126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1437 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0980  glycosy hydrolase family protein  60.91 
 
 		 789 aa  1013    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.966041  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1437  Kojibiose phosphorylase  100 
 
 		 788 aa  1646    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2962  Kojibiose phosphorylase  41.73 
 
 		 778 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000307404  normal  0.340362 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0403  Kojibiose phosphorylase  38.82 
 
 		 781 aa  558  1e-157  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.10881  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2193  Kojibiose phosphorylase  38.09 
 
 		 780 aa  555  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14560  Kojibiose phosphorylase  35.94 
 
 		 778 aa  511  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000528962  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1117  glycosy hydrolase family protein  36.13 
 
 		 780 aa  498  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158926  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0533  Kojibiose phosphorylase  36.29 
 
 		 795 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.704179 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0036  Kojibiose phosphorylase  34.92 
 
 		 790 aa  484  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0720168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0562  Kojibiose phosphorylase  35.63 
 
 		 795 aa  479  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0497  Kojibiose phosphorylase  35.42 
 
 		 795 aa  482  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1279  Kojibiose phosphorylase  35.33 
 
 		 790 aa  482  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02160  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  34.48 
 
 		 825 aa  472  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09380  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  34.65 
 
 		 848 aa  473  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27210  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  36.34 
 
 		 807 aa  470  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585996  normal  0.801027 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2116  Kojibiose phosphorylase  35.46 
 
 		 834 aa  459  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3421  Kojibiose phosphorylase  35.01 
 
 		 858 aa  457  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20570  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  34.28 
 
 		 843 aa  455  1.0000000000000001e-126  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.414924 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4347  glycoside hydrolase family protein  34.7 
 
 		 804 aa  451  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138652  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2887  family 65 glycoside hydrolase  35.11 
 
 		 824 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2817  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  33.99 
 
 		 810 aa  433  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0216244  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2716  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  33.8 
 
 		 787 aa  430  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4269  Kojibiose phosphorylase  34.6 
 
 		 767 aa  429  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6405  Kojibiose phosphorylase  34.21 
 
 		 784 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.338097  normal  0.788674 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0241  Kojibiose phosphorylase  32.56 
 
 		 800 aa  429  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1493  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  32.72 
 
 		 786 aa  420  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.310066  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5750  Kojibiose phosphorylase  32.99 
 
 		 794 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.06218  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0525  Kojibiose phosphorylase  35.01 
 
 		 791 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.659551  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2513  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  33.82 
 
 		 786 aa  416  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0438  Kojibiose phosphorylase  34.25 
 
 		 791 aa  414  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  30.79 
 
 		 986 aa  411  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1809  Kojibiose phosphorylase  33.03 
 
 		 784 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1073  Kojibiose phosphorylase  32.72 
 
 		 789 aa  398  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.15759 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0308  Kojibiose phosphorylase  34.53 
 
 		 786 aa  395  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0531  Kojibiose phosphorylase  34.31 
 
 		 781 aa  388  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1171  glycoside hydrolase family protein  32.64 
 
 		 787 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1188  Kojibiose phosphorylase  32.64 
 
 		 787 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.399982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1198  Kojibiose phosphorylase  32.64 
 
 		 787 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.51521  normal  0.0335974 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1472  Kojibiose phosphorylase  31.08 
 
 		 790 aa  381  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3033  Kojibiose phosphorylase  30.39 
 
 		 780 aa  377  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.10218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13436  hypothetical protein  32.72 
 
 		 786 aa  373  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0422368  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0258  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  30.28 
 
 		 782 aa  352  2e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00420  Kojibiose phosphorylase  28.77 
 
 		 780 aa  339  9.999999999999999e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0140  Kojibiose phosphorylase  30.78 
 
 		 763 aa  335  3e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0398  Kojibiose phosphorylase  28.89 
 
 		 755 aa  323  7e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00143976  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1747  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  29.51 
 
 		 778 aa  321  3.9999999999999996e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0089  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  28.69 
 
 		 777 aa  319  2e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472584  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5087  maltose phosphorylase  27.01 
 
 		 774 aa  313  6.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.076109  normal  0.646973 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2756  maltose phosphorylase  28.09 
 
 		 771 aa  308  3e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.264043 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1203  Kojibiose phosphorylase  28.72 
 
 		 807 aa  300  5e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2202  Kojibiose phosphorylase  27.94 
 
 		 775 aa  300  7e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.387396  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0054  maltose phosphorylase  28.06 
 
 		 750 aa  296  1e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000286879  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3314  Kojibiose phosphorylase  33.48 
 
 		 805 aa  293  8e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1401  maltose phosphorylase  26.92 
 
 		 767 aa  293  1e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.900484  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05085  Trehalose/maltose hydrolase (phosphorylase)  26.98 
 
 		 768 aa  292  2e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1550  Kojibiose phosphorylase  27.76 
 
 		 789 aa  292  2e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0919  Kojibiose phosphorylase  27.07 
 
 		 794 aa  291  4e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.570777 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0811  Kojibiose phosphorylase  26.51 
 
 		 787 aa  290  7e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.427192  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1847  maltose phosphorylase  28.13 
 
 		 751 aa  289  1e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3917  Kojibiose phosphorylase  28.76 
 
 		 748 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.057945 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1264  glycosy hydrolase family protein  27.07 
 
 		 781 aa  281  3e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.353218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1530  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  28.18 
 
 		 759 aa  281  4e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0216  maltose phosphorylase  26.73 
 
 		 758 aa  278  2e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000286832  hitchhiker  0.00000374663 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0894  maltose phosphorylase  28.89 
 
 		 752 aa  278  3e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0190  maltose phosphorylase  27.96 
 
 		 765 aa  276  8e-73  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1194  Kojibiose phosphorylase  28.23 
 
 		 787 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0839  maltose phosphorylase  28.02 
 
 		 710 aa  272  2e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0771265  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2869  Kojibiose phosphorylase  31.49 
 
 		 760 aa  271  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0995  maltose phosphorylase  28.35 
 
 		 752 aa  271  5e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3243  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  29.92 
 
 		 749 aa  268  2.9999999999999995e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2158  Kojibiose phosphorylase  27.37 
 
 		 757 aa  264  4e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.848315 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2279  glycoside hydrolase family protein  27.73 
 
 		 759 aa  264  4.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.7939 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1431  glycosy hydrolase family protein  26.5 
 
 		 755 aa  253  8.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2330  Kojibiose phosphorylase  26.5 
 
 		 755 aa  253  9.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.21539  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2309  Kojibiose phosphorylase  26.5 
 
 		 755 aa  253  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20830  Kojibiose phosphorylase  32.72 
 
 		 769 aa  253  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  25.8 
 
 		 965 aa  252  2e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01293  predicted hydrolase  31.28 
 
 		 755 aa  249  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.940342  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6156  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  33.26 
 
 		 777 aa  249  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01304  hypothetical protein  31.28 
 
 		 755 aa  249  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95805  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  28.38 
 
 		 1053 aa  248  4e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1961  glycosyl hydrolase, family 65  32.45 
 
 		 755 aa  248  4e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.756125  normal  0.752383 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1527  glycosy hydrolase family protein  32.82 
 
 		 755 aa  247  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8722  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  30.08 
 
 		 762 aa  244  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909698  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1806  glycosy hydrolase family protein  32.82 
 
 		 755 aa  243  7.999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.769957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1874  Kojibiose phosphorylase  28.74 
 
 		 753 aa  243  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.84 
 
 		 1050 aa  239  2e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.99 
 
 		 1051 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1281  Kojibiose phosphorylase  25.87 
 
 		 761 aa  231  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0038  Kojibiose phosphorylase  25.23 
 
 		 761 aa  228  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.32 
 
 		 1052 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3313  Kojibiose phosphorylase  26.06 
 
 		 748 aa  224  4.9999999999999996e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.28 
 
 		 1051 aa  220  7e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1016  Kojibiose phosphorylase  31.29 
 
 		 776 aa  220  7.999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4794  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  25.76 
 
 		 807 aa  218  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2162  trehalose 6-phosphate phosphorylase  25.44 
 
 		 807 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.40305 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2264  Kojibiose phosphorylase  30.82 
 
 		 720 aa  215  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.170179  hitchhiker  0.00000128676 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  26.81 
 
 		 1055 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26 
 
 		 1053 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  30.86 
 
 		 978 aa  212  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>