64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0717 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0717  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  454  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  2.53337e-08  unclonable  1.17044e-08 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3843  hypothetical protein  90.27 
 
 
226 aa  420  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  7.24256e-05  hitchhiker  2.83379e-08 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0618  hypothetical protein  88.05 
 
 
226 aa  410  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.357102  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3487  hypothetical protein  84.07 
 
 
226 aa  393  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.26131e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0917  hypothetical protein  80.97 
 
 
226 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00343614  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0907  protein of unknown function DUF47  80.97 
 
 
226 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  5.56938e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0883  hypothetical protein  80.97 
 
 
226 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.29781e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3455  hypothetical protein  80.97 
 
 
226 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000227297  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0692  hypothetical protein  80.89 
 
 
226 aa  379  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.30211e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3119  hypothetical protein  80.53 
 
 
226 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  7.17729e-07  normal  0.542025 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0565  hypothetical protein  81.33 
 
 
226 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0822  hypothetical protein  80.53 
 
 
226 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  1.09083e-06  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3770  hypothetical protein  80.53 
 
 
226 aa  378  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0853  hypothetical protein  80.53 
 
 
226 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  4.59273e-07  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2673  hypothetical protein  79.65 
 
 
226 aa  376  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3096  hypothetical protein  79.65 
 
 
226 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  1.06475e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00863  hypothetical protein  68.89 
 
 
228 aa  325  3e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2681  hypothetical protein  67.11 
 
 
226 aa  320  8e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0612362  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2019  hypothetical protein  67.11 
 
 
228 aa  319  3e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  5.82127e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3638  hypothetical protein  67.11 
 
 
226 aa  315  4e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1465  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3320  hypothetical protein  65.18 
 
 
225 aa  314  7e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0181  hypothetical protein  63.11 
 
 
226 aa  303  2e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1190  phosphate transport regulator  59.56 
 
 
226 aa  285  3e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.967179  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004528  phosphate transport regulator  68.56 
 
 
195 aa  278  4e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.327148  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0351  hypothetical protein  56.89 
 
 
225 aa  276  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68800  hypothetical protein  53.78 
 
 
225 aa  262  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5953  hypothetical protein  53.33 
 
 
225 aa  262  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0634  hypothetical protein  53.36 
 
 
223 aa  252  3e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0618  hypothetical protein  52.91 
 
 
223 aa  251  7e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2827  hypothetical protein  50.46 
 
 
224 aa  237  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245918  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2470  hypothetical protein  53.12 
 
 
226 aa  237  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2188  hypothetical protein  50.9 
 
 
226 aa  232  4e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.839701  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0711  hypothetical protein  52.91 
 
 
226 aa  229  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0138  putative pit accessory protein  50 
 
 
238 aa  227  9e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0141  Putitive phosphate transport regulator  47.77 
 
 
226 aa  225  4e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.572504  normal  0.330321 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1052  hypothetical protein  47.47 
 
 
224 aa  207  1e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170442  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0228  hypothetical protein  44 
 
 
227 aa  182  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.775061  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1146  Putitive phosphate transport regulator  30.45 
 
 
227 aa  125  4e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.266401  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0063  hypothetical protein  31.34 
 
 
224 aa  119  4e-26  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2044  hypothetical protein  29.6 
 
 
228 aa  104  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  4.05279e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3224  hypothetical protein  29.07 
 
 
222 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0788  hypothetical protein  25.12 
 
 
212 aa  79  5e-14  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1625  hypothetical protein  28.44 
 
 
217 aa  74.7  1e-12  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.109704  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0285  hypothetical protein  29.11 
 
 
217 aa  73.9  2e-12  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0688  hypothetical protein  25.75 
 
 
222 aa  68.9  6e-11  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  1.15743e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0664  hypothetical protein  25.75 
 
 
222 aa  68.6  8e-11  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.9589e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1923  hypothetical protein  25 
 
 
223 aa  67.4  2e-10  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00116502  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0013  hypothetical protein  25.23 
 
 
213 aa  66.6  3e-10  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0013  hypothetical protein  25.23 
 
 
213 aa  66.6  3e-10  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0036  Putitive phosphate transport regulator  26.36 
 
 
218 aa  66.6  3e-10  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1332  hypothetical protein  27.08 
 
 
215 aa  60.1  3e-08  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3780  phosphate transport regulator-like  22.91 
 
 
226 aa  52.8  4e-06  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0493  hypothetical protein  22.54 
 
 
224 aa  50.8  2e-05  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  2.13235e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1484  protein of unknown function DUF47  22.91 
 
 
208 aa  45.4  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  5.48446e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1377  hypothetical protein  25.13 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  1.52766e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3836  hypothetical protein  25.13 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.103602  hitchhiker  8.51308e-11 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1509  hypothetical protein  25.13 
 
 
206 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0044058  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1577  hypothetical protein  25.13 
 
 
206 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  1.93859e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1615  hypothetical protein  25.13 
 
 
206 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.02331e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1335  hypothetical protein  25.13 
 
 
206 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  6.52491e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1546  hypothetical protein  25.13 
 
 
206 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.12847e-09 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1362  hypothetical protein  25.13 
 
 
206 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.80581e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1336  hypothetical protein  25.13 
 
 
206 aa  42.4  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0728144  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1472  hypothetical protein  25.13 
 
 
206 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>