More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0276 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  71.87 
 
 
428 aa  641    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  73.58 
 
 
429 aa  639    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 
425 aa  865    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  73.46 
 
 
426 aa  637    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  70.45 
 
 
427 aa  631  1e-180  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  71.06 
 
 
430 aa  625  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  70.82 
 
 
430 aa  625  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  70.92 
 
 
428 aa  620  1e-176  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  68.78 
 
 
431 aa  615  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  68.78 
 
 
431 aa  615  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  69.01 
 
 
431 aa  615  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  68.47 
 
 
430 aa  616  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  68.78 
 
 
431 aa  615  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  68.78 
 
 
431 aa  615  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  69.01 
 
 
431 aa  615  1e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  69.65 
 
 
425 aa  608  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  69.48 
 
 
431 aa  604  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  69.48 
 
 
431 aa  604  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  68.16 
 
 
429 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  69.34 
 
 
428 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0306  phosphopyruvate hydratase  68.16 
 
 
427 aa  603  1.0000000000000001e-171  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  69.01 
 
 
431 aa  599  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  68.78 
 
 
431 aa  598  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15790  enolase  70.14 
 
 
428 aa  598  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000402486  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  67.84 
 
 
431 aa  595  1e-169  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  68.16 
 
 
429 aa  597  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  65.33 
 
 
428 aa  591  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 
429 aa  589  1e-167  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 
429 aa  589  1e-167  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  67.38 
 
 
431 aa  590  1e-167  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  67.38 
 
 
431 aa  590  1e-167  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2254  phosphopyruvate hydratase  69.36 
 
 
431 aa  585  1e-166  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0274446  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  66.03 
 
 
422 aa  586  1e-166  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1403  phosphopyruvate hydratase  68.79 
 
 
434 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000162747  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0744  enolase  68.09 
 
 
426 aa  581  1.0000000000000001e-165  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  67.14 
 
 
431 aa  578  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  65.01 
 
 
427 aa  578  1e-164  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0143  phosphopyruvate hydratase  68.17 
 
 
433 aa  579  1e-164  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000522536  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  65.01 
 
 
427 aa  575  1.0000000000000001e-163  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  65.81 
 
 
432 aa  577  1.0000000000000001e-163  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1147  phosphopyruvate hydratase  68.47 
 
 
426 aa  577  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0342675  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 
429 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1220  phosphopyruvate hydratase  68 
 
 
426 aa  574  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4067  enolase  64.8 
 
 
435 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122819  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  65.18 
 
 
429 aa  571  1.0000000000000001e-162  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0074  phosphopyruvate hydratase  66.67 
 
 
429 aa  573  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00475517  unclonable  0.00000000106415 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0146  phosphopyruvate hydratase  64.3 
 
 
428 aa  570  1e-161  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.152915  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  63.59 
 
 
427 aa  568  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0358  enolase  66.82 
 
 
429 aa  569  1e-161  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  63.12 
 
 
427 aa  570  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  64.71 
 
 
429 aa  569  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  64.32 
 
 
431 aa  567  1e-160  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0295  phosphopyruvate hydratase  65.16 
 
 
431 aa  566  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2784  phosphopyruvate hydratase  64.47 
 
 
429 aa  567  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0201  phosphopyruvate hydratase  66.59 
 
 
428 aa  564  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  64.62 
 
 
425 aa  567  1e-160  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4471  phosphopyruvate hydratase  64.62 
 
 
427 aa  566  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2907  phosphopyruvate hydratase  64.24 
 
 
429 aa  566  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  63.83 
 
 
427 aa  567  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1614  enolase  67.53 
 
 
426 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3739  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 
431 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535822  normal  0.0352048 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2168  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 
429 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.529059  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07850  enolase  64 
 
 
426 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.376533 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1885  phosphopyruvate hydratase  66.35 
 
 
425 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96593  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  63.93 
 
 
427 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  66.75 
 
 
433 aa  561  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  62.97 
 
 
428 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4060  phosphopyruvate hydratase  67.06 
 
 
425 aa  563  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4532  phosphopyruvate hydratase  65.96 
 
 
429 aa  563  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  63.21 
 
 
428 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13450  enolase  65.02 
 
 
427 aa  559  1e-158  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.786582  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0801  phosphopyruvate hydratase  62.24 
 
 
434 aa  558  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0383653  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  63.36 
 
 
427 aa  559  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  63.92 
 
 
425 aa  559  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  63.92 
 
 
425 aa  559  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  64.39 
 
 
425 aa  560  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  63.47 
 
 
427 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  62.97 
 
 
428 aa  560  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0817  phosphopyruvate hydratase  62.24 
 
 
434 aa  558  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3222  phosphopyruvate hydratase  63.48 
 
 
430 aa  560  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0151  enolase  63.08 
 
 
427 aa  558  1e-158  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  64.47 
 
 
424 aa  560  1e-158  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2305  phosphopyruvate hydratase  65.02 
 
 
429 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3216  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 
427 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.308815  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0897  phosphopyruvate hydratase  63.59 
 
 
428 aa  556  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  63.12 
 
 
427 aa  557  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1642  phosphopyruvate hydratase  65.02 
 
 
429 aa  557  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3184  phosphopyruvate hydratase  64.3 
 
 
427 aa  557  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147815  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0167  phosphopyruvate hydratase  64.92 
 
 
425 aa  555  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2762  phosphopyruvate hydratase  65.57 
 
 
426 aa  556  1e-157  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00011967 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0078  phosphopyruvate hydratase  63.76 
 
 
426 aa  555  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  unclonable  0.0000170876 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0984  phosphopyruvate hydratase  63.76 
 
 
429 aa  555  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  64.51 
 
 
427 aa  555  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3132  enolase  66.12 
 
 
426 aa  557  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0229642  normal  0.046336 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  62.65 
 
 
427 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  63.92 
 
 
427 aa  551  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  62.41 
 
 
427 aa  551  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  63.23 
 
 
430 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1743  phosphopyruvate hydratase  64.39 
 
 
427 aa  553  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  63.21 
 
 
427 aa  551  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>