.38 
 
 		 65 aa  100  7e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.951627  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1753  50S ribosomal protein L35  73.85 
 
 		 65 aa  100  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  65.62 
 
 		 65 aa  89.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1477  50S ribosomal protein L35  67.19 
 
 		 65 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.570064  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  62.5 
 
 		 65 aa  88.2  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1278  50S ribosomal protein L35  61.54 
 
 		 66 aa  83.6  9e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.503383 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  59.38 
 
 		 65 aa  80.5  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4254  50S ribosomal protein L35  59.09 
 
 		 67 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  56.92 
 
 		 65 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3499  50S ribosomal protein L35  57.58 
 
 		 67 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145508  normal  0.184731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2607  50S ribosomal protein L35  57.58 
 
 		 67 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0709  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2637  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.163287  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  54.69 
 
 		 66 aa  68.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  67  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0982  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0841883 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 68 aa  66.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1556  ribosomal protein L35  55.74 
 
 		 69 aa  66.2  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.637628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3746  ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.406609 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  53.45 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  48.44 
 
 		 79 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3541  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47075  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1277  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147861  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  50 
 
 		 64 aa  62  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2146  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1726  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0353101  normal  0.481897 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 65 aa  60.1  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  50.79 
 
 		 65 aa  60.1  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1953  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1162  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245099  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1975  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1645  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354073  normal  0.121255 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1268  50S ribosomal protein L35  51.72 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.35125 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0725  ribosomal protein L35  44.62 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00316856  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01686  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0100016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1925  ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000359648  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0488  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000885309  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1838  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2623  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000143878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1446  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.109072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2051  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0770661  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1430  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000901433  normal  0.0165189 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2435  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000580293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1915  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0414534  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2140  ribosomal protein L35  53.45 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205764  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1474  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0002542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01675  hypothetical protein  49.23 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0162765  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11659  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1714  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406642  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2010  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.800044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1798  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000060614  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1959  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000143205  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0876  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000162638  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1822  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000837501  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1463  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.3269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1890  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2182  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0779373  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3327  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797164  normal  0.341501 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2328  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000825235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2489  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000637036  hitchhiker  0.0000746157 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2186  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000722256  normal  0.0355999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2150  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000191739  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2220  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1707  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0213276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>