More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_25220 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_25220  thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 		 313 aa  640    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000419952  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  55.48 
 
 		 304 aa  326  3e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  49.69 
 
 		 409 aa  307  1.0000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2721  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  51.27 
 
 		 319 aa  300  1e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00682943  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0764  thioredoxin reductase  50.49 
 
 		 308 aa  291  8e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.080052  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  46.95 
 
 		 304 aa  285  7e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  46.3 
 
 		 304 aa  282  5.000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  46.77 
 
 		 306 aa  282  6.000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  45.54 
 
 		 323 aa  281  7.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  45.02 
 
 		 308 aa  280  2e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  46.96 
 
 		 309 aa  278  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0785  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  45.22 
 
 		 556 aa  276  4e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182954  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  44.76 
 
 		 318 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0477  alkyl hydroperoxide reductase F subunit  45.51 
 
 		 555 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000501172  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  50 
 
 		 308 aa  269  2.9999999999999997e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  44.76 
 
 		 315 aa  269  4e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.15 
 
 		 555 aa  269  5e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000005332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  43.81 
 
 		 318 aa  266  4e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  44.13 
 
 		 318 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  43.17 
 
 		 318 aa  265  7e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0743  thioredoxin reductase  49.06 
 
 		 317 aa  265  8e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000408634  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1451  Alkyl hydroperoxide reductase, large subunit  46.25 
 
 		 569 aa  265  8e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  43.81 
 
 		 321 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  43.81 
 
 		 321 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  43.81 
 
 		 321 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  43.81 
 
 		 318 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  43.81 
 
 		 318 aa  265  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  43.81 
 
 		 318 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  43.81 
 
 		 318 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  43.17 
 
 		 318 aa  263  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  44.66 
 
 		 320 aa  262  6e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  47.45 
 
 		 312 aa  261  8e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  44.62 
 
 		 319 aa  261  8e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0114  thioredoxin reductase  46.8 
 
 		 304 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  44.95 
 
 		 334 aa  259  3e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  44.01 
 
 		 334 aa  258  8e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  42.72 
 
 		 311 aa  258  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  48.22 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  44.87 
 
 		 348 aa  257  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  42.72 
 
 		 311 aa  258  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  48.39 
 
 		 326 aa  257  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  46.5 
 
 		 311 aa  256  3e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  41.9 
 
 		 308 aa  256  4e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1406  thioredoxin reductase  43.41 
 
 		 638 aa  256  5e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0495  thioredoxin reductase  42.36 
 
 		 320 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0935  thioredoxin reductase  42.36 
 
 		 320 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0974  thioredoxin reductase  42.36 
 
 		 320 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0634  thioredoxin reductase  42.68 
 
 		 333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0834  thioredoxin reductase  41.72 
 
 		 346 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0846  thioredoxin reductase  41.72 
 
 		 320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.53 
 
 		 427 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  44.73 
 
 		 330 aa  253  3e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  44.73 
 
 		 310 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  42.21 
 
 		 310 aa  252  7e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  43.23 
 
 		 306 aa  251  9.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  44.84 
 
 		 396 aa  251  1e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  43.91 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  44.01 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  44.73 
 
 		 310 aa  250  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  45.05 
 
 		 311 aa  249  3e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  43.04 
 
 		 353 aa  249  4e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  41.4 
 
 		 320 aa  249  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  42.86 
 
 		 312 aa  249  6e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  43.04 
 
 		 317 aa  248  8e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  45.63 
 
 		 319 aa  248  8e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  43.23 
 
 		 308 aa  248  9e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.81 
 
 		 407 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  42.72 
 
 		 321 aa  247  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4077  thioredoxin reductase  41.4 
 
 		 346 aa  246  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  42.86 
 
 		 309 aa  247  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0789  thioredoxin-disulfide reductase  41.08 
 
 		 320 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2123  thioredoxin-disulfide reductase  41.08 
 
 		 320 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3078  thioredoxin-disulfide reductase  41.08 
 
 		 320 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2621  thioredoxin-disulfide reductase  41.08 
 
 		 320 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105399  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2991  thioredoxin-disulfide reductase  41.08 
 
 		 320 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  44.66 
 
 		 320 aa  246  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3045  thioredoxin-disulfide reductase  41.08 
 
 		 320 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  41.75 
 
 		 317 aa  246  3e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1991  thioredoxin-disulfide reductase  41.08 
 
 		 320 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  41.07 
 
 		 340 aa  246  4e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  40.45 
 
 		 311 aa  246  4e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  42.27 
 
 		 311 aa  246  4.9999999999999997e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1736  thioredoxin reductase  45.83 
 
 		 307 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000141023  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  43.09 
 
 		 310 aa  244  9.999999999999999e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  45.54 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  42.17 
 
 		 311 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1560  thioredoxin-disulfide reductase  40.76 
 
 		 320 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  43.56 
 
 		 317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  42.09 
 
 		 317 aa  243  3e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  44.78 
 
 		 309 aa  243  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1443  thioredoxin reductase  38.73 
 
 		 352 aa  243  3e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1853  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.88 
 
 		 305 aa  243  3e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3442  thioredoxin reductase  39.81 
 
 		 333 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  42.95 
 
 		 331 aa  243  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  43.31 
 
 		 310 aa  242  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1037  thioredoxin reductase  39.81 
 
 		 333 aa  242  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.526099 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  44.9 
 
 		 329 aa  242  6e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  43.04 
 
 		 321 aa  242  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  42.72 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  42.72 
 
 		 312 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>