More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0367 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  72.66 
 
 
429 aa  654    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  72.9 
 
 
807 aa  655    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0367  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 
428 aa  874    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0517  adenylosuccinate synthetase  70.33 
 
 
428 aa  622  1e-177  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  69.86 
 
 
427 aa  624  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4777  adenylosuccinate synthetase  72.66 
 
 
429 aa  619  1e-176  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.545109  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  70.79 
 
 
427 aa  615  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  66.82 
 
 
427 aa  613  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  67.06 
 
 
427 aa  610  1e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  70.56 
 
 
427 aa  609  1e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  67.29 
 
 
427 aa  607  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0176  adenylosuccinate synthetase  68.22 
 
 
427 aa  597  1e-169  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386224  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5137  adenylosuccinate synthetase  68.79 
 
 
433 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0677  adenylosuccinate synthetase  67.92 
 
 
431 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10362  adenylosuccinate synthetase  66.82 
 
 
432 aa  578  1e-164  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698825  normal  0.94506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0504  adenylosuccinate synthetase  68.16 
 
 
431 aa  579  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0515  adenylosuccinate synthetase  68.16 
 
 
431 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4635  adenylosuccinate synthetase  64.72 
 
 
427 aa  578  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0228  adenylosuccinate synthetase  67.29 
 
 
431 aa  580  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.043517  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4054  adenylosuccinate synthetase  68.22 
 
 
428 aa  580  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.441295  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6908  adenylosuccinate synthetase  68.69 
 
 
429 aa  580  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4344  adenylosuccinate synthetase  64.12 
 
 
432 aa  579  1e-164  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0526  adenylosuccinate synthetase  68.16 
 
 
431 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38190  adenylosuccinate synthetase  68.69 
 
 
428 aa  576  1.0000000000000001e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2416  adenylosuccinate synthetase  63.55 
 
 
428 aa  571  1.0000000000000001e-162  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  65.17 
 
 
430 aa  568  1e-160  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3635  adenylosuccinate synthetase  64.72 
 
 
429 aa  566  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.336244 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35160  Adenylosuccinate synthetase  63.79 
 
 
429 aa  566  1e-160  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0667  adenylosuccinate synthetase  63.08 
 
 
429 aa  565  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0522  adenylosuccinate synthetase  63.55 
 
 
429 aa  567  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  64.1 
 
 
428 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08920  adenylosuccinate synthetase  62.38 
 
 
432 aa  559  1e-158  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  61.21 
 
 
428 aa  548  1e-155  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2963  adenylosuccinate synthetase  60.98 
 
 
428 aa  545  1e-154  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17225  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4119  adenylosuccinate synthetase  60.75 
 
 
428 aa  546  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0180773  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02210  adenylosuccinate synthetase  62.15 
 
 
429 aa  539  9.999999999999999e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05720  adenylosuccinate synthetase  58.6 
 
 
445 aa  529  1e-149  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.196579  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  59.03 
 
 
433 aa  522  1e-147  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  58.55 
 
 
434 aa  508  1e-143  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  56.07 
 
 
427 aa  486  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0025  adenylosuccinate synthetase  54.95 
 
 
426 aa  480  1e-134  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.993316  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27840  Adenylosuccinate synthetase  52.87 
 
 
438 aa  472  1e-132  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  52.57 
 
 
427 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  53.94 
 
 
428 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  55.56 
 
 
427 aa  464  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0035  adenylosuccinate synthetase  55.17 
 
 
438 aa  464  1e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  53.52 
 
 
430 aa  463  1e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  53.43 
 
 
447 aa  458  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  53.43 
 
 
447 aa  458  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  52.58 
 
 
430 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  52.25 
 
 
447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1958  adenylosuccinate synthetase  55.11 
 
 
425 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1667  adenylosuccinate synthetase  53.66 
 
 
439 aa  453  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  52.48 
 
 
444 aa  452  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  52.01 
 
 
426 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  52.58 
 
 
428 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  52.01 
 
 
437 aa  454  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  52.35 
 
 
428 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0691  adenylosuccinate synthetase  53.46 
 
 
439 aa  449  1e-125  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  52.35 
 
 
429 aa  450  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  52.25 
 
 
444 aa  450  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  51.54 
 
 
449 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5915  adenylosuccinate synthetase  53.86 
 
 
439 aa  447  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  51.77 
 
 
437 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  51.98 
 
 
426 aa  445  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  52 
 
 
429 aa  445  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  52 
 
 
431 aa  442  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  51.29 
 
 
427 aa  443  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07421  adenylosuccinate synthetase  52.01 
 
 
439 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  53.66 
 
 
427 aa  441  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05331  adenylosuccinate synthetase  51.77 
 
 
436 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  51.19 
 
 
427 aa  439  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2419  adenylosuccinate synthetase  51.18 
 
 
424 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000351382  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0507  adenylosuccinate synthetase  52.01 
 
 
436 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  52.69 
 
 
430 aa  441  9.999999999999999e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05631  adenylosuccinate synthetase  51.3 
 
 
436 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 
428 aa  436  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  51.76 
 
 
432 aa  436  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  51.77 
 
 
434 aa  436  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  51.89 
 
 
430 aa  436  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 
424 aa  438  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  51.4 
 
 
451 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  51.05 
 
 
433 aa  432  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5320  adenylosuccinate synthetase  51.88 
 
 
429 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000159422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5148  adenylosuccinate synthetase  51.88 
 
 
429 aa  434  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.87247e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5716  adenylosuccinate synthetase  51.88 
 
 
429 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000188586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5577  adenylosuccinate synthetase  51.88 
 
 
429 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85689e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  51.53 
 
 
432 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0990  adenylosuccinate synthetase  54.82 
 
 
429 aa  433  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  51.06 
 
 
433 aa  432  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  52.96 
 
 
430 aa  431  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  48.94 
 
 
428 aa  428  1e-119  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05701  adenylosuccinate synthetase  50.83 
 
 
436 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0017  adenylosuccinate synthetase  50.24 
 
 
427 aa  431  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000177457  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0017  adenylosuccinate synthetase  50.24 
 
 
427 aa  431  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  51.53 
 
 
429 aa  431  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  50.59 
 
 
434 aa  431  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1280  adenylosuccinate synthetase  51.3 
 
 
427 aa  426  1e-118  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2532  adenylosuccinate synthetase  52.01 
 
 
445 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0492  adenylosuccinate synthetase  52.72 
 
 
428 aa  426  1e-118  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>