More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0476 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4483  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  79.8 
 
 
682 aa  1156    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3884  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  61.47 
 
 
686 aa  872    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.913505  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0482  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  61.47 
 
 
686 aa  859    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0476  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  100 
 
 
688 aa  1416    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3201  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  40.78 
 
 
924 aa  490  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243991 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1646  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  37.74 
 
 
705 aa  464  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.106603  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2049  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  39.03 
 
 
907 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.564098  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  37.72 
 
 
706 aa  426  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.630914  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06914  prolyl oligopeptidase  35.92 
 
 
655 aa  372  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000910  putative peptidase  36.17 
 
 
640 aa  369  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.982884  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6730  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.14 
 
 
632 aa  353  5e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.907657  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  32.66 
 
 
630 aa  340  5.9999999999999996e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5922  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.78 
 
 
626 aa  339  9e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1266  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.44 
 
 
631 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.211135  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.33 
 
 
641 aa  337  5e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1803  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  32.93 
 
 
731 aa  337  5e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184836  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1930  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  33.91 
 
 
646 aa  334  3e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2643  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.08 
 
 
644 aa  333  7.000000000000001e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.7 
 
 
629 aa  329  1.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.262385  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0377  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.24 
 
 
626 aa  324  3e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.85 
 
 
626 aa  324  4e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1886  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.23 
 
 
636 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.28 
 
 
626 aa  320  5e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.111113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8147  hypothetical protein  32.73 
 
 
634 aa  320  7.999999999999999e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1669  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.81 
 
 
629 aa  318  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.97 
 
 
626 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.53 
 
 
655 aa  310  5.9999999999999995e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03802  dipeptidyl anminopeptidase  31.89 
 
 
694 aa  310  5.9999999999999995e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.65 
 
 
642 aa  299  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_002950  PG1004  prolyl oligopeptidase family protein  31.61 
 
 
759 aa  290  5.0000000000000004e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17781  hypothetical protein  31.56 
 
 
681 aa  290  6e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4772  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.2 
 
 
632 aa  288  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5159  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.42 
 
 
666 aa  278  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.017012  decreased coverage  0.000228688 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3714  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.44 
 
 
650 aa  262  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0706  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.6 
 
 
656 aa  261  4e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.155251 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0702  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.48 
 
 
665 aa  253  7e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0365  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.87 
 
 
632 aa  249  8e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  28.18 
 
 
678 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0048  prolyl oligopeptidase family protein  28.59 
 
 
642 aa  226  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.436282  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0322  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.51 
 
 
653 aa  226  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0395751  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0398  peptidase  28.65 
 
 
657 aa  220  7.999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0594  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.47 
 
 
623 aa  220  8.999999999999998e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4618  prolyl oligopeptidase family protein  31.03 
 
 
645 aa  217  5e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.61 
 
 
644 aa  216  8e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.22 
 
 
645 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.06 
 
 
645 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.22 
 
 
645 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0003  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.21 
 
 
665 aa  214  4.9999999999999996e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0469  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.62 
 
 
638 aa  211  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.61 
 
 
652 aa  211  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3803  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.93 
 
 
645 aa  210  9e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6032 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0897  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.04 
 
 
600 aa  207  4e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.835581  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4252  prolyl oligopeptidase family protein  29.45 
 
 
662 aa  201  5e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.42 
 
 
657 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00542478  unclonable  0.0000000539912 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3601  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.37 
 
 
661 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.06 
 
 
597 aa  198  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000276973  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0381  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.17 
 
 
654 aa  198  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217468  unclonable  0.000000000177281 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3774  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.41 
 
 
661 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.455998 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3832  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.28 
 
 
659 aa  197  7e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0373  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.71 
 
 
662 aa  196  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.265704  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0384  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.86 
 
 
662 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290431  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.86 
 
 
662 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0323  prolyl oligopeptidase family protein  27.74 
 
 
649 aa  195  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3485  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.74 
 
 
654 aa  193  9e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0398  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.66 
 
 
662 aa  193  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000316056 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00624  prolyl oligopeptidase  27.93 
 
 
653 aa  192  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0355  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.97 
 
 
662 aa  192  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0844  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.15 
 
 
646 aa  192  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3841  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.95 
 
 
654 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.16 
 
 
615 aa  191  5.999999999999999e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.75 
 
 
662 aa  187  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179177  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.18 
 
 
594 aa  187  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3833  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.89 
 
 
649 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.18 
 
 
634 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3064  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.13 
 
 
755 aa  184  5.0000000000000004e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.366531  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3063  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.98 
 
 
688 aa  182  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2025  prolyl oligopeptidase family protein  29.53 
 
 
636 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00251963  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3234  acylamino-acid-releasing enzyme  25.84 
 
 
596 aa  181  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  38.08 
 
 
645 aa  180  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.54 
 
 
653 aa  181  5.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0834  hypothetical protein  26.43 
 
 
648 aa  178  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.386873  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0522  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.7 
 
 
610 aa  177  8e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450113  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.86 
 
 
642 aa  174  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0494  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.24 
 
 
685 aa  174  3.9999999999999995e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0656758  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1087  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.65 
 
 
650 aa  174  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.393964  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0129  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.34 
 
 
665 aa  174  6.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.286088 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0078  prolyl oligopeptidase family protein  36.09 
 
 
665 aa  172  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.7 
 
 
656 aa  167  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.65 
 
 
607 aa  167  9e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.530992  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4261  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.06 
 
 
652 aa  163  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4496  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.96 
 
 
657 aa  161  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.597999  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3511  prolyl oligopeptidase family protein  32.4 
 
 
638 aa  161  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0312  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.8 
 
 
588 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6348  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.44 
 
 
629 aa  158  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1112  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.78 
 
 
656 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245577  normal  0.568355 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2910  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  32.5 
 
 
606 aa  146  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3931  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.77 
 
 
695 aa  145  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2468  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.14 
 
 
628 aa  144  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.39 
 
 
596 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0194  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.44 
 
 
638 aa  142  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>