57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0618 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0618  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  453  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.357102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3843  hypothetical protein  92.04 
 
 		 226 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000724256  hitchhiker  0.0000000283379 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0717  hypothetical protein  88.05 
 
 		 226 aa  410  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000253337  unclonable  0.0000000117044 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3487  hypothetical protein  88.94 
 
 		 226 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126131  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0917  hypothetical protein  83.63 
 
 		 226 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00343614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0883  hypothetical protein  83.63 
 
 		 226 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0907  protein of unknown function DUF47  83.63 
 
 		 226 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000556938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3455  hypothetical protein  83.63 
 
 		 226 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000227297  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0692  hypothetical protein  83.11 
 
 		 226 aa  384  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130211  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3096  hypothetical protein  82.3 
 
 		 226 aa  385  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000106475  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0565  hypothetical protein  81.33 
 
 		 226 aa  384  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3770  hypothetical protein  81.86 
 
 		 226 aa  382  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3119  hypothetical protein  82.3 
 
 		 226 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000717729  normal  0.542025 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0853  hypothetical protein  82.3 
 
 		 226 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000459273  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0822  hypothetical protein  82.3 
 
 		 226 aa  383  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000109083  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2673  hypothetical protein  78.32 
 
 		 226 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2681  hypothetical protein  67.56 
 
 		 226 aa  323  1e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0612362  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3320  hypothetical protein  66.07 
 
 		 225 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00863  hypothetical protein  67.11 
 
 		 228 aa  319  3e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2019  hypothetical protein  66.22 
 
 		 228 aa  318  3.9999999999999996e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582127  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3638  hypothetical protein  66.67 
 
 		 226 aa  311  5.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1465  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0181  hypothetical protein  62.22 
 
 		 226 aa  299  3e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1190  phosphate transport regulator  60 
 
 		 226 aa  290  1e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.967179  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0351  hypothetical protein  57.33 
 
 		 225 aa  275  5e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004528  phosphate transport regulator  67.01 
 
 		 195 aa  273  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.327148  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68800  hypothetical protein  53.78 
 
 		 225 aa  264  8e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5953  hypothetical protein  53.33 
 
 		 225 aa  264  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0634  hypothetical protein  52.47 
 
 		 223 aa  253  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0618  hypothetical protein  52.02 
 
 		 223 aa  252  3e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2188  hypothetical protein  51.35 
 
 		 226 aa  241  9e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.839701  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0138  putative pit accessory protein  50.45 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2470  hypothetical protein  51.79 
 
 		 226 aa  236  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2827  hypothetical protein  50.46 
 
 		 224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0711  hypothetical protein  52.47 
 
 		 226 aa  230  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0141  Putitive phosphate transport regulator  47.77 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.572504  normal  0.330321 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1052  hypothetical protein  47.93 
 
 		 224 aa  210  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170442  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0228  hypothetical protein  44 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.775061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1146  Putitive phosphate transport regulator  30.91 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.266401  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0063  hypothetical protein  30.88 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2044  hypothetical protein  30.94 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000405279  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3224  hypothetical protein  26.55 
 
 		 222 aa  92  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0788  hypothetical protein  25.59 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1625  hypothetical protein  30.81 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.109704  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0285  hypothetical protein  30.52 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0688  hypothetical protein  27.54 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000115743  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0664  hypothetical protein  26.35 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000019589  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0013  hypothetical protein  26.13 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0013  hypothetical protein  26.13 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1923  hypothetical protein  24.53 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00116502  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0036  Putitive phosphate transport regulator  25.45 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1332  hypothetical protein  28.12 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3780  phosphate transport regulator-like  22.91 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0493  hypothetical protein  24.14 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000213235  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2238  protein of unknown function DUF47  24.12 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.746394 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3760  putative low-affinity phosphate transport accessory protein  22.94 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.590376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1484  protein of unknown function DUF47  21.23 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000548446  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0262  Putitive phosphate transport regulator  23.36 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>