More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1959 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1959  30S ribosomal protein S17  100 
 
 
83 aa  167  5e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.493665  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0093  30S ribosomal protein S17  78.31 
 
 
83 aa  142  2e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.854  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1024  30S ribosomal protein S17  79.52 
 
 
83 aa  140  8e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00110885  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0043  30S ribosomal protein S17  77.78 
 
 
85 aa  138  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.183118  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1768  30S ribosomal protein S17  77.11 
 
 
83 aa  137  3.9999999999999997e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000123557  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0068  30S ribosomal protein S17  75.9 
 
 
83 aa  134  6.0000000000000005e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00143996  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1866  30S ribosomal protein S17  73.49 
 
 
83 aa  131  3e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2072  30S ribosomal protein S17  72.29 
 
 
83 aa  131  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0741725  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1695  30S ribosomal protein S17  73.49 
 
 
83 aa  131  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000812231  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0295  30S ribosomal protein S17  68.67 
 
 
82 aa  117  6e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00357598  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1937  30S ribosomal protein S17  56.16 
 
 
90 aa  85.9  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0467  SSU ribosomal protein S17P  54.29 
 
 
87 aa  85.1  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 
88 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  56.96 
 
 
88 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2975  30S ribosomal protein S17  55.07 
 
 
92 aa  83.6  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2146  SSU ribosomal protein S17P  54.29 
 
 
138 aa  83.6  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0316675  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2414  30S ribosomal protein S17  52.63 
 
 
101 aa  83.6  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000854587  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 
88 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 
88 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0849  30S ribosomal protein S17  53.33 
 
 
86 aa  82  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  54.43 
 
 
88 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2898  30S ribosomal protein S17  54.93 
 
 
97 aa  81.6  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  54.43 
 
 
88 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1565  ribosomal protein S17  55.88 
 
 
86 aa  81.3  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00149156  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0506  ribosomal protein S17  50 
 
 
91 aa  81.3  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0458965  hitchhiker  0.000000000246265 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0190  30S ribosomal protein S17  51.32 
 
 
94 aa  81.3  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00542058  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1842  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
89 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0587769  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0336  ribosomal protein S17  50 
 
 
91 aa  81.3  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3010  30S ribosomal protein S17  51.25 
 
 
89 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000740755  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  51.95 
 
 
85 aa  80.5  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06340  30S ribosomal protein S17  58.57 
 
 
88 aa  80.9  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.543967  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2055  30S ribosomal protein S17  53.52 
 
 
99 aa  80.9  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000336499  normal  0.395653 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0167  30S ribosomal protein S17  52.7 
 
 
82 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350413  hitchhiker  0.000281031 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2941  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
89 aa  79.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00001015  hitchhiker  0.00000362348 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  54.29 
 
 
86 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0776  ribosomal protein S17  55.56 
 
 
88 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000337654  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3900  30S ribosomal protein S17  61.43 
 
 
88 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00230536  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4681  30S ribosomal protein S17  52.7 
 
 
82 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000864007  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  50.67 
 
 
86 aa  79.3  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3308  30S ribosomal protein S17  51.25 
 
 
92 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000182432  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  57.75 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3288  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
89 aa  79.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000278806  hitchhiker  0.00000199578 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3515  ribosomal protein S17  54.05 
 
 
83 aa  79.7  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000390975  hitchhiker  0.000000987028 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0240  30S ribosomal protein S17  52.7 
 
 
82 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0635  ribosomal protein S17  53.16 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000269745  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4539  30S ribosomal protein S17  53.16 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3170  30S ribosomal protein S17  52.5 
 
 
92 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000175324  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5070  30S ribosomal protein S17  51.9 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000035859  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  52.7 
 
 
82 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000114051  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2679  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 
79 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548519  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00454  30S ribosomal protein S17  55.7 
 
 
85 aa  79  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.301377  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1858  30S ribosomal protein S17  48.05 
 
 
94 aa  79.3  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.147715  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0478  30S ribosomal protein S17  54.05 
 
 
83 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.112019  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0208  30S ribosomal protein S17  52.7 
 
 
82 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000014726  unclonable  0.0000000000149425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0203  30S ribosomal protein S17  52.7 
 
 
82 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000279278  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0157  ribosomal protein S17  50 
 
 
82 aa  79  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000117396  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0856  SSU ribosomal protein S17P  52.5 
 
 
83 aa  79  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0208  30S ribosomal protein S17  52.7 
 
 
82 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000159917  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0689  30S ribosomal protein S17  54.05 
 
 
82 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138415  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  55.56 
 
 
84 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4308  30S ribosomal protein S17  51.35 
 
 
82 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000115651  unclonable  0.0000000000430661 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1849  30S ribosomal protein S17  57.97 
 
 
78 aa  78.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0814594  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0300  30S ribosomal protein S17  53.33 
 
 
88 aa  78.2  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.633045  unclonable  6.524050000000001e-29 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1341  30S ribosomal protein S17  57.97 
 
 
79 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173733  normal  0.105866 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 
84 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1439  30S ribosomal protein S17  57.97 
 
 
79 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329181  normal  0.13779 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2831  30S ribosomal protein S17  51.25 
 
 
90 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000151537  normal  0.471664 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1845  30S ribosomal protein S17  51.32 
 
 
120 aa  77.8  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.48409e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  55.71 
 
 
88 aa  77.8  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0179  ribosomal protein S17  50 
 
 
82 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000265086  n/a   
 
 
 
NC_011901  Tgr7_2315  30S ribosomal protein S17  46.75 
 
 
87 aa  77  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0524873  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0995  30S ribosomal protein S17  56.52 
 
 
78 aa  77  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0284701 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4047  30S ribosomal protein S17  51.35 
 
 
82 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100461  unclonable  0.00000000000380928 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0209  30S ribosomal protein S17  51.35 
 
 
82 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000139872  unclonable  0.00000794162 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3750  30S ribosomal protein S17  51.35 
 
 
82 aa  77  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000077178  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2287  30S ribosomal protein S17  49.33 
 
 
89 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000132809  hitchhiker  0.00277508 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0205  30S ribosomal protein S17  51.35 
 
 
82 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000179685  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4161  30S ribosomal protein S17  51.35 
 
 
82 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038185  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3487  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
90 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00115602  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3737  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
90 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000331818  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2623  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
90 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1933  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
90 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000633723  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3795  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
90 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3767  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
90 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000138754  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  49.35 
 
 
84 aa  76.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3059  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
90 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000184164  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3160  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
90 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677141  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
107 aa  76.3  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  50.65 
 
 
84 aa  75.9  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  53.52 
 
 
101 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0285  30S ribosomal protein S17  48.75 
 
 
90 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405514  normal  0.0233018 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3456  30S ribosomal protein S17  48.75 
 
 
90 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380443  decreased coverage  0.00396929 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0336  30S ribosomal protein S17  48.75 
 
 
90 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000156672  normal  0.0197388 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1156  30S ribosomal protein S17  51.95 
 
 
85 aa  75.5  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000188626  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3742  30S ribosomal protein S17  51.28 
 
 
84 aa  75.5  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000425306  hitchhiker  0.00355064 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3992  30S ribosomal protein S17  52 
 
 
84 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0276  30S ribosomal protein S17  48.75 
 
 
90 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000137406  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0357  30S ribosomal protein S17  48.75 
 
 
90 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000267511  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf433  ribosomal protein S17  55.41 
 
 
94 aa  75.9  0.0000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0222  30S ribosomal subunit protein S17  54.05 
 
 
82 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000618059  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>