More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_10980 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  100 
 
 
296 aa  604  9.999999999999999e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  71.11 
 
 
270 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  67.88 
 
 
285 aa  381  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  64.44 
 
 
272 aa  350  2e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  54.71 
 
 
283 aa  304  1.0000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  58.02 
 
 
264 aa  290  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6478  methyltransferase type 11  56.44 
 
 
269 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0560724  normal  0.10851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  53.41 
 
 
270 aa  280  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  51.5 
 
 
271 aa  268  8.999999999999999e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  49.45 
 
 
272 aa  263  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  54.34 
 
 
273 aa  257  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  51.13 
 
 
275 aa  253  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  50.38 
 
 
267 aa  250  2e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  48.86 
 
 
265 aa  245  6e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07175  ubiE/COQ5 methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03321)  47.49 
 
 
313 aa  235  6e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38441  normal  0.150354 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  47.17 
 
 
272 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  35.82 
 
 
275 aa  178  8e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  32.05 
 
 
268 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  32.05 
 
 
268 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  27.72 
 
 
268 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1022  Methyltransferase type 11  26.49 
 
 
273 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  35.8 
 
 
273 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0114  hypothetical protein  36.5 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  30.53 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  26.22 
 
 
266 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  40.95 
 
 
250 aa  81.6  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  31.33 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  34.81 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  31.69 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  28.64 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  31.9 
 
 
287 aa  79.3  0.00000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  31.44 
 
 
268 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1100  methyltransferase type 11  36.48 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  43 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  44.33 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  43 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  37.76 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  42.55 
 
 
335 aa  76.3  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  42 
 
 
254 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  42 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  42 
 
 
255 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  36.13 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  33.66 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2758  Methyltransferase type 11  40 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000336599  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.96 
 
 
253 aa  74.7  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  34.19 
 
 
206 aa  74.7  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.24 
 
 
237 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.14 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3776  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.24 
 
 
237 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0393069  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1569  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.24 
 
 
237 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.781622  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  30.41 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1423  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.24 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  29.59 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.24 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.24 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1607  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.24 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000707225 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1534  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.24 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.24 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  29.21 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.21 
 
 
243 aa  72.4  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  41.58 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  41.28 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
254 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  29.27 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  29.59 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4629  Methyltransferase type 11  28.26 
 
 
270 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  29.59 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  43.81 
 
 
240 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  39.64 
 
 
258 aa  72  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  30.06 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
341 aa  71.2  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.56 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0160  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.79 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4310  hypothetical protein  38.74 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  40.59 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0198  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.57 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.537911  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
341 aa  71.2  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1886  Methyltransferase type 11  36.31 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187674  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.56 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  38.32 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1236  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.24 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.228899  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  28.65 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  42.11 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  38 
 
 
306 aa  70.1  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  42.31 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2330  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.04 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  40.4 
 
 
281 aa  69.7  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  33.93 
 
 
341 aa  69.7  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4099  methyltransferase type 11  36.63 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4175  methyltransferase type 11  36.63 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14805  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  42.11 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  30.82 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  34.84 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>