More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1667 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  634    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  45.02 
 
 
312 aa  242  7e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  41.45 
 
 
309 aa  238  9e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  37.88 
 
 
313 aa  212  5.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1782  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  30.87 
 
 
314 aa  149  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226072  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  34.19 
 
 
294 aa  145  1e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0848  hypothetical protein  32.56 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0702  hypothetical protein  35.8 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00518069  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  31.91 
 
 
305 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  32.95 
 
 
290 aa  134  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0109  hypothetical protein  30.8 
 
 
325 aa  129  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.128866  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2062  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  31.5 
 
 
314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.543903  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  29.6 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4015  hypothetical protein  31.87 
 
 
307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3848  alpha/beta hydrolase  31.87 
 
 
307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3862  alpha/beta hydrolase  31.87 
 
 
307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4130  hypothetical protein  31.87 
 
 
307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4328  hypothetical protein  31.87 
 
 
307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4239  hypothetical protein  32.27 
 
 
307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1021  hypothetical protein  31.33 
 
 
307 aa  116  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4175  hypothetical protein  32.27 
 
 
307 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  30.08 
 
 
305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3938  hypothetical protein  31.58 
 
 
307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0617  peptidase S15  29.52 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000016795  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2805  alpha/beta hydrolase  31.58 
 
 
307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.793976  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4216  hypothetical protein  31.6 
 
 
308 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1527  alpha/beta fold family hydrolase  28.93 
 
 
307 aa  103  3e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3228  hypothetical protein  31.03 
 
 
320 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883835  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3566  hypothetical protein  35.76 
 
 
313 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0952095  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0300  alpha/beta hydrolase  29.39 
 
 
319 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1528  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 
295 aa  98.6  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109222  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0257  alpha/beta hydrolase  28.46 
 
 
319 aa  97.8  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0230215  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  31.01 
 
 
284 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1158  hypothetical protein  29.96 
 
 
337 aa  95.5  9e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000697684  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0491  alpha/beta fold family hydrolase  28.98 
 
 
309 aa  95.5  9e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000476721  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  26.25 
 
 
278 aa  94.7  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0993  hypothetical protein  29.32 
 
 
337 aa  94.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.261261  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  30.62 
 
 
293 aa  94  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  30.62 
 
 
293 aa  94  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  30.62 
 
 
284 aa  94  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  30.62 
 
 
284 aa  94  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  30.62 
 
 
284 aa  94  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  30.62 
 
 
284 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  30.35 
 
 
284 aa  92.8  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0248  alpha/beta hydrolase  28.81 
 
 
319 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5015  alpha/beta hydrolase  28.14 
 
 
300 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0176237  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  30.62 
 
 
284 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.26 
 
 
302 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.37 
 
 
280 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0109  alpha/beta fold family hydrolase  26.94 
 
 
311 aa  90.1  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000692138  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1375  alpha/beta fold family hydrolase  28.74 
 
 
314 aa  89.7  5e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000598397 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0251  putative alpha/beta hydrolase  27.86 
 
 
319 aa  89.7  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  29.75 
 
 
259 aa  89.7  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0307  alpha/beta hydrolase  28.24 
 
 
319 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028289  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1306  hypothetical protein  27.85 
 
 
306 aa  87.8  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0753003  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0208  alpha/beta fold family hydrolase  29.44 
 
 
313 aa  87.8  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1447  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.24 
 
 
285 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  28.41 
 
 
292 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4068  hypothetical protein  29.44 
 
 
310 aa  87  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.86962  normal  0.017048 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  28.41 
 
 
292 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  28.41 
 
 
292 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1494  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.76 
 
 
296 aa  86.3  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2200  putative lipoprotein  28.32 
 
 
296 aa  85.9  8e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.31625  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3047  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  29.39 
 
 
322 aa  85.5  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0033788  normal  0.0365868 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  28.03 
 
 
292 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2170  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  34.15 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.264266  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2579  hypothetical protein  27.5 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.121751  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.81 
 
 
315 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1712  hypothetical protein  31.87 
 
 
323 aa  84  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81171  normal  0.0796717 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  25.47 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4715  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  30.43 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  27.1 
 
 
290 aa  82  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  26.87 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1203  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  29.74 
 
 
314 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  25.48 
 
 
298 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0915  Lysophospholipase-like protein  30.37 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.452127  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2712  hypothetical protein  26.59 
 
 
322 aa  77  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00940058  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1668  alpha/beta fold family hydrolase  27.16 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0139798  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  26.67 
 
 
277 aa  77  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0822  hypothetical protein  28.27 
 
 
376 aa  76.6  0.0000000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  26.77 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  27 
 
 
287 aa  75.9  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3502  phospholipase/Carboxylesterase  25.75 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0072  hypothetical protein  30.16 
 
 
347 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000140127  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  27.03 
 
 
253 aa  74.7  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl315  lysophospholipase  27.17 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.71518e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  26.25 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0385  hypothetical protein  26.24 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0740137  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl606  putative hydrolase  27.04 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  25.78 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2614  phospholipase/Carboxylesterase  25 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1498  alpha/beta hydrolase fold  23.33 
 
 
372 aa  73.2  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.219289  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1064  putative lipoprotein  27 
 
 
304 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0384  hypothetical protein  25.94 
 
 
312 aa  72.8  0.000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00245996  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0739  hypothetical protein  26.62 
 
 
382 aa  72.8  0.000000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1667  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  25.43 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.195418  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0497  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  26.92 
 
 
326 aa  72.4  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.702531  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14054  predicted protein  29.47 
 
 
261 aa  72  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  24.51 
 
 
275 aa  72  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0392  hypothetical protein  29.69 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.280774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>