More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0766 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0766  leucyl aminopeptidase  100 
 
 
497 aa  1002    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.133463 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1545  leucyl aminopeptidase  70.68 
 
 
497 aa  669    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.87214  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  65.54 
 
 
497 aa  639    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1070  leucyl aminopeptidase  74.25 
 
 
496 aa  764    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32941  decreased coverage  0.00000385423 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1756  leucyl aminopeptidase  64.92 
 
 
495 aa  641    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.09073  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1214  leucyl aminopeptidase  74.85 
 
 
496 aa  766    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0455494  decreased coverage  0.00000170751 
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  65.14 
 
 
497 aa  634  1e-180  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  63.86 
 
 
498 aa  629  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3470  leucyl aminopeptidase  58.93 
 
 
500 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.987898  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1462  leucyl aminopeptidase  62.09 
 
 
498 aa  572  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1676  leucyl aminopeptidase  62.47 
 
 
500 aa  571  1e-161  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.933774  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  61.79 
 
 
497 aa  560  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2314  leucyl aminopeptidase  63.17 
 
 
499 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.916882  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3832  leucyl aminopeptidase  62.39 
 
 
499 aa  556  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.454822 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2339  leucyl aminopeptidase  60.98 
 
 
500 aa  557  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2481  leucyl aminopeptidase  58.4 
 
 
500 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2965  leucyl aminopeptidase  60.94 
 
 
500 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434941  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0650  leucyl aminopeptidase  58.11 
 
 
542 aa  527  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2221  Leucyl aminopeptidase  59.88 
 
 
539 aa  527  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.258541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0557  leucyl aminopeptidase  58.17 
 
 
503 aa  523  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0287473 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5835  peptidase M17 leucyl aminopeptidase domain protein  59 
 
 
500 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3944  Leucyl aminopeptidase  57.48 
 
 
497 aa  504  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253806  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5097  leucyl aminopeptidase  59.35 
 
 
500 aa  498  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803796  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3651  leucyl aminopeptidase  57.26 
 
 
497 aa  498  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3937  Leucyl aminopeptidase  57.83 
 
 
497 aa  496  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0971426 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0454  leucyl aminopeptidase  53.98 
 
 
500 aa  489  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2531  leucyl aminopeptidase  56.96 
 
 
493 aa  456  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.353426  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3051  Leucyl aminopeptidase  51.01 
 
 
487 aa  438  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00163591  normal  0.235432 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1227  leucyl aminopeptidase  47.94 
 
 
494 aa  432  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.494822 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1204  leucyl aminopeptidase  51.75 
 
 
514 aa  419  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.453819  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1122  leucyl aminopeptidase  54.3 
 
 
489 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.289699 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1761  leucyl aminopeptidase  50 
 
 
481 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_002978  WD0054  leucyl aminopeptidase  49.31 
 
 
500 aa  415  1e-114  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1191  leucyl aminopeptidase  56.53 
 
 
488 aa  412  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239585  normal  0.359971 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0642  leucyl aminopeptidase  46.46 
 
 
500 aa  404  1e-111  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0412  leucyl aminopeptidase  49.11 
 
 
489 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0249677 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0369  leucyl aminopeptidase  45.92 
 
 
500 aa  396  1e-109  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1815  leucyl aminopeptidase  51.84 
 
 
488 aa  393  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0890  leucyl aminopeptidase  52.42 
 
 
485 aa  386  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119935  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1543  leucyl aminopeptidase  55.38 
 
 
489 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2899  leucyl aminopeptidase  55.38 
 
 
489 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.886783  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  45.74 
 
 
497 aa  373  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0903  leucyl aminopeptidase  50.84 
 
 
533 aa  362  6e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0577205 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0961  leucyl aminopeptidase  44.09 
 
 
500 aa  354  2.9999999999999997e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0950  leucyl aminopeptidase  52.59 
 
 
491 aa  353  4e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111685  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  45.77 
 
 
496 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  43.04 
 
 
496 aa  348  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  44.7 
 
 
496 aa  346  5e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  45.31 
 
 
497 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0475  cytosol aminopeptidase  45.14 
 
 
506 aa  345  2e-93  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00320613  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  42.7 
 
 
491 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1725  Leucyl aminopeptidase  48.6 
 
 
496 aa  343  4e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1921  PepA aminopeptidase  48.14 
 
 
496 aa  342  1e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428802  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0616  leucyl aminopeptidase  41.7 
 
 
508 aa  341  2e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1091  leucyl aminopeptidase  45.67 
 
 
496 aa  339  5e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  43.78 
 
 
497 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  43.78 
 
 
497 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  44.24 
 
 
496 aa  338  9.999999999999999e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  43.94 
 
 
487 aa  338  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3514  leucyl aminopeptidase  41.1 
 
 
510 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1018  leucyl aminopeptidase  43.55 
 
 
497 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0289  leucyl aminopeptidase  42.56 
 
 
501 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.823293  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3443  Leucyl aminopeptidase  41.1 
 
 
510 aa  336  5e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3637  leucyl aminopeptidase  41.1 
 
 
510 aa  336  5e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0850  leucyl aminopeptidase  39.3 
 
 
510 aa  336  7e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3527  leucyl aminopeptidase  44.05 
 
 
512 aa  335  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00117428  normal  0.357164 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0897  leucyl aminopeptidase  41.1 
 
 
518 aa  335  1e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2140  Leucyl aminopeptidase  41.85 
 
 
496 aa  334  2e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727293  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0746  leucyl aminopeptidase  43.69 
 
 
518 aa  333  6e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.483343  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2996  leucyl aminopeptidase  40.54 
 
 
515 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0978  Leucyl aminopeptidase  43.91 
 
 
506 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1748  leucyl aminopeptidase  40.7 
 
 
493 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0802  leucyl aminopeptidase  38.68 
 
 
511 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.515855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3221  leucyl aminopeptidase  38.68 
 
 
511 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14470  leucyl aminopeptidase  42.28 
 
 
495 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3324  peptidase M17, leucyl aminopeptidase domain-containing protein  38.68 
 
 
511 aa  326  6e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1282  leucyl aminopeptidase  44 
 
 
495 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4252  leucyl aminopeptidase  42.79 
 
 
495 aa  325  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2676  leucyl aminopeptidase  42.39 
 
 
511 aa  325  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321125  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  43.24 
 
 
488 aa  324  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1372  PepA aminopeptidase  47.51 
 
 
500 aa  323  5e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00219967  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3638  leucyl aminopeptidase  44.44 
 
 
508 aa  322  8e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2787  leucyl aminopeptidase  43.64 
 
 
499 aa  322  9.000000000000001e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151843  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0959  cytosol aminopeptidase  41.32 
 
 
511 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3082  leucyl aminopeptidase  42.6 
 
 
498 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0737217 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  41.46 
 
 
492 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  39.61 
 
 
496 aa  320  3e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2389  leucyl aminopeptidase  44.97 
 
 
556 aa  320  3e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0738051 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0984  leucyl aminopeptidase  44.14 
 
 
508 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2730  Leucyl aminopeptidase  44.47 
 
 
511 aa  320  3.9999999999999996e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.387562  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0828  leucyl aminopeptidase  43.29 
 
 
503 aa  319  7e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871802  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0558  PepA aminopeptidase  44.5 
 
 
497 aa  319  7e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.548083  hitchhiker  0.0000733214 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4007  leucyl aminopeptidase  43.23 
 
 
486 aa  318  1e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.502988 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0332  leucyl aminopeptidase  43.26 
 
 
496 aa  318  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00199325  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2099  aminopeptidase A/I  42.21 
 
 
497 aa  318  2e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.41187  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2225  leucyl aminopeptidase  42.76 
 
 
503 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0871  leucyl aminopeptidase  47.52 
 
 
502 aa  318  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0238632  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2408  PepA aminopeptidase  46.08 
 
 
507 aa  317  3e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.729851  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0516  leucyl aminopeptidase  39.52 
 
 
495 aa  316  6e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.204663  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3539  leucyl aminopeptidase  45.41 
 
 
525 aa  315  8e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0102895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>