55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2326 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2326  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  506  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17101  periplasmic protein  43.4 
 
 		 259 aa  188  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1996  protein of unknown function DUF541  42.16 
 
 		 246 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.278766 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04361  periplasmic protein  38.89 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0399272  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1997  hypothetical protein  36.91 
 
 		 261 aa  153  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04251  periplasmic protein  38.46 
 
 		 260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0370  putative periplasmic protein  38.46 
 
 		 260 aa  151  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1567  hypothetical protein  33.61 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0472  protein of unknown function DUF541  34.63 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000443999  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2255  protein of unknown function DUF541  31.09 
 
 		 238 aa  125  7e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0374125  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0957  hypothetical protein  34.05 
 
 		 254 aa  122  4e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10868  hypothetical protein  29.55 
 
 		 242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1796  hypothetical protein  32.38 
 
 		 249 aa  112  8.000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.193183  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1832  hypothetical protein  32.38 
 
 		 249 aa  112  8.000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0356  hypothetical protein  32.63 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.187061 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03216  hypothetical protein  28.23 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000893493  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0048  hypothetical protein  26.48 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.411196  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0033  hypothetical protein  26.6 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0072  hypothetical protein  26.6 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0108792  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2487  hypothetical protein  27.52 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.375164 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3038  hypothetical protein  31.39 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001628  putative periplasmic protein  28.34 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2180  hypothetical protein  25.79 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000267555  normal  0.0119048 
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K09  hypothetical protein  22.27 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0087  hypothetical protein  28.49 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1140  hypothetical protein  25.36 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.114572 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2472  hypothetical protein  27.14 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000142  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1109  hypothetical protein  27.14 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2104  hypothetical protein  27.07 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0525  hypothetical protein  23.26 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.426488  normal  0.0754297 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  24.12 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1616  hypothetical protein  26.17 
 
 		 238 aa  53.9  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  decreased coverage  0.000000163604 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2438  hypothetical protein  25.35 
 
 		 236 aa  53.1  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000355318  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2773  hypothetical protein  25.85 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000968246  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3101  hypothetical protein  24.29 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00837  hypothetical protein  23.77 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2412  hypothetical protein  25.59 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.377805  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1585  protein of unknown function DUF541  25.85 
 
 		 238 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000124406  hitchhiker  0.000000000106275 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2868  hypothetical protein  25.85 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000991605  normal  0.689534 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2793  hypothetical protein  26.21 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000363399  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1448  hypothetical protein  23.45 
 
 		 250 aa  49.3  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000347149  unclonable  0.0000000000712925 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1426  hypothetical protein  24.41 
 
 		 237 aa  48.5  0.00009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.174066 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2109  protein of unknown function DUF541  24.73 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.184422 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1910  protein of unknown function DUF541  25.82 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0569  protein of unknown function DUF541  27.96 
 
 		 241 aa  48.5  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0339808  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1460  hypothetical protein  23.92 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000634241  unclonable  0.0000276255 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1395  hypothetical protein  23.92 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000811634  unclonable  0.0000000000143355 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3473  hypothetical protein  26.67 
 
 		 236 aa  47  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  25.25 
 
 		 238 aa  45.4  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2154  hypothetical protein  23.29 
 
 		 239 aa  42.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1748  hypothetical protein  22.48 
 
 		 232 aa  42.7  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  26.45 
 
 		 234 aa  42  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  26.45 
 
 		 250 aa  42.4  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  24.38 
 
 		 243 aa  42  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  27.27 
 
 		 251 aa  42  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>