26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_16350 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_16350  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  279  8.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16340  hypothetical protein  75.35 
 
 		 167 aa  205  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.493836  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3473  hypothetical protein  21.8 
 
 		 236 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0525  hypothetical protein  28.12 
 
 		 241 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.426488  normal  0.0754297 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0048  hypothetical protein  24.03 
 
 		 253 aa  51.2  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.411196  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0569  protein of unknown function DUF541  26.09 
 
 		 241 aa  51.2  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0339808  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0072  hypothetical protein  24.03 
 
 		 233 aa  50.8  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0108792  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2109  protein of unknown function DUF541  26.67 
 
 		 228 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.184422 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3101  hypothetical protein  23.08 
 
 		 238 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1426  hypothetical protein  25.56 
 
 		 237 aa  48.5  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.174066 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3038  hypothetical protein  27.01 
 
 		 252 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0033  hypothetical protein  24.43 
 
 		 233 aa  48.1  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2301  hypothetical protein  28.99 
 
 		 238 aa  47.4  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0087  hypothetical protein  23.31 
 
 		 239 aa  47  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2793  hypothetical protein  23.73 
 
 		 238 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000363399  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2773  hypothetical protein  22.88 
 
 		 238 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000968246  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2868  hypothetical protein  22.88 
 
 		 238 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000991605  normal  0.689534 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1585  protein of unknown function DUF541  22.88 
 
 		 238 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000124406  hitchhiker  0.000000000106275 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17101  periplasmic protein  23.81 
 
 		 259 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2438  hypothetical protein  23.81 
 
 		 236 aa  46.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000355318  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1448  hypothetical protein  24.78 
 
 		 250 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000347149  unclonable  0.0000000000712925 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1616  hypothetical protein  22.94 
 
 		 238 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  decreased coverage  0.000000163604 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1460  hypothetical protein  23.89 
 
 		 238 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000634241  unclonable  0.0000276255 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1395  hypothetical protein  23.89 
 
 		 238 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000811634  unclonable  0.0000000000143355 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1996  protein of unknown function DUF541  23.31 
 
 		 246 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.278766 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2472  hypothetical protein  22.03 
 
 		 238 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>