17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_14820 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_14820  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  880    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2257  hypothetical protein  52.01 
 
 		 447 aa  409  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4607  hypothetical protein  46.9 
 
 		 415 aa  344  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0195  hypothetical protein  43.44 
 
 		 429 aa  330  3e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10930  hypothetical protein  44.7 
 
 		 419 aa  326  5e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.129027  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2011  hypothetical protein  43.06 
 
 		 405 aa  318  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0491359 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1185  hypothetical protein  41.83 
 
 		 410 aa  299  7e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5000  hypothetical protein  42.65 
 
 		 406 aa  298  9e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1078  hypothetical protein  42.76 
 
 		 425 aa  292  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321073 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4131  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  27.2 
 
 		 635 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0331155  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1899  beta-galactosidase  27.97 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1672  glycoside hydrolase family 42 protein  22.62 
 
 		 640 aa  55.8  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.590042  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0936  hypothetical protein  20.83 
 
 		 600 aa  55.8  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1790  glycoside hydrolase family protein  20.27 
 
 		 627 aa  54.3  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0035  hypothetical protein  22.49 
 
 		 421 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0771  hypothetical protein  34.04 
 
 		 422 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2181  putative glycosyl hydrolase  27.14 
 
 		 568 aa  43.1  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>