50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2080 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2080  protein of unknown function DUF541  100 
 
 		 239 aa  484  1e-136  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0404396  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2154  hypothetical protein  80.75 
 
 		 239 aa  408  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1910  protein of unknown function DUF541  63.6 
 
 		 239 aa  329  2e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2109  protein of unknown function DUF541  60.96 
 
 		 228 aa  291  6e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.184422 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1616  hypothetical protein  54.39 
 
 		 238 aa  271  7e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  decreased coverage  0.000000163604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3039  hypothetical protein  53.14 
 
 		 238 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0172868  normal  0.01799 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2438  hypothetical protein  52.54 
 
 		 236 aa  260  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000355318  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2472  hypothetical protein  49.79 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000142  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2412  hypothetical protein  51.46 
 
 		 245 aa  257  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.377805  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1448  hypothetical protein  51.52 
 
 		 250 aa  255  4e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000347149  unclonable  0.0000000000712925 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1140  hypothetical protein  55.22 
 
 		 241 aa  254  8e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.114572 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3101  hypothetical protein  51.95 
 
 		 238 aa  254  8e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1395  hypothetical protein  51.08 
 
 		 238 aa  254  9e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000811634  unclonable  0.0000000000143355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1460  hypothetical protein  51.08 
 
 		 238 aa  254  9e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000634241  unclonable  0.0000276255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2773  hypothetical protein  49.37 
 
 		 238 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000968246  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1585  protein of unknown function DUF541  49.37 
 
 		 238 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000124406  hitchhiker  0.000000000106275 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2793  hypothetical protein  48.95 
 
 		 238 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000363399  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2868  hypothetical protein  48.95 
 
 		 238 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000991605  normal  0.689534 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2104  hypothetical protein  50.66 
 
 		 239 aa  250  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00837  hypothetical protein  51.32 
 
 		 239 aa  249  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0087  hypothetical protein  48.95 
 
 		 239 aa  247  1e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001628  putative periplasmic protein  50.44 
 
 		 239 aa  246  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2180  hypothetical protein  48.54 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000267555  normal  0.0119048 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1109  hypothetical protein  49.79 
 
 		 262 aa  244  8e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2301  hypothetical protein  50.65 
 
 		 238 aa  238  5e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0048  hypothetical protein  45.96 
 
 		 253 aa  209  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.411196  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0072  hypothetical protein  45.96 
 
 		 233 aa  209  4e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0108792  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03216  hypothetical protein  46.93 
 
 		 247 aa  207  9e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000893493  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0033  hypothetical protein  45.53 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0569  protein of unknown function DUF541  41.78 
 
 		 241 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0339808  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1426  hypothetical protein  39.11 
 
 		 237 aa  165  5.9999999999999996e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.174066 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1748  hypothetical protein  37.22 
 
 		 232 aa  161  1e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0525  hypothetical protein  41 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.426488  normal  0.0754297 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3473  hypothetical protein  32.64 
 
 		 236 aa  115  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3038  hypothetical protein  33.63 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2487  hypothetical protein  34.13 
 
 		 236 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.375164 
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K09  hypothetical protein  24.88 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1567  hypothetical protein  25.68 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1796  hypothetical protein  30.32 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.193183  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1832  hypothetical protein  30.32 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10868  hypothetical protein  24.88 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0472  protein of unknown function DUF541  25.69 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000443999  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1996  protein of unknown function DUF541  25.78 
 
 		 246 aa  72  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.278766 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2255  protein of unknown function DUF541  26.32 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0374125  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0356  hypothetical protein  25.46 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.187061 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1997  hypothetical protein  24.06 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16340  hypothetical protein  26.72 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.493836  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04361  periplasmic protein  22.82 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0399272  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0370  putative periplasmic protein  23.19 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04251  periplasmic protein  23.19 
 
 		 260 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>