More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_09590 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_09590  CBS domain-containing protein  100 
 
 
443 aa  858    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2484  protein of unknown function DUF21  68.11 
 
 
442 aa  561  1.0000000000000001e-159  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1222  protein of unknown function DUF21  65.06 
 
 
439 aa  493  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.250523  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1234  protein of unknown function DUF21  56.56 
 
 
453 aa  381  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.106715 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2962  protein of unknown function DUF21  49.52 
 
 
486 aa  372  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.387429  hitchhiker  0.00195258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1954  hypothetical protein  49.89 
 
 
574 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0113455  normal  0.562335 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2378  protein of unknown function DUF21  47.99 
 
 
443 aa  360  2e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000393714 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2999  hypothetical protein  48.1 
 
 
503 aa  355  5.999999999999999e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280207  normal  0.727721 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2643  hypothetical protein  48.23 
 
 
445 aa  355  8.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2764  protein of unknown function DUF21  45.33 
 
 
461 aa  353  4e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3662  hypothetical protein  46.34 
 
 
453 aa  353  4e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5679  protein of unknown function DUF21  48.17 
 
 
450 aa  352  5e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.372603  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2720  hypothetical protein  47.88 
 
 
451 aa  351  1e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0063  protein of unknown function DUF21  47.09 
 
 
452 aa  348  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5344  protein of unknown function DUF21  46.65 
 
 
444 aa  343  2.9999999999999997e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.308769  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2317  protein of unknown function DUF21  45.14 
 
 
450 aa  341  2e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3094  hypothetical protein  44.85 
 
 
451 aa  333  3e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.292492  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31520  CBS domain-containing protein  44.72 
 
 
455 aa  329  5.0000000000000004e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07750  CBS domain-containing protein  48.82 
 
 
438 aa  326  4.0000000000000003e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3364  hypothetical protein  44.16 
 
 
457 aa  325  1e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1722  protein of unknown function DUF21  43.38 
 
 
460 aa  318  1e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2371  protein of unknown function DUF21  41.36 
 
 
490 aa  315  9.999999999999999e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.304604 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22510  CBS domain-containing protein  45.01 
 
 
438 aa  313  2.9999999999999996e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0516538  normal  0.801852 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2841  hypothetical protein  44.11 
 
 
470 aa  312  7.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2814  hypothetical protein  44.11 
 
 
471 aa  312  9e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2858  hypothetical protein  44.11 
 
 
471 aa  312  9e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11870  hypothetical protein  42.57 
 
 
455 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0136182  normal  0.440152 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0508  protein of unknown function DUF21  46.58 
 
 
451 aa  300  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6404  hypothetical protein  43.09 
 
 
452 aa  300  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0914  hypothetical protein  43.67 
 
 
474 aa  294  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1801  CBS domain containing protein  59.66 
 
 
339 aa  269  5.9999999999999995e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.205512  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0047  hypothetical protein  39.26 
 
 
520 aa  246  6e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1409  hypothetical protein  38.65 
 
 
452 aa  237  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.464754 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1368  hypothetical protein  38.73 
 
 
452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  32.04 
 
 
446 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6909  hypothetical protein  37.63 
 
 
451 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97846  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4665  protein of unknown function DUF21  36.05 
 
 
441 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24020  CBS domain-containing protein  36.89 
 
 
451 aa  224  2e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.94366 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1941  protein of unknown function DUF21  35.58 
 
 
460 aa  219  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164047  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  32.94 
 
 
437 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3477  hypothetical protein  34.12 
 
 
458 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3540  hypothetical protein  34.12 
 
 
458 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228644  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3490  hypothetical protein  34.12 
 
 
458 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2179  protein of unknown function DUF21  35.93 
 
 
431 aa  207  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  30.35 
 
 
446 aa  207  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0119  protein of unknown function DUF21  37.47 
 
 
486 aa  206  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458192  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1705  pyruvate-ferredoxin oxidoreductase  28.74 
 
 
446 aa  205  2e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1685  CBS  35.16 
 
 
462 aa  204  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2949  protein of unknown function DUF21  34.17 
 
 
469 aa  205  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0445  protein of unknown function DUF21  36.58 
 
 
451 aa  204  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0534885  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3860  hypothetical protein  36.08 
 
 
453 aa  204  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.188072  normal  0.0935065 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0644  magnesium and cobalt efflux protein CorC  28.64 
 
 
442 aa  202  9e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  28.89 
 
 
435 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  28.89 
 
 
435 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  28.89 
 
 
435 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  28.89 
 
 
435 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  28.22 
 
 
435 aa  200  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  28.22 
 
 
435 aa  200  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5779  protein of unknown function DUF21  37.75 
 
 
468 aa  199  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05880  CBS domain-containing protein  34.88 
 
 
478 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.927545 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0455  conserved hypothetical protein, putative efflux protein (DUF21 domain protein)  28.9 
 
 
456 aa  197  4.0000000000000005e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.844865  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1910  hypothetical protein  27.02 
 
 
435 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2128  CBS domain-containing protein  27.69 
 
 
435 aa  196  7e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.695041  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  28.1 
 
 
435 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2767  hypothetical protein  33.03 
 
 
434 aa  196  8.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  28.1 
 
 
435 aa  195  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  31.34 
 
 
430 aa  194  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2683  CBS domain-containing protein  35.28 
 
 
455 aa  194  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.522065  normal  0.368276 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  30.02 
 
 
448 aa  192  8e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0389  hypothetical protein  33.26 
 
 
438 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  30.85 
 
 
438 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  32.03 
 
 
446 aa  190  4e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3532  hypothetical protein  31.95 
 
 
455 aa  189  7e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0148  protein of unknown function DUF21  35.66 
 
 
421 aa  189  8e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  32.37 
 
 
446 aa  189  8e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  34.4 
 
 
444 aa  188  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0318  protein of unknown function DUF21  32.09 
 
 
496 aa  188  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000206585  hitchhiker  0.00828276 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  32.8 
 
 
443 aa  187  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02510  CBS domain-containing protein  35.03 
 
 
470 aa  187  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0176  transporter, putative  28.04 
 
 
428 aa  186  6e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  31.68 
 
 
442 aa  184  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0412  protein of unknown function DUF21  33.84 
 
 
459 aa  184  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29322  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1382  protein of unknown function DUF21  29.2 
 
 
446 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2595  hypothetical protein  30.13 
 
 
476 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5678  protein of unknown function DUF21  36.78 
 
 
347 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400614  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  30.09 
 
 
433 aa  180  4e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7969  protein of unknown function DUF21  32.65 
 
 
555 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  30.59 
 
 
444 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  27.38 
 
 
442 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0760  protein of unknown function DUF21  31.85 
 
 
437 aa  177  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.332278 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  27.38 
 
 
435 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0669  hypothetical protein  35.47 
 
 
439 aa  178  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0810091 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0214  transporter, putative  28.04 
 
 
428 aa  177  2e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2793  protein of unknown function DUF21  35.05 
 
 
464 aa  178  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0191  putative transporter  28.04 
 
 
428 aa  177  3e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2068  magnesium and cobalt efflux protein  27.15 
 
 
451 aa  176  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  27.15 
 
 
451 aa  176  7e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  27.15 
 
 
451 aa  176  7e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1858  protein of unknown function DUF21  32.56 
 
 
434 aa  176  7e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0726  hypothetical protein  27.34 
 
 
449 aa  176  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>