53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2104 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2104  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  490  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2301  hypothetical protein  70.34 
 
 		 238 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0087  hypothetical protein  59.83 
 
 		 239 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2412  hypothetical protein  60.26 
 
 		 245 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.377805  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00837  hypothetical protein  53.59 
 
 		 239 aa  265  5.999999999999999e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001628  putative periplasmic protein  51.26 
 
 		 239 aa  257  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03216  hypothetical protein  52.84 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000893493  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2154  hypothetical protein  48.54 
 
 		 239 aa  251  9.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2080  protein of unknown function DUF541  50.66 
 
 		 239 aa  250  1e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0404396  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1109  hypothetical protein  48.12 
 
 		 262 aa  239  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1616  hypothetical protein  47.7 
 
 		 238 aa  230  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  decreased coverage  0.000000163604 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1140  hypothetical protein  49.78 
 
 		 241 aa  231  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.114572 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2109  protein of unknown function DUF541  48.44 
 
 		 228 aa  229  4e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.184422 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0048  hypothetical protein  47.01 
 
 		 253 aa  228  9e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.411196  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1910  protein of unknown function DUF541  46.32 
 
 		 239 aa  226  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0072  hypothetical protein  46.58 
 
 		 233 aa  224  9e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0108792  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0033  hypothetical protein  46.15 
 
 		 233 aa  222  4e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2438  hypothetical protein  47.62 
 
 		 236 aa  221  6e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000355318  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3039  hypothetical protein  45.92 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0172868  normal  0.01799 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3101  hypothetical protein  47.16 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1448  hypothetical protein  46.72 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000347149  unclonable  0.0000000000712925 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1395  hypothetical protein  46.29 
 
 		 238 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000811634  unclonable  0.0000000000143355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1460  hypothetical protein  46.29 
 
 		 238 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000634241  unclonable  0.0000276255 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2472  hypothetical protein  43.93 
 
 		 238 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000142  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2180  hypothetical protein  42.79 
 
 		 238 aa  209  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000267555  normal  0.0119048 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1585  protein of unknown function DUF541  44.35 
 
 		 238 aa  208  6e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000124406  hitchhiker  0.000000000106275 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2773  hypothetical protein  44.35 
 
 		 238 aa  208  7e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000968246  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2793  hypothetical protein  44.35 
 
 		 238 aa  208  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000363399  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2868  hypothetical protein  43.93 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000991605  normal  0.689534 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0569  protein of unknown function DUF541  38.98 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0339808  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0525  hypothetical protein  41.49 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.426488  normal  0.0754297 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1426  hypothetical protein  36.78 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.174066 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1748  hypothetical protein  38 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3473  hypothetical protein  35.04 
 
 		 236 aa  122  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3038  hypothetical protein  33.04 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1832  hypothetical protein  25.99 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1796  hypothetical protein  25.99 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.193183  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2487  hypothetical protein  29.73 
 
 		 236 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.375164 
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K09  hypothetical protein  28.71 
 
 		 231 aa  85.9  5e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1997  hypothetical protein  28.29 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10868  hypothetical protein  23.36 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1567  hypothetical protein  27 
 
 		 246 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1996  protein of unknown function DUF541  26.01 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.278766 
 
 
-
 
NC_002950  PG0356  hypothetical protein  27.05 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.187061 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04251  periplasmic protein  23.56 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2255  protein of unknown function DUF541  25.2 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0374125  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04361  periplasmic protein  21.63 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0399272  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0472  protein of unknown function DUF541  22.27 
 
 		 244 aa  57  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000443999  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17101  periplasmic protein  22.49 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0370  putative periplasmic protein  23.36 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0957  hypothetical protein  23.19 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16340  hypothetical protein  21.97 
 
 		 167 aa  48.9  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.493836  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2326  hypothetical protein  27.07 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>