54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2438 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2438  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  482  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000355318  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1616  hypothetical protein  74.79 
 
 		 238 aa  375  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  decreased coverage  0.000000163604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3039  hypothetical protein  74.25 
 
 		 238 aa  368  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0172868  normal  0.01799 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2472  hypothetical protein  67.38 
 
 		 238 aa  339  2e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000142  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1448  hypothetical protein  66.39 
 
 		 250 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000347149  unclonable  0.0000000000712925 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3101  hypothetical protein  66.39 
 
 		 238 aa  338  4e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2793  hypothetical protein  66.81 
 
 		 238 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000363399  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2773  hypothetical protein  66.81 
 
 		 238 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000968246  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1585  protein of unknown function DUF541  66.81 
 
 		 238 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000124406  hitchhiker  0.000000000106275 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1395  hypothetical protein  65.13 
 
 		 238 aa  334  5e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000811634  unclonable  0.0000000000143355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1460  hypothetical protein  65.13 
 
 		 238 aa  334  5e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000634241  unclonable  0.0000276255 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2868  hypothetical protein  65.95 
 
 		 238 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000991605  normal  0.689534 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2180  hypothetical protein  60.08 
 
 		 238 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000267555  normal  0.0119048 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2154  hypothetical protein  54.24 
 
 		 239 aa  261  4.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2080  protein of unknown function DUF541  52.54 
 
 		 239 aa  260  1e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0404396  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1910  protein of unknown function DUF541  52.38 
 
 		 239 aa  246  3e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1140  hypothetical protein  50.64 
 
 		 241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.114572 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2109  protein of unknown function DUF541  52 
 
 		 228 aa  230  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.184422 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0087  hypothetical protein  48.92 
 
 		 239 aa  229  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2104  hypothetical protein  47.62 
 
 		 239 aa  221  6e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00837  hypothetical protein  46.98 
 
 		 239 aa  221  7e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001628  putative periplasmic protein  46.98 
 
 		 239 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2412  hypothetical protein  46.55 
 
 		 245 aa  216  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.377805  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1109  hypothetical protein  46.75 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2301  hypothetical protein  45.73 
 
 		 238 aa  206  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0033  hypothetical protein  46.32 
 
 		 233 aa  202  4e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0072  hypothetical protein  45.45 
 
 		 233 aa  198  7e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0108792  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03216  hypothetical protein  43.97 
 
 		 247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000893493  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0048  hypothetical protein  45.45 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.411196  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0569  protein of unknown function DUF541  40.68 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0339808  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1426  hypothetical protein  41.98 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.174066 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0525  hypothetical protein  41.59 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.426488  normal  0.0754297 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1748  hypothetical protein  40.87 
 
 		 232 aa  151  7e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3473  hypothetical protein  34.44 
 
 		 236 aa  125  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K09  hypothetical protein  31.22 
 
 		 231 aa  118  6e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3038  hypothetical protein  33.94 
 
 		 252 aa  105  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2487  hypothetical protein  30.32 
 
 		 236 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.375164 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1567  hypothetical protein  27.57 
 
 		 246 aa  85.5  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1796  hypothetical protein  30.81 
 
 		 249 aa  85.1  8e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.193183  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1832  hypothetical protein  30.81 
 
 		 249 aa  85.1  8e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0356  hypothetical protein  29.25 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.187061 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0472  protein of unknown function DUF541  25.35 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000443999  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1997  hypothetical protein  25.48 
 
 		 261 aa  72  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10868  hypothetical protein  24.89 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1996  protein of unknown function DUF541  25.47 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.278766 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16340  hypothetical protein  26.76 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.493836  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2255  protein of unknown function DUF541  26.19 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0374125  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0957  hypothetical protein  26.92 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17101  periplasmic protein  23 
 
 		 259 aa  52.4  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0370  putative periplasmic protein  22.97 
 
 		 260 aa  52  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04361  periplasmic protein  22.42 
 
 		 260 aa  49.3  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0399272  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04251  periplasmic protein  23.77 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2326  hypothetical protein  25.35 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16350  hypothetical protein  23.81 
 
 		 141 aa  46.2  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>