59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_17240 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2031  hypothetical protein  66.82 
 
 		 1125 aa  1409    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2220  hypothetical protein  57.54 
 
 		 1120 aa  1211    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0950228  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17240  hypothetical protein  100 
 
 		 1114 aa  2245    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1565  hypothetical protein  42.62 
 
 		 1151 aa  767    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0273  hypothetical protein  36.13 
 
 		 1146 aa  555  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.930301  decreased coverage  0.00283769 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4003  hypothetical protein  28.25 
 
 		 1126 aa  332  2e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417635  normal  0.020693 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03539  putative ATP-binding protein  29.08 
 
 		 1143 aa  316  1.9999999999999998e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12714  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26370  hypothetical protein  27.38 
 
 		 1128 aa  300  9e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0063  putative ATP-binding protein  27.73 
 
 		 1136 aa  298  3e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3162  putative ATP-binding protein  28.31 
 
 		 1124 aa  292  3e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0868  hypothetical protein  27.65 
 
 		 1137 aa  265  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3940  putative ATP-binding protein  27.11 
 
 		 1154 aa  260  9e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22910  hypothetical protein  27.65 
 
 		 1118 aa  256  2.0000000000000002e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3738  putative ATP-binding protein  26.48 
 
 		 1153 aa  250  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1172  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1120 aa  226  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0863  hypothetical protein  25 
 
 		 1120 aa  224  9e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0880  hypothetical protein  25 
 
 		 1120 aa  224  9e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0869  hypothetical protein  24.91 
 
 		 1118 aa  223  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0516  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1121 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.536264 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5159  hypothetical protein  24.25 
 
 		 1126 aa  216  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236742  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2064  hypothetical protein  26.02 
 
 		 1120 aa  210  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.203107  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2294  hypothetical protein  25.69 
 
 		 1125 aa  205  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2513  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1121 aa  204  6e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844396  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  24.64 
 
 		 1121 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0015  conserved hypothetical cytosolic protein  25.52 
 
 		 1124 aa  199  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0892  hypothetical protein  23.86 
 
 		 1121 aa  197  9e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1121 aa  197  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  24.34 
 
 		 1122 aa  196  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1444  hypothetical protein  24.2 
 
 		 1121 aa  196  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  25.6 
 
 		 1140 aa  189  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2187  hypothetical protein  23.76 
 
 		 1143 aa  187  7e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.671764  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  24.43 
 
 		 1123 aa  187  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0424  hypothetical protein  27.35 
 
 		 1181 aa  187  8e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.924929  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0843  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1125 aa  185  5.0000000000000004e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2280  hypothetical protein  23.38 
 
 		 1144 aa  183  2e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03620  hypothetical protein  24.59 
 
 		 1166 aa  176  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.688607 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1628  conserved hypothetical cytosolic protein  23.94 
 
 		 1130 aa  166  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0224  hypothetical protein  24.23 
 
 		 1133 aa  155  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1125  conserved hypothetical cytosolic protein  22.38 
 
 		 1133 aa  149  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3697  hypothetical protein  25.5 
 
 		 694 aa  140  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000334148 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49810  hypothetical protein  22.15 
 
 		 979 aa  140  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03270  hypothetical protein  22.58 
 
 		 1045 aa  140  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000014033  unclonable  1.7381799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0741  hypothetical protein  29.9 
 
 		 352 aa  83.6  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0775  MukB N-terminal domain/M protein repeat protein  19.97 
 
 		 1113 aa  60.8  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0308162 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3696  hypothetical protein  23.53 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000237881 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0583  SMC domain-containing protein  23.55 
 
 		 1109 aa  58.5  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0490  chromosome segregation ATPases-like  24.53 
 
 		 1207 aa  54.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2729  hypothetical protein  22.37 
 
 		 1141 aa  54.3  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2223  hypothetical protein  23.84 
 
 		 1138 aa  54.3  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.651164 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0875  hypothetical protein  22.36 
 
 		 462 aa  53.9  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2434  hypothetical protein  26.13 
 
 		 1159 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.0878063 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0795  hypothetical protein  31.01 
 
 		 1145 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.517535 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2156  hypothetical protein  26.13 
 
 		 1159 aa  53.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2117  conserved hypothetical proteinn  30.4 
 
 		 1159 aa  52  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3062  hypothetical protein  23.01 
 
 		 1140 aa  50.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0670  chromosome segregation ATPase-like protein  23.19 
 
 		 1159 aa  47.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1779  cell division protein MukB  37.68 
 
 		 1479 aa  45.4  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2299  cell division protein MukB  37.68 
 
 		 1478 aa  45.4  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2051  cell division protein MukB  37.68 
 
 		 1479 aa  45.1  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0962316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>