More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_24040 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_24040  protein kinase family protein  100 
 
 		 509 aa  1032    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0282375 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16830  serine/threonine protein kinase  43.78 
 
 		 559 aa  336  5e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.753908  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6521  serine/threonine protein kinase  65.56 
 
 		 553 aa  336  5.999999999999999e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04840  protein kinase family protein  60 
 
 		 575 aa  330  5.0000000000000004e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6520  serine/threonine protein kinase  57.49 
 
 		 466 aa  316  6e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397338  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0472  serine/threonine protein kinase  57.72 
 
 		 554 aa  302  9e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0916  serine/threonine protein kinase  48.64 
 
 		 385 aa  300  5e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  55.64 
 
 		 855 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1744  Serine/threonine protein kinase-related protein  56.27 
 
 		 405 aa  293  7e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.679027  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  53.14 
 
 		 493 aa  262  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  50.75 
 
 		 528 aa  239  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  47.45 
 
 		 776 aa  234  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1813  serine/threonine protein kinase  46.13 
 
 		 411 aa  234  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  46.62 
 
 		 468 aa  231  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4419  serine/threonine protein kinase  36.95 
 
 		 563 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0775  serine/threonine protein kinase  43.48 
 
 		 659 aa  224  4e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.37143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2884  serine/threonine protein kinase  41.39 
 
 		 525 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.824247 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0831  protein kinase  42.7 
 
 		 675 aa  220  5e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.060355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.07 
 
 		 596 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0683  serine/threonine protein kinase  43.68 
 
 		 695 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.923157  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  44.06 
 
 		 562 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6454  serine/threonine protein kinase  45.28 
 
 		 705 aa  213  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00864828 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0682  serine/threonine protein kinase  42.46 
 
 		 674 aa  213  7e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239095  normal  0.045288 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1354  serine/threonine protein kinase  42.76 
 
 		 535 aa  213  7e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153882  normal  0.839237 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  44.44 
 
 		 422 aa  209  7e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05660  serine/threonine protein kinase  44.36 
 
 		 419 aa  209  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0359  serine/threonine protein kinase  45.86 
 
 		 631 aa  209  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  41.1 
 
 		 419 aa  207  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1542  Serine/threonine protein kinase-like protein  42.32 
 
 		 521 aa  206  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2236  serine/threonine protein kinase  39.46 
 
 		 632 aa  206  8e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129729  normal  0.143063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7153  Serine/threonine protein kinase-like protein  43.01 
 
 		 531 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.917924  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6676  Serine/threonine protein kinase-like protein  42.53 
 
 		 678 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520926  normal  0.364825 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4070  serine/threonine protein kinase  46.42 
 
 		 673 aa  204  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00170756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1619  serine/threonine protein kinase  46.73 
 
 		 703 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.682192  normal  0.0463489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6420  serine/threonine protein kinase  37.81 
 
 		 605 aa  200  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6592  serine/threonine protein kinase  42.38 
 
 		 468 aa  200  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.700225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3969  serine/threonine protein kinase  37.75 
 
 		 575 aa  200  6e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0852  protein kinase  41.95 
 
 		 621 aa  200  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5937  serine/threonine protein kinase  42.96 
 
 		 617 aa  199  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4798  Serine/threonine protein kinase-like protein  39.38 
 
 		 446 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263981  normal  0.132611 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  41.67 
 
 		 487 aa  197  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3084  serine/threonine protein kinase  41.45 
 
 		 766 aa  196  9e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5936  serine/threonine protein kinase  45.04 
 
 		 1029 aa  195  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0798  serine/threonine protein kinase  42.54 
 
 		 638 aa  193  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000182668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8509  protein kinase  43.7 
 
 		 377 aa  193  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355272  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0635  serine/threonine protein kinase  40.3 
 
 		 721 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8906  serine/threonine protein kinase  41.61 
 
 		 525 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2889  Serine/threonine protein kinase-like protein  43 
 
 		 668 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888363  normal  0.315784 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1978  protein kinase  45.52 
 
 		 482 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193562  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  37.6 
 
 		 596 aa  190  4e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2888  Serine/threonine protein kinase-like protein  43.45 
 
 		 659 aa  191  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.301029  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0774  serine/threonine protein kinase  44.03 
 
 		 595 aa  189  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1544  Serine/threonine protein kinase-like protein  41.7 
 
 		 532 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.372452  normal  0.854726 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2410  serine/threonine protein kinase  42.96 
 
 		 460 aa  189  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  39.7 
 
 		 418 aa  188  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1643  serine/threonine protein kinase  42.46 
 
 		 534 aa  187  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0994433  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  42.63 
 
 		 461 aa  187  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4747  serine/threonine protein kinase  41.18 
 
 		 470 aa  186  8e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2411  serine/threonine protein kinase  41.79 
 
 		 507 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25260  protein kinase family protein  38.81 
 
 		 501 aa  183  6e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.981301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4798  serine/threonine protein kinase  38.55 
 
 		 583 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3421  serine/threonine protein kinase  45.24 
 
 		 391 aa  182  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000661816  hitchhiker  0.000104495 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  34.18 
 
 		 593 aa  180  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  39.21 
 
 		 646 aa  179  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1316  serine/threonine protein kinase  38.44 
 
 		 503 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4028  serine/threonine protein kinase  40.2 
 
 		 493 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0137121  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  38.28 
 
 		 776 aa  176  8e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0026  serine/threonine protein kinase  39.33 
 
 		 444 aa  176  8e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0106  serine/threonine protein kinase  38.34 
 
 		 674 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5242  serine/threonine protein kinase  46.48 
 
 		 581 aa  176  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151896  normal  0.314771 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  38.43 
 
 		 666 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.67 
 
 		 505 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.82 
 
 		 598 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4477  serine/threonine protein kinase  32.34 
 
 		 581 aa  173  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.695669  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3561  serine/threonine protein kinase  45.62 
 
 		 585 aa  173  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2079  serine/threonine protein kinase  35.88 
 
 		 503 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.161295  normal  0.708532 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.42 
 
 		 650 aa  172  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.82 
 
 		 740 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5900  serine/threonine protein kinase  40.23 
 
 		 476 aa  171  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.377642  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04830  serine/threonine protein kinase  35.33 
 
 		 316 aa  171  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0435462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  41.74 
 
 		 673 aa  170  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  39.68 
 
 		 1655 aa  170  6e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0061  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.58 
 
 		 562 aa  169  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7418  serine/threonine protein kinase  36.39 
 
 		 543 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4174  serine/threonine protein kinase  40.64 
 
 		 990 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.957673  normal  0.29957 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  48.34 
 
 		 642 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0144  serine/threonine protein kinase  40.29 
 
 		 650 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  40.79 
 
 		 557 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4395  serine/threonine protein kinase  42.52 
 
 		 465 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2438  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.02 
 
 		 620 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00115665 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  40.15 
 
 		 599 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3213  serine/threonine protein kinase  39.68 
 
 		 498 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0152772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0129  serine/threonine protein kinase  42.52 
 
 		 345 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00190  serine/threonine protein kinase  40.16 
 
 		 663 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.18 
 
 		 627 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0729  serine/threonine protein kinase  37.97 
 
 		 464 aa  164  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44074  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0294  serine/threonine protein kinase  39.37 
 
 		 757 aa  164  3e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0633635  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  35.15 
 
 		 468 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1382  serine/threonine protein kinase  36.43 
 
 		 316 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.4 
 
 		 652 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>