37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0079 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0076  hypothetical protein  91.31 
 
 
828 aa  1583  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4273  MORN repeat-containing protein  73.92 
 
 
816 aa  1291  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0062  MORN repeat-containing protein  73.47 
 
 
818 aa  1297  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0081  MORN repeat-containing protein  97.83 
 
 
829 aa  1688  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0420783 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3001  MORN repeat-containing protein  58.55 
 
 
684 aa  790  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.972797  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0077  MORN repeat-containing protein  97.47 
 
 
829 aa  1681  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0076  MORN repeat-containing protein  73.8 
 
 
816 aa  1293  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0079  MORN repeat-containing protein  100 
 
 
829 aa  1717  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0081  MORN repeat-containing protein  73.56 
 
 
816 aa  1286  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  25 
 
 
769 aa  82.4  3e-14  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  25.17 
 
 
770 aa  81.6  6e-14  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  24.55 
 
 
769 aa  79  3e-13  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  25.94 
 
 
769 aa  77.8  9e-13  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  26.17 
 
 
770 aa  75.9  3e-12  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  25.5 
 
 
770 aa  75.9  3e-12  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  25.6 
 
 
772 aa  75.9  3e-12  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  5.90481e-06 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  26.17 
 
 
770 aa  73.2  2e-11  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  26.17 
 
 
770 aa  73.2  2e-11  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  29.96 
 
 
770 aa  72  5e-11  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0343  hypothetical protein  22.6 
 
 
429 aa  62.8  3e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  22.59 
 
 
768 aa  58.2  6e-07  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  24.36 
 
 
454 aa  51.2  7e-05  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  30.54 
 
 
691 aa  50.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1425  hypothetical protein  23.56 
 
 
580 aa  49.7  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  25.7 
 
 
449 aa  48.1  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  25.94 
 
 
291 aa  48.1  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2869  hypothetical protein  24.91 
 
 
566 aa  47.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2247  hypothetical protein  21.63 
 
 
300 aa  47.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  5.30465e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2514  hypothetical protein  25.81 
 
 
566 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.077322  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1949  hypothetical protein  24.59 
 
 
566 aa  45.4  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0718106  normal  0.307663 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1553  hypothetical protein  28.68 
 
 
891 aa  45.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0122844  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2409  hypothetical protein  25.5 
 
 
566 aa  44.7  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0700458  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2678  MORN variant repeat protein  25.31 
 
 
332 aa  45.1  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2786  hypothetical protein  32 
 
 
566 aa  44.7  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.373413  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2399  hypothetical protein  25.5 
 
 
566 aa  44.7  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.4686e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2462  MORN repeat-containing protein  36.47 
 
 
602 aa  44.3  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  5.72585e-06 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2965  hypothetical protein  24.54 
 
 
566 aa  44.3  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>