120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0107 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0107  YheO domain-containing protein  100 
 
 		 226 aa  471  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4078  YheO domain-containing protein  88.94 
 
 		 226 aa  423  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0689  YheO domain-containing protein  63.47 
 
 		 225 aa  304  7e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02785  hypothetical protein  63.59 
 
 		 222 aa  301  8.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2028  YheO domain-containing protein  53.46 
 
 		 223 aa  237  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0390581  normal  0.0444206 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3925  hypothetical protein  44.86 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000338087  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3682  hypothetical protein  44.86 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00382981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0271  YheO domain-containing protein  44.86 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0835286  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3834  YheO domain protein  44.91 
 
 		 248 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.249663  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2767  hypothetical protein  42.08 
 
 		 240 aa  195  5.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000230271  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4014  YheO domain protein  44.91 
 
 		 248 aa  194  7e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.182407  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0394  YheO domain protein  44.44 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00468087  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4555  YheO domain-containing protein  42.99 
 
 		 240 aa  192  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495528  normal  0.271247 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00061  hypothetical protein  42.06 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002293  hypothetical protein  42.06 
 
 		 226 aa  190  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000331987  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0306  putative DNA-binding protein  41.78 
 
 		 237 aa  189  4e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0301161  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3763  YheO domain-containing protein  42.99 
 
 		 240 aa  187  8e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000101154  hitchhiker  0.00366713 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0312  YheO domain protein  43.06 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03197  predicted DNA-binding transcriptional regulator  42.52 
 
 		 240 aa  184  7e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000385535  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0367  YheO domain protein  42.52 
 
 		 240 aa  184  7e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615981  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3542  hypothetical protein  42.52 
 
 		 240 aa  184  7e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.9543e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3815  hypothetical protein  42.52 
 
 		 240 aa  184  7e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000129937  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0367  YheO domain-containing protein  42.52 
 
 		 240 aa  184  7e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.044939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3627  hypothetical protein  42.52 
 
 		 240 aa  184  7e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000861494  hitchhiker  0.00116448 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3720  hypothetical protein  42.52 
 
 		 240 aa  184  7e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03148  hypothetical protein  42.52 
 
 		 240 aa  184  7e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000388396  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4655  hypothetical protein  42.52 
 
 		 240 aa  184  8e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000142414  normal  0.0121567 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3043  YheO domain protein  42.38 
 
 		 218 aa  184  9e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3722  hypothetical protein  42.52 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000194242  normal  0.0632253 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3757  hypothetical protein  42.52 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0543637  normal  0.202333 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3648  hypothetical protein  42.52 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000508468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3649  hypothetical protein  42.52 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000157298  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3820  hypothetical protein  42.52 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000148293  normal  0.984767 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1636  hypothetical protein  37.79 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1492  YheO domain-containing protein  38.14 
 
 		 221 aa  149  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4888  YheO domain-containing protein  33.79 
 
 		 221 aa  142  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0740  putative DNA-binding protein  34.58 
 
 		 211 aa  141  7e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1402  hypothetical protein  32.57 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1208  YheO domain-containing protein  31.94 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2973  YheO domain-containing protein  32.57 
 
 		 226 aa  135  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3071  YheO domain-containing protein  32.41 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3081  YheO domain-containing protein  32.41 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3224  YheO domain-containing protein  32.41 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1295  YheO domain protein  32.41 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2794  YheO domain-containing protein  32.57 
 
 		 226 aa  134  8e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2877  YheO domain-containing protein  32.57 
 
 		 226 aa  134  8e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2536  MukF protein  33.33 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3512  putative DNA-binding protein  34.29 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.651472  normal  0.122215 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03080  hypothetical protein  31.63 
 
 		 218 aa  122  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002894  putative DNA-binding protein  31.19 
 
 		 219 aa  121  9e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0265  YheO domain protein  30.77 
 
 		 222 aa  115  5e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.205654  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0400  YheO domain protein  29.38 
 
 		 223 aa  105  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1030  YheO domain-containing protein  28.44 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0810  hypothetical protein  28.91 
 
 		 223 aa  98.2  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1803  YheO domain protein  28.02 
 
 		 221 aa  94.7  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00197351  decreased coverage  0.000758988 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0108  YheO domain protein  29.25 
 
 		 224 aa  94.7  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2109  YheO domain-containing protein  27.01 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.763786  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0613  YheO domain-containing protein  29.9 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0541  hypothetical protein  28.44 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0602  YheO domain-containing protein  28.44 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.156271  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20890  YheO domain protein  26.13 
 
 		 221 aa  88.6  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2434  YheO domain protein  28.08 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000217954  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0235  YheO domain protein  26.64 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2555  YheO domain protein  26.4 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1772  YheO domain protein  26.4 
 
 		 580 aa  77.8  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2249  YheO domain protein  27.27 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2335  YheO domain protein  25.98 
 
 		 263 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.579523  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4823  hypothetical protein  27.14 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00729669  normal  0.42509 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0420  YheO domain protein  27.19 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5755  YheO domain-containing protein  24.65 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00241536  hitchhiker  0.000000000000540056 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1209  DNA repair protein RecN (recombination protein N)  27.57 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2654  YheO domain protein  27.01 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2841  YheO domain-containing protein  28.06 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378743 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1389  hypothetical protein  24.66 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000107006  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0263  hypothetical protein  24.66 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2566  YheO domain protein  26.26 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.086205  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1578  hypothetical protein  24.66 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2761  YheO domain-containing protein  26.11 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1367  YheO domain-containing protein  24.52 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2931  YheO domain protein  25.55 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3127  YheO domain protein  25.6 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284624  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3785  YheO domain-containing protein  24.64 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81805  normal  0.997739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2673  YheO domain-containing protein  27.1 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2524  YheO domain-containing protein  27.65 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0563238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4178  YheO domain-containing protein  24.14 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2073  YheO domain protein  26.15 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0868612 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3919  YheO-like  23.11 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4449  YheO domain-containing protein  23.11 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5858  YheO domain-containing protein  23.11 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.575899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3881  YheO domain-containing protein  23.5 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0788485 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1451  hypothetical protein  29.44 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.112752  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5663  YheO domain protein  26.92 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.8397 
 
 
-
 
NC_003296  RS04794  hypothetical protein  24.77 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.40629  normal  0.0119092 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0038  YheO domain-containing protein  23.81 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1071  hypothetical protein  27.4 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.110184 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3404  YheO domain-containing protein  24.12 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1820  hypothetical protein  22.03 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0120168  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0968  hypothetical protein  29.86 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1494  hypothetical protein  24.14 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101034  normal  0.19833 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0847  YheO domain-containing protein  26.27 
 
 		 215 aa  62  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.262344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>