More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1390 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1390  dehydratase  100 
 
 		 150 aa  316  7.999999999999999e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2125  MaoC-like dehydratase  58.39 
 
 		 152 aa  177  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.133316  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0349  MaoC domain protein dehydratase  51.02 
 
 		 152 aa  152  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2320  MaoC domain protein dehydratase  49.01 
 
 		 149 aa  150  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2254  dehydratase  50.37 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.437437  normal  0.402982 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2043  hypothetical protein  46.62 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.770796  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0980  MaoC-like dehydratase  46.98 
 
 		 147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.740062  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0946  MaoC-like dehydratase  46.94 
 
 		 149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3698  MaoC-related protein  46.94 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.27276  normal  0.530433 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4836  MaoC domain protein dehydratase  45.58 
 
 		 160 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1872  MaoC domain protein dehydratase  42.57 
 
 		 161 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.760179  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3961  MaoC domain protein dehydratase  52.46 
 
 		 120 aa  133  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2195  MaoC domain protein dehydratase  41.89 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.300893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4342  MaoC domain protein dehydratase  45.64 
 
 		 180 aa  131  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.482582 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2160  MaoC-like dehydratase  49.62 
 
 		 154 aa  131  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4157  MaoC-like dehydratase  45.21 
 
 		 156 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.967717  normal  0.32934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1771  hypothetical protein  43.75 
 
 		 153 aa  130  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0047  MaoC domain protein dehydratase  45.95 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2601  dehydratase  42.28 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.801484 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3997  MaoC-like dehydratase  44.52 
 
 		 155 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0047  dehydratase  45.95 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2773  MaoC domain protein dehydratase  46.21 
 
 		 154 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.377896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3099  MaoC-like dehydratase  43.71 
 
 		 153 aa  127  8.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3813  MaoC domain protein dehydratase  43.24 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1487  maoC-related protein  44.85 
 
 		 166 aa  125  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5482  dehydratase  44.97 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0169  dehydratase  43.54 
 
 		 334 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0997526  normal  0.896388 
 
 
-
 
NC_004310  BR1538  maoC-related protein  44.12 
 
 		 166 aa  124  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0790227  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1364  MaoC domain protein dehydratase  43.24 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362364  hitchhiker  0.00124246 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1990  dehydratase  41.91 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681885  normal  0.551066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3190  putative (R)-specific enoyl-CoA hydratase, MaoC- like  44.85 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1628  dehydratase  41.67 
 
 		 161 aa  124  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.584563  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3037  MaoC domain protein dehydratase  49.24 
 
 		 163 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2508  MaoC-like dehydratase  44.67 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.485856  normal  0.184666 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1473  dehydratase  39.6 
 
 		 172 aa  120  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2796  MaoC domain protein dehydratase  42.95 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2815  MaoC domain protein dehydratase  46.72 
 
 		 334 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846625  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3196  hypothetical protein  41.61 
 
 		 156 aa  117  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130637  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1047  dehydratase  41.18 
 
 		 153 aa  117  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0118845  normal  0.124515 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1080  MoaC domain-containing protein  41.18 
 
 		 152 aa  116  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0096  MaoC domain protein dehydratase  42.86 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1419  MaoC-like dehydratase  44.59 
 
 		 151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.982529  normal  0.60129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2396  dehydratase  45.93 
 
 		 334 aa  114  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0902471  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1455  MoaC domain-containing protein  39.71 
 
 		 152 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1318  MoaC domain-containing protein  39.71 
 
 		 152 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233645  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1309  MoaC domain-containing protein  39.71 
 
 		 152 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1835  MaoC domain protein dehydratase  44.7 
 
 		 133 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0897261  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0718  MoaC domain-containing protein  39.71 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3209  MaoC domain protein dehydratase  40.14 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0647415 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1810  MoaC domain-containing protein  39.71 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0727  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1149  MoaC domain-containing protein  39.71 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.58838  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0432  MoaC domain-containing protein  39.71 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2268  dehydratase  42.95 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.276096  normal  0.630961 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3664  dehydratase  40.71 
 
 		 151 aa  110  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3996  MaoC-like dehydratase  40.76 
 
 		 160 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4123  dehydratase  41.67 
 
 		 329 aa  110  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3454  MaoC domain protein dehydratase  38.93 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0849  MaoC-like dehydratase  41.22 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05499  hypothetical protein  38.1 
 
 		 165 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4835  MaoC domain protein dehydratase  40.62 
 
 		 160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18160  hypothetical protein  39.86 
 
 		 161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0620  MaoC-like dehydratase  42.95 
 
 		 157 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3098  MaoC-like dehydratase  40.76 
 
 		 160 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2268  dehydratase  37.86 
 
 		 153 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2147  dehydratase  37.86 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.159813  normal  0.619636 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4164  MaoC domain protein dehydratase  37.67 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1191  MaoC-like dehydratase  38.93 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2976  dehydratase  40.94 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5558  MaoC-like dehydratase  38.57 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1662  dehydratase  40 
 
 		 146 aa  105  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0225  MaoC-like dehydratase  40 
 
 		 151 aa  104  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.369748  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4156  MaoC-like dehydratase  38.12 
 
 		 160 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.717491  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2254  dehydratase  37.14 
 
 		 153 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1618  MaoC-like dehydratase  37.14 
 
 		 167 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2230  dehydratase  37.14 
 
 		 167 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2600  dehydratase  39.49 
 
 		 158 aa  103  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2253  dehydratase  40 
 
 		 160 aa  101  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350029  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1772  hypothetical protein  37.58 
 
 		 159 aa  101  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2490  MaoC domain protein dehydratase  38.78 
 
 		 148 aa  99.4  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345211  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2414  MaoC domain protein dehydratase  40.58 
 
 		 332 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1627  dehydratase  37.5 
 
 		 160 aa  99.8  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350519  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2709  MaoC domain protein dehydratase  39.55 
 
 		 332 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.677067 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2486  dehydratase  39.55 
 
 		 352 aa  99  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3543  MaoC-like dehydratase  37.58 
 
 		 154 aa  99  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.925592  normal  0.245974 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2194  MaoC-like dehydratase  39.46 
 
 		 159 aa  97.8  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1809  dehydratase  35.81 
 
 		 163 aa  97.8  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0834383  normal  0.792889 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2269  dehydratase  38.67 
 
 		 156 aa  97.1  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265677  normal  0.623305 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2161  MaoC-like dehydratase  40.74 
 
 		 154 aa  96.7  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2507  MaoC-like dehydratase  36.65 
 
 		 161 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.183824 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2774  MaoC domain protein dehydratase  36.99 
 
 		 155 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.664287  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1539  maoC-related protein  37.16 
 
 		 160 aa  95.1  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.250749  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1420  MaoC-like dehydratase  35.67 
 
 		 160 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.788165  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3038  MaoC domain protein dehydratase  38.36 
 
 		 155 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.724485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4680  dehydratase  36.57 
 
 		 153 aa  92.8  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314725  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2522  MaoC domain-containing protein  33.33 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0109076  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0028  dehydratase  33.33 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0028  dehydratase  33.33 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.280729  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0495  dehydratase  35.81 
 
 		 146 aa  91.3  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2249  dehydratase  35.62 
 
 		 171 aa  87.4  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  normal  0.226342 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3197  hypothetical protein  32.9 
 
 		 161 aa  85.9  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.440702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>