More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_21710 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_21710  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  100 
 
 
185 aa  370  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.649805 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5396  hypothetical protein  57.84 
 
 
187 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12309  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2570  GCN5-related N-acetyltransferase  54.49 
 
 
192 aa  180  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.345636  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5042  GCN5-related N-acetyltransferase  51.65 
 
 
181 aa  164  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668366  normal  0.445888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2370  GCN5-related N-acetyltransferase  49.16 
 
 
189 aa  164  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0983  hypothetical protein  47.16 
 
 
189 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5257  acetyltransferase, putative  38.97 
 
 
200 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.727946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2299  GCN5-related N-acetyltransferase  43.55 
 
 
204 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08539  GNAT family acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03650)  35.6 
 
 
202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2289  GCN5-related N-acetyltransferase  40.61 
 
 
197 aa  111  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2749  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 
207 aa  108  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.583104  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0113  GCN5-related N-acetyltransferase  30.85 
 
 
189 aa  89  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4545  GCN5-related N-acetyltransferase  38.92 
 
 
189 aa  85.9  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0919  hypothetical protein  31.29 
 
 
181 aa  84.3  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1712  GCN5-related N-acetyltransferase  31.95 
 
 
187 aa  84.3  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896279  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0112  hypothetical protein  30.32 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2956  hypothetical protein  32.28 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0502  hypothetical protein  32.28 
 
 
188 aa  82  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2374  GCN5-related N-acetyltransferase  29.45 
 
 
193 aa  82  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.148578  normal  0.427567 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0136  hypothetical protein  30.51 
 
 
188 aa  81.3  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1089  hypothetical protein  34 
 
 
601 aa  79.3  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2259  GCN5-related N-acetyltransferase  28.49 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000198313  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1637  acetyltransferase  26.34 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2792  ribosomal protein N-acetylase-like protein  30.95 
 
 
201 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  32.65 
 
 
207 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2320  GCN5-related N-acetyltransferase  32.92 
 
 
173 aa  77  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2550  GCN5-related N-acetyltransferase  31.87 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1783  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 
190 aa  75.5  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4212  GCN5-related N-acetyltransferase  29.68 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  32.19 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0373  GCN5-related N-acetyltransferase  32.08 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.970254  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3412  GCN5-related N-acetyltransferase  36.56 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.885051 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20860  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  34.69 
 
 
170 aa  74.3  0.0000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1974  hypothetical protein  28.16 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.252487  normal  0.46439 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  29.79 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349296  normal  0.801839 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1003  GCN5-related N-acetyltransferase  32.19 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5041  GCN5-related N-acetyltransferase  33.12 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1891  acetyltransferase  28.25 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2810  acetyltransferase  27.13 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02198  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3219  GCN5-related N-acetyltransferase  31.32 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.143188  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0334  acetyltransferase  27.61 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1088  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
176 aa  72  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65463  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0840  acetyltransferase  28.26 
 
 
185 aa  72  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0138744  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3943  GCN5-related N-acetyltransferase  31.17 
 
 
181 aa  71.2  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000968058  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0900  GCN5-related N-acetyltransferase  32.9 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513382  hitchhiker  0.00121698 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2268  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 
190 aa  71.2  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0926  GCN5-related N-acetyltransferase  30.25 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639831  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2677  GCN5-related N-acetyltransferase  31.17 
 
 
171 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0101732  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1005  GCN5-related N-acetyltransferase  32.04 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1932  GCN5-related N-acetyltransferase  32.04 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1660  GCN5-related N-acetyltransferase  30.34 
 
 
166 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000280495  normal  0.382849 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4484  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28 
 
 
168 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6386  GCN5-related N-acetyltransferase  31.01 
 
 
196 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00725822 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4634  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 
206 aa  68.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.490299  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0144  acetyltransferase  32.93 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.660916  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0441  GCN5-related N-acetyltransferase  33.99 
 
 
202 aa  68.9  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0553  GCN5-related N-acetyltransferase  32.63 
 
 
195 aa  68.9  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0153  GCN5-related N-acetyltransferase  31.68 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531944  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1173  GCN5-related N-acetyltransferase  30.19 
 
 
195 aa  68.9  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1769  GCN5-related N-acetyltransferase  30.26 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171854  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4446  acetyltransferase  28 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.949941  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4677  GCN5-related N-acetyltransferase  32.5 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121511  normal  0.198748 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4637  GCN5-related N-acetyltransferase  28.88 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00311886  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1311  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  28.19 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1931  GCN5-related N-acetyltransferase  30.29 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000333496  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  31.08 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1780  acetyltransferase  31.33 
 
 
216 aa  67.8  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3007  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
221 aa  67.8  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0903  putative acetyltransferase  29.49 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0509  GCN5-related N-acetyltransferase  30.25 
 
 
176 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1848  acetyltransferase  31.33 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0757  GCN5-related N-acetyltransferase  29.75 
 
 
181 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583099  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3126  acetyltransferase  29.41 
 
 
181 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.731723  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4109  acetyltransferase  27.33 
 
 
168 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1634  GCN5-related N-acetyltransferase  31.79 
 
 
178 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3425  acetyltransferase, gnat family  29.41 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  29.05 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329985  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2709  GCN5-related N-acetyltransferase  31.79 
 
 
178 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000725277 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1897  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
170 aa  67.4  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.312294 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0233  GCN5-related N-acetyltransferase  31.37 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113793  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4286  acetyltransferase  32.05 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4763  acetyltransferase  29.12 
 
 
178 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000011701  decreased coverage  0.000662492 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3442  GCN5-related N-acetyltransferase  34.44 
 
 
170 aa  67  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.140269  normal  0.219555 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5164  acetyltransferase, putative  27.81 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  26 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000065025  normal  0.148419 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4445  acetyltransferase, GNAT family  27.33 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4098  acetyltransferase  27.33 
 
 
168 aa  67  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05770  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  32.91 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.732888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0657  GCN5-related N-acetyltransferase  29.68 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000154743  normal  0.388985 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  28.49 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4593  acetyltransferase  27.33 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4439  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2013  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0752  acetyltransferase, GNAT family  26.67 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1733  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.22 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0110114 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3517  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.12 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1936  GCN5-related N-acetyltransferase  24.87 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  26 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>