More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4483 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_0476  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  79.8 
 
 
688 aa  1156    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3884  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  61.3 
 
 
686 aa  867    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.913505  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0482  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  61.8 
 
 
686 aa  871    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4483  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  100 
 
 
682 aa  1405    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3201  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  40.42 
 
 
924 aa  496  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243991 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1646  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  39.05 
 
 
705 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.106603  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2049  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  38.97 
 
 
907 aa  463  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.564098  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.69 
 
 
706 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.630914  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000910  putative peptidase  36.31 
 
 
640 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.982884  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06914  prolyl oligopeptidase  36.5 
 
 
655 aa  388  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6730  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.22 
 
 
632 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.907657  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1266  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.59 
 
 
631 aa  348  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.211135  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5922  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.96 
 
 
626 aa  343  5e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  33.76 
 
 
630 aa  338  1.9999999999999998e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1930  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  33.85 
 
 
646 aa  336  7.999999999999999e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1803  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  32.66 
 
 
731 aa  333  7.000000000000001e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184836  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.79 
 
 
626 aa  330  4e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.92 
 
 
629 aa  328  2.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.262385  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1669  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.45 
 
 
629 aa  328  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8147  hypothetical protein  33.89 
 
 
634 aa  326  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.91 
 
 
641 aa  322  1.9999999999999998e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2643  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.63 
 
 
644 aa  319  1e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0377  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.26 
 
 
626 aa  317  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03802  dipeptidyl anminopeptidase  32.23 
 
 
694 aa  317  7e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1886  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.32 
 
 
636 aa  310  6.999999999999999e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.25 
 
 
626 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.111113 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.25 
 
 
626 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.34 
 
 
655 aa  305  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.69 
 
 
642 aa  301  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_002950  PG1004  prolyl oligopeptidase family protein  32.01 
 
 
759 aa  294  4e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5159  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.33 
 
 
666 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.017012  decreased coverage  0.000228688 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17781  hypothetical protein  31.47 
 
 
681 aa  287  5e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4772  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.47 
 
 
632 aa  283  8.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3714  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.01 
 
 
650 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0702  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  42.2 
 
 
665 aa  244  3e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0706  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.55 
 
 
656 aa  244  3e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.155251 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0365  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.86 
 
 
632 aa  237  6e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  27.19 
 
 
678 aa  226  8e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0594  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.75 
 
 
623 aa  220  6e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0048  prolyl oligopeptidase family protein  27.17 
 
 
642 aa  219  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.436282  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0469  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.82 
 
 
638 aa  219  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0322  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  30.96 
 
 
653 aa  218  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0395751  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  44.69 
 
 
644 aa  219  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0398  peptidase  27.63 
 
 
657 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  42.39 
 
 
645 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0003  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.89 
 
 
665 aa  206  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.54 
 
 
652 aa  205  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.93 
 
 
615 aa  206  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  42.39 
 
 
645 aa  206  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  42.39 
 
 
645 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0381  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.95 
 
 
654 aa  204  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217468  unclonable  0.000000000177281 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00624  prolyl oligopeptidase  29.76 
 
 
653 aa  204  6e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4618  prolyl oligopeptidase family protein  29.17 
 
 
645 aa  201  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  38.6 
 
 
597 aa  198  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000276973  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3803  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  41.18 
 
 
645 aa  196  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6032 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0323  prolyl oligopeptidase family protein  27.74 
 
 
649 aa  194  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0897  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.52 
 
 
600 aa  194  5e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.835581  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4252  prolyl oligopeptidase family protein  28.66 
 
 
662 aa  192  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3832  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.04 
 
 
659 aa  192  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3511  prolyl oligopeptidase family protein  26.75 
 
 
638 aa  191  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3601  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.54 
 
 
661 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0522  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.23 
 
 
610 aa  190  7e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450113  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3774  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.51 
 
 
661 aa  190  9e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.455998 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0373  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.31 
 
 
662 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.265704  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.2 
 
 
594 aa  189  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0384  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.54 
 
 
662 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290431  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.54 
 
 
662 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.34 
 
 
657 aa  188  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00542478  unclonable  0.0000000539912 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0834  hypothetical protein  26.91 
 
 
648 aa  188  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.386873  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2025  prolyl oligopeptidase family protein  28.69 
 
 
636 aa  187  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00251963  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3485  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.25 
 
 
654 aa  186  9e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0398  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.34 
 
 
662 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000316056 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3841  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.18 
 
 
654 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0355  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.14 
 
 
662 aa  185  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.81 
 
 
662 aa  185  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179177  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0129  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.1 
 
 
665 aa  182  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.286088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4496  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.28 
 
 
657 aa  181  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.597999  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  38.91 
 
 
645 aa  180  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3234  acylamino-acid-releasing enzyme  36.68 
 
 
596 aa  179  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3064  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.57 
 
 
755 aa  179  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.366531  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0494  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.33 
 
 
685 aa  178  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0656758  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0844  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.77 
 
 
646 aa  178  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25 
 
 
634 aa  177  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.6 
 
 
607 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.530992  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.6 
 
 
656 aa  176  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.45 
 
 
642 aa  175  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3833  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.57 
 
 
649 aa  173  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4261  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.91 
 
 
652 aa  170  8e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3063  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.71 
 
 
688 aa  169  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.45 
 
 
653 aa  168  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1087  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.89 
 
 
650 aa  166  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.393964  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0312  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.73 
 
 
588 aa  162  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0078  prolyl oligopeptidase family protein  30.93 
 
 
665 aa  162  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1112  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.54 
 
 
656 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245577  normal  0.568355 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6348  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.92 
 
 
629 aa  154  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3662  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.76 
 
 
621 aa  153  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0540328  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0194  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.75 
 
 
638 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2910  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  24.45 
 
 
606 aa  147  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.59 
 
 
596 aa  147  6e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3931  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.25 
 
 
695 aa  146  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0988778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>