58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2255 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2255  protein of unknown function DUF541  100 
 
 
238 aa  471  1e-132  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0374125  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1567  hypothetical protein  32.49 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1997  hypothetical protein  31.65 
 
 
261 aa  129  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1996  protein of unknown function DUF541  32.33 
 
 
246 aa  125  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.278766 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0472  protein of unknown function DUF541  33.47 
 
 
244 aa  124  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000443999  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2326  hypothetical protein  31.09 
 
 
250 aa  120  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17101  periplasmic protein  27.39 
 
 
259 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1796  hypothetical protein  28.69 
 
 
249 aa  93.2  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.193183  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1832  hypothetical protein  28.69 
 
 
249 aa  93.2  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10868  hypothetical protein  26.97 
 
 
242 aa  92.8  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0525  hypothetical protein  29.39 
 
 
241 aa  92  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.426488  normal  0.0754297 
 
 
-
 
NC_002950  PG0356  hypothetical protein  25.44 
 
 
260 aa  89  6e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.187061 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04361  periplasmic protein  25.93 
 
 
260 aa  88.6  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0399272  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0370  putative periplasmic protein  25.51 
 
 
260 aa  86.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04251  periplasmic protein  26.97 
 
 
260 aa  85.5  7e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03216  hypothetical protein  26.94 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000893493  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0957  hypothetical protein  27.69 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2487  hypothetical protein  25.45 
 
 
236 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.375164 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1140  hypothetical protein  26.14 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.114572 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1910  protein of unknown function DUF541  24.48 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2080  protein of unknown function DUF541  26.32 
 
 
239 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0404396  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0569  protein of unknown function DUF541  24.7 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0339808  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3473  hypothetical protein  23.75 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3039  hypothetical protein  27.85 
 
 
238 aa  67  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0172868  normal  0.01799 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2793  hypothetical protein  27.31 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000363399  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2180  hypothetical protein  25.58 
 
 
238 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000267555  normal  0.0119048 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1585  protein of unknown function DUF541  26.85 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000124406  hitchhiker  0.000000000106275 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2773  hypothetical protein  26.85 
 
 
238 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000968246  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2868  hypothetical protein  26.85 
 
 
238 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000991605  normal  0.689534 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0048  hypothetical protein  25.51 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.411196  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1426  hypothetical protein  25.62 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.174066 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00837  hypothetical protein  24.59 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0072  hypothetical protein  25.91 
 
 
233 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0108792  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2472  hypothetical protein  26.39 
 
 
238 aa  63.9  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000142  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1109  hypothetical protein  25.73 
 
 
262 aa  63.5  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001628  putative periplasmic protein  24.59 
 
 
239 aa  62.4  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2154  hypothetical protein  24.58 
 
 
239 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2438  hypothetical protein  26.19 
 
 
236 aa  61.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000355318  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1616  hypothetical protein  25.4 
 
 
238 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  decreased coverage  0.000000163604 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0033  hypothetical protein  26.03 
 
 
233 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1395  hypothetical protein  25.44 
 
 
238 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000811634  unclonable  0.0000000000143355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1460  hypothetical protein  25.44 
 
 
238 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000634241  unclonable  0.0000276255 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3101  hypothetical protein  25.22 
 
 
238 aa  58.5  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1448  hypothetical protein  25.11 
 
 
250 aa  58.5  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000347149  unclonable  0.0000000000712925 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  27.59 
 
 
251 aa  58.5  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0087  hypothetical protein  21.43 
 
 
239 aa  58.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2104  hypothetical protein  25.2 
 
 
239 aa  58.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2109  protein of unknown function DUF541  24.79 
 
 
228 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.184422 
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K09  hypothetical protein  24.08 
 
 
231 aa  55.5  0.0000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2412  hypothetical protein  23.7 
 
 
245 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.377805  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1748  hypothetical protein  24.15 
 
 
232 aa  53.1  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2301  hypothetical protein  23.94 
 
 
238 aa  52.8  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  25.74 
 
 
236 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1457  protein of unknown function DUF541  22.15 
 
 
242 aa  48.9  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.660121  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3038  hypothetical protein  25.56 
 
 
252 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  27.74 
 
 
259 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  27.74 
 
 
266 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3820  hypothetical protein  27.74 
 
 
259 aa  44.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.855963  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>