54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1448 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1448  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  513  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000347149  unclonable  0.0000000000712925 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1395  hypothetical protein  98.74 
 
 		 238 aa  485  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000811634  unclonable  0.0000000000143355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1460  hypothetical protein  98.74 
 
 		 238 aa  485  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000634241  unclonable  0.0000276255 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3101  hypothetical protein  92.86 
 
 		 238 aa  460  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2472  hypothetical protein  90.76 
 
 		 238 aa  456  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2793  hypothetical protein  89.92 
 
 		 238 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000363399  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2773  hypothetical protein  89.08 
 
 		 238 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000968246  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1585  protein of unknown function DUF541  89.5 
 
 		 238 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000124406  hitchhiker  0.000000000106275 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2868  hypothetical protein  88.66 
 
 		 238 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000991605  normal  0.689534 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1616  hypothetical protein  68.07 
 
 		 238 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  decreased coverage  0.000000163604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3039  hypothetical protein  69.33 
 
 		 238 aa  350  1e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0172868  normal  0.01799 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2438  hypothetical protein  66.39 
 
 		 236 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000355318  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2180  hypothetical protein  63.45 
 
 		 238 aa  328  3e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000267555  normal  0.0119048 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2154  hypothetical protein  53.68 
 
 		 239 aa  260  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2080  protein of unknown function DUF541  51.52 
 
 		 239 aa  255  5e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0404396  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1910  protein of unknown function DUF541  48.95 
 
 		 239 aa  248  9e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2109  protein of unknown function DUF541  52.89 
 
 		 228 aa  242  5e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.184422 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1140  hypothetical protein  46.67 
 
 		 241 aa  229  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.114572 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00837  hypothetical protein  47.62 
 
 		 239 aa  226  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2412  hypothetical protein  47.19 
 
 		 245 aa  223  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.377805  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1109  hypothetical protein  47.83 
 
 		 262 aa  221  8e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0087  hypothetical protein  46.03 
 
 		 239 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2301  hypothetical protein  48.48 
 
 		 238 aa  218  7e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001628  putative periplasmic protein  44.77 
 
 		 239 aa  217  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2104  hypothetical protein  46.72 
 
 		 239 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03216  hypothetical protein  44.59 
 
 		 247 aa  209  5e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000893493  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0072  hypothetical protein  46.38 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0108792  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0048  hypothetical protein  46.38 
 
 		 253 aa  202  4e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.411196  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0033  hypothetical protein  45.96 
 
 		 233 aa  202  5e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0569  protein of unknown function DUF541  40 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0339808  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1426  hypothetical protein  38.57 
 
 		 237 aa  159  3e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.174066 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1748  hypothetical protein  43 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0525  hypothetical protein  37.08 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.426488  normal  0.0754297 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3473  hypothetical protein  32.91 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K09  hypothetical protein  30.73 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3038  hypothetical protein  31.86 
 
 		 252 aa  99.8  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1567  hypothetical protein  28.38 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1997  hypothetical protein  31.64 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1996  protein of unknown function DUF541  26.39 
 
 		 246 aa  85.5  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.278766 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2487  hypothetical protein  32.23 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.375164 
 
 
-
 
NC_002950  PG0356  hypothetical protein  27.51 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.187061 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1796  hypothetical protein  24.12 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.193183  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1832  hypothetical protein  24.12 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10868  hypothetical protein  22.52 
 
 		 242 aa  72  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16340  hypothetical protein  26.45 
 
 		 167 aa  70.5  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.493836  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0472  protein of unknown function DUF541  23.72 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000443999  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0957  hypothetical protein  24.54 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2255  protein of unknown function DUF541  25.11 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0374125  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04361  periplasmic protein  22.37 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0399272  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0370  putative periplasmic protein  21.92 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17101  periplasmic protein  23.46 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04251  periplasmic protein  20.55 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16350  hypothetical protein  24.78 
 
 		 141 aa  45.4  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2326  hypothetical protein  23.45 
 
 		 250 aa  42.7  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>