More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2477 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.15 
 
 
698 aa  714    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055955 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  56.23 
 
 
700 aa  791    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.4 
 
 
695 aa  816    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.1 
 
 
704 aa  796    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0158  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.98 
 
 
701 aa  797    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3682  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.46 
 
 
696 aa  867    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146591  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2477  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 
702 aa  1457    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0415356  normal  0.385274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.05 
 
 
703 aa  753    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4892  ATP-dependent DNA helicase RecG  66.24 
 
 
706 aa  977    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355865  normal  0.436875 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.18 
 
 
702 aa  813    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.53 
 
 
700 aa  598  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.06 
 
 
712 aa  541  9.999999999999999e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.72 
 
 
779 aa  531  1e-149  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0328  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.35 
 
 
706 aa  528  1e-148  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171796  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.52 
 
 
819 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.52 
 
 
819 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.84 
 
 
719 aa  521  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.08 
 
 
772 aa  512  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.01 
 
 
818 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  41 
 
 
767 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.8 
 
 
772 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.75 
 
 
706 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.93 
 
 
829 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.78 
 
 
685 aa  504  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.57 
 
 
765 aa  504  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.09 
 
 
817 aa  503  1e-141  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0350  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.93 
 
 
703 aa  499  1e-140  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.044491  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.97 
 
 
689 aa  498  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.35 
 
 
827 aa  496  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.23 
 
 
778 aa  497  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.57 
 
 
786 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.19 
 
 
717 aa  492  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2072  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.75 
 
 
707 aa  492  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000101062  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.59 
 
 
822 aa  488  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.7 
 
 
827 aa  483  1e-135  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.08 
 
 
714 aa  480  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1224  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.24 
 
 
679 aa  481  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3545  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.85 
 
 
688 aa  479  1e-134  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020177  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1164  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.38 
 
 
692 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.26 
 
 
681 aa  477  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1278  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.33 
 
 
694 aa  473  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177254  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.12 
 
 
683 aa  474  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.47 
 
 
776 aa  470  1.0000000000000001e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2058  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.82 
 
 
822 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0511004  normal  0.682636 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.12 
 
 
706 aa  472  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.31 
 
 
772 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2890  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.48 
 
 
678 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000445621  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3834  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.8 
 
 
805 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.492162  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3897  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.64 
 
 
682 aa  462  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00158642  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.4 
 
 
815 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2210  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.89 
 
 
904 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.59 
 
 
812 aa  463  1e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3678  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.78 
 
 
685 aa  465  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2507  ATP-dependent DNA helicase RecG  42 
 
 
682 aa  462  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0246082  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16671  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.19 
 
 
846 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.461543 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3903  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.64 
 
 
682 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000501886  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3706  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.79 
 
 
682 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152385  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3614  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.64 
 
 
682 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135491  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.08 
 
 
846 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3993  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.79 
 
 
682 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000184974  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.2 
 
 
842 aa  460  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1289  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.64 
 
 
682 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00448212  hitchhiker  0.00000000161574 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.97 
 
 
846 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0967  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.71 
 
 
691 aa  461  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309793  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3954  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.5 
 
 
682 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0156287  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3869  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.79 
 
 
682 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.12234e-39 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2192  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.49 
 
 
787 aa  459  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1077  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.78 
 
 
682 aa  457  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.012078  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1105  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.21 
 
 
799 aa  456  1e-127  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  37.5 
 
 
818 aa  459  1e-127  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1984  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.42 
 
 
690 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.52 
 
 
818 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.49 
 
 
862 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0198  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.18 
 
 
691 aa  454  1.0000000000000001e-126  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4522  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.11 
 
 
753 aa  453  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.91 
 
 
685 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2553  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.77 
 
 
681 aa  455  1.0000000000000001e-126  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0536  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.9 
 
 
676 aa  452  1.0000000000000001e-126  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1700  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.98 
 
 
672 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.828998  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2120  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.19 
 
 
904 aa  452  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.460593  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.17 
 
 
740 aa  451  1e-125  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1139  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.63 
 
 
776 aa  449  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00836981  normal  0.0179484 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1117  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.26 
 
 
689 aa  450  1e-125  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0196  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.74 
 
 
781 aa  446  1.0000000000000001e-124  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.639349  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3596  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.81 
 
 
657 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.48 
 
 
686 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0353  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.08 
 
 
691 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3492  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.88 
 
 
690 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000503881 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1682  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.82 
 
 
671 aa  443  1e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.193208  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2074  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.02 
 
 
908 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.14532 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.38 
 
 
697 aa  446  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.63 
 
 
692 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.81 
 
 
728 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1162  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.38 
 
 
678 aa  441  9.999999999999999e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000110827  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.18 
 
 
686 aa  442  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0923  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.09 
 
 
680 aa  439  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.452189  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.91 
 
 
842 aa  442  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2942  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.25 
 
 
737 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1397  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.31 
 
 
696 aa  442  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1702  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.36 
 
 
564 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>