150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0061 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0061  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  581  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2653  hypothetical protein  76.39 
 
 
290 aa  436  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146997  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5146  hypothetical protein  74.22 
 
 
290 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.886963  normal  0.124593 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3300  hypothetical protein  76.04 
 
 
290 aa  433  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.861492  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4019  hypothetical protein  57.54 
 
 
292 aa  329  3e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1629  hypothetical protein  53.82 
 
 
296 aa  298  7e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1587  methylglyoxal synthase-like protein  47 
 
 
318 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0187012  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2651  methylglyoxal synthase  43.28 
 
 
140 aa  87.4  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957792  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1252  Methylglyoxal synthase-like protein  41.79 
 
 
328 aa  86.7  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0594  methylglyoxal synthase  43.69 
 
 
128 aa  81.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.444681  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2484  methylglyoxal synthase  46.67 
 
 
133 aa  80.1  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2082  methylglyoxal synthase  38.1 
 
 
120 aa  77.8  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3178  methylglyoxal synthase  49.04 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0985  methylglyoxal synthase  39.5 
 
 
135 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0342245  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0496  methylglyoxal synthase  46.6 
 
 
144 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0366  methylglyoxal synthase  35.85 
 
 
126 aa  74.7  0.000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1333  methylglyoxal synthase  43.69 
 
 
125 aa  74.7  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2504  methylglyoxal synthase  45.71 
 
 
130 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156833  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1275  methylglyoxal synthase  44.23 
 
 
128 aa  73.2  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.418994  hitchhiker  0.00000238684 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4130  methylglyoxal synthase  42.86 
 
 
126 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.070186  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2192  methylglyoxal synthase  39.52 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1798  methylglyoxal synthase  43.69 
 
 
123 aa  72.4  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061495  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1163  methylglyoxal synthase  40.95 
 
 
128 aa  72  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.618904  normal  0.0141735 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2185  methylglyoxal synthase  45.28 
 
 
135 aa  72  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0445857  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1706  methylglyoxal synthase  46.3 
 
 
130 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2061  methylglyoxal synthase  45.19 
 
 
129 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337955  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1048  methylglyoxal synthase  40.78 
 
 
125 aa  70.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171658  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0986  methylglyoxal synthase  40.78 
 
 
125 aa  70.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1459  methylglyoxal synthase  41.75 
 
 
131 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0146321  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0792  methylglyoxal synthase  43.81 
 
 
140 aa  70.5  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52468  normal  0.131121 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1662  methylglyoxal synthase  41.75 
 
 
131 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1443  methylglyoxal synthase  41.75 
 
 
131 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0250107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1415  methylglyoxal synthase  41.75 
 
 
131 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0291451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1416  methylglyoxal synthase  41.75 
 
 
131 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.032143  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1556  methylglyoxal synthase  41.75 
 
 
131 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1627  methylglyoxal synthase  41.75 
 
 
131 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.15767 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1700  methylglyoxal synthase  41.75 
 
 
131 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277502  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0967  methylglyoxal synthase  40.78 
 
 
123 aa  70.1  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1589  methylglyoxal synthase  41.75 
 
 
131 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3756  methylglyoxal synthase  41.75 
 
 
131 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00533  methylglyoxal synthase  37.29 
 
 
136 aa  70.1  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0241  methylglyoxal synthase  42.2 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2291  methylglyoxal synthase  43.27 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4588  methylglyoxal synthase  42.31 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1257  methylglyoxal synthase  41.75 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2314  methylglyoxal synthase  43.27 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.659726 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0987  methylglyoxal synthase  43.27 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1982  methylglyoxal synthase  41.96 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2382  methylglyoxal synthase  41.96 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579764  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1679  methylglyoxal synthase  43.27 
 
 
130 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0255708  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1077  methylglyoxal synthase  37.96 
 
 
156 aa  68.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.330764  hitchhiker  0.000000505204 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2072  methylglyoxal synthase  41.67 
 
 
126 aa  67.8  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.326665 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3256  methylglyoxal synthase  43.27 
 
 
129 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308691  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1304  methylglyoxal synthase  43.27 
 
 
129 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.206043  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0240  methylglyoxal synthase  40.19 
 
 
126 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.822912  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1881  methylglyoxal synthase  43.27 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1390  methylglyoxal synthase  43.27 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3603  cyclic nucleotide-binding protein  36.11 
 
 
322 aa  67  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.181046  normal  0.223623 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1079  methylglyoxal synthase  43.27 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.233114  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0788  methylglyoxal synthase  43.27 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0615906  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1235  methylglyoxal synthase  43.27 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1244  methylglyoxal synthase  43.27 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0362  methylglyoxal synthase  43.27 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.607553  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5618  methylglyoxal synthase  43.27 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0573538  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1018  methylglyoxal synthase  43.27 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.736302  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2329  methylglyoxal synthase  42.31 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4444  methylglyoxal synthase  40.95 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2207  methylglyoxal synthase  42.31 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.093882  normal  0.861141 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3368  methylglyoxal synthase  39.05 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378138  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04890  Dephospho-CoA kinase  36.79 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544377  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0233  methylglyoxal synthase  40.74 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0194  methylglyoxal synthase  41.75 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2123  methylglyoxal synthase  38.83 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336211  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1558  methylglyoxal synthase  36.43 
 
 
159 aa  65.1  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.296029  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1760  methylglyoxal synthase  39.62 
 
 
152 aa  65.1  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0497546  hitchhiker  0.0006316 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0707  methylglyoxal synthase  35.88 
 
 
120 aa  63.9  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3450  methylglyoxal synthase  39.81 
 
 
156 aa  62.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000281554  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3100  methylglyoxal synthase  35.34 
 
 
159 aa  62.8  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000537533  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1248  methylglyoxal synthase  35.96 
 
 
126 aa  62.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.10803  normal  0.0156923 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_145  methylglyoxal synthase  38.53 
 
 
144 aa  62.4  0.000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0918  methylglyoxal synthase  33.33 
 
 
158 aa  62.4  0.000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.502742  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1097  methylglyoxal synthase  33.33 
 
 
143 aa  62.4  0.000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1568  methylglyoxal synthase  37.29 
 
 
166 aa  62  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1634  methylglyoxal synthase  37.29 
 
 
166 aa  62  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2625  methylglyoxal synthase  32.59 
 
 
158 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3595  methylglyoxal synthase  38.83 
 
 
137 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0116  methylglyoxal synthase  39.42 
 
 
152 aa  61.6  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.503426  normal  0.542869 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21210  methylglyoxal synthase  33.08 
 
 
148 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846941  normal  0.0527752 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2719  methylglyoxal synthase  32.59 
 
 
158 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1240  methylglyoxal synthase  32.59 
 
 
158 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.259258  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2381  methylglyoxal synthase  36.89 
 
 
156 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0265896  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2526  methylglyoxal synthase  33.62 
 
 
160 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.487727 
 
 
-
 
NC_002936  DET0137  methylglyoxal synthase  38.53 
 
 
144 aa  59.7  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0042  methylglyoxal synthase  39.05 
 
 
127 aa  59.3  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.304097 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1309  methylglyoxal synthase  35.58 
 
 
141 aa  58.9  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.871383  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1077  methylglyoxal synthase  36.89 
 
 
119 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2852  methylglyoxal synthase  37.74 
 
 
152 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.069917  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0611  methylglyoxal synthase  35.09 
 
 
155 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2543  methylglyoxal synthase  37.74 
 
 
152 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00778094  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1265  methylglyoxal synthase  36.89 
 
 
119 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.357495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>