More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4417 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_4417  methyltransferase type 11  100 
 
 
269 aa  545  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.587336 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1222  methyltransferase  61.76 
 
 
272 aa  331  7.000000000000001e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2026  Methyltransferase type 11  55.77 
 
 
261 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508606  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2248  Methyltransferase type 11  56.76 
 
 
261 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.586689  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1358  methyltransferase type 11  45.04 
 
 
271 aa  199  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4078  methyltransferase type 11  40 
 
 
259 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  38.28 
 
 
226 aa  139  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  45.45 
 
 
226 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.87 
 
 
253 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.48 
 
 
255 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.94 
 
 
253 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.9 
 
 
259 aa  124  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  41.94 
 
 
226 aa  122  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0198  UbiE/COQ5 methyltransferase  40.65 
 
 
252 aa  120  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.537911  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.4 
 
 
250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  32.56 
 
 
262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  28.68 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1279  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.74 
 
 
253 aa  116  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.13 
 
 
250 aa  110  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  35.57 
 
 
210 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  38.16 
 
 
248 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0543  Methyltransferase type 11  28.22 
 
 
247 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  34.39 
 
 
225 aa  101  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0352  Methyltransferase type 11  28.29 
 
 
249 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 
250 aa  99  7e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0468  hypothetical protein  29.07 
 
 
249 aa  97.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.36 
 
 
155 aa  95.1  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  29.36 
 
 
257 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  30.56 
 
 
244 aa  93.2  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2762  Methyltransferase type 11  34.67 
 
 
265 aa  92  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.55 
 
 
230 aa  91.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  29.39 
 
 
258 aa  89.4  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0720  hypothetical protein  25.11 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04480  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.4 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.110079  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0342  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 
252 aa  79  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0474  hypothetical protein  32.24 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2984  methyltransferase type 11  34.03 
 
 
227 aa  75.1  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4096  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.45 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.79 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3373  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.45 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
335 aa  72  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  28.9 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.46 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  32.64 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2653  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.08 
 
 
232 aa  67.4  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4199  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  32.45 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40.57 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0461  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  31.13 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  30.13 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  39.25 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.49 
 
 
258 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  39.64 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0084  methyltransferase type 11  33.53 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0094  methyltransferase type 11  33.53 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0103  methyltransferase type 11  33.53 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  31.94 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3895  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.54 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.4649  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0431  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.54 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159062  hitchhiker  0.0000667 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.54 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1652  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.48 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.583368 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0445  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.54 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187756  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0475  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  34.56 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  30.6 
 
 
283 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  34.93 
 
 
341 aa  65.1  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0506  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.54 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3551  demethylmenaquinone methyltransferase  31.79 
 
 
251 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0405  demethylmenaquinone methyltransferase  31.79 
 
 
251 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.403287  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3725  demethylmenaquinone methyltransferase  31.79 
 
 
251 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 
267 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  33.03 
 
 
275 aa  63.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  37.07 
 
 
280 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3792  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.14 
 
 
251 aa  63.9  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4115  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.33 
 
 
212 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6211  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  32.9 
 
 
225 aa  63.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3202  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  31.13 
 
 
251 aa  62.8  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.67 
 
 
228 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
272 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5011  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.75 
 
 
256 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4885  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.75 
 
 
256 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  28.67 
 
 
233 aa  62.4  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1497  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.14 
 
 
212 aa  62  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03490  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.82 
 
 
261 aa  62  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.92 
 
 
229 aa  61.2  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0387  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.79 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  34.55 
 
 
265 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7094  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.28 
 
 
244 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000661752  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1326  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.5 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 
195 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  34.43 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0008  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  40.51 
 
 
199 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257422  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0604  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.3 
 
 
212 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.977459  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  29.22 
 
 
231 aa  60.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  30.41 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0415  methyltransferase type 11  29.52 
 
 
278 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.670256 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0988  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.43 
 
 
212 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.387372  decreased coverage  0.00000591406 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3961  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29.58 
 
 
212 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.57 
 
 
266 aa  61.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32 
 
 
230 aa  61.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  37.38 
 
 
298 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>