20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2203 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_2203  protein of unknown function DUF1566  100 
 
 
165 aa  345  2e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000589172  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0388  protein of unknown function DUF1566  36.81 
 
 
190 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470988  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2072  protein of unknown function DUF1566  30.99 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000064519  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3291  hypothetical protein  35 
 
 
165 aa  61.2  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03097  putative Fimh-like protein  37.21 
 
 
187 aa  58.5  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2546  hypothetical protein  27.04 
 
 
181 aa  57.4  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3266  hypothetical protein  32.05 
 
 
176 aa  57  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3364  hypothetical protein  29.67 
 
 
240 aa  54.3  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.276808  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0752  hypothetical protein  27.67 
 
 
185 aa  53.9  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1186  hypothetical protein  31.21 
 
 
179 aa  53.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.218554 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05135  hypothetical protein  30.83 
 
 
190 aa  51.2  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001260  hypothetical protein  30.3 
 
 
190 aa  49.7  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0071  hypothetical protein  35.48 
 
 
186 aa  48.9  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  27.93 
 
 
746 aa  47.8  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3265  hypothetical protein  34.67 
 
 
245 aa  48.1  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1701  hypothetical protein  31.4 
 
 
212 aa  48.1  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2002  protein of unknown function DUF1566  31.4 
 
 
255 aa  47.8  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0991584  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0168  protein of unknown function DUF1566  31.75 
 
 
333 aa  45.1  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1619  hypothetical protein  29.1 
 
 
299 aa  40.8  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000971569  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0451  hypothetical protein  42.22 
 
 
1152 aa  40.4  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>