More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0093 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0093  30S ribosomal protein S17  100 
 
 
83 aa  166  1e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.854  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1959  30S ribosomal protein S17  78.31 
 
 
83 aa  142  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.493665  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0043  30S ribosomal protein S17  83.95 
 
 
85 aa  141  3e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.183118  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1024  30S ribosomal protein S17  79.52 
 
 
83 aa  138  1.9999999999999998e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00110885  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1768  30S ribosomal protein S17  79.52 
 
 
83 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000123557  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1866  30S ribosomal protein S17  74.7 
 
 
83 aa  134  4e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1695  30S ribosomal protein S17  74.7 
 
 
83 aa  134  4e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000812231  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0068  30S ribosomal protein S17  71.08 
 
 
83 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00143996  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2072  30S ribosomal protein S17  72.29 
 
 
83 aa  131  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0741725  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0295  30S ribosomal protein S17  70.51 
 
 
82 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00357598  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0467  SSU ribosomal protein S17P  45.33 
 
 
87 aa  78.6  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2146  SSU ribosomal protein S17P  48.57 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0316675  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1937  30S ribosomal protein S17  49.32 
 
 
90 aa  77.4  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0336  ribosomal protein S17  46.15 
 
 
91 aa  77.4  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0506  ribosomal protein S17  46.15 
 
 
91 aa  77.4  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0458965  hitchhiker  0.000000000246265 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0849  30S ribosomal protein S17  50.67 
 
 
86 aa  77.4  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2898  30S ribosomal protein S17  46.15 
 
 
97 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2975  30S ribosomal protein S17  47.83 
 
 
92 aa  75.5  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0689  30S ribosomal protein S17  44.74 
 
 
82 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138415  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2414  30S ribosomal protein S17  47.37 
 
 
101 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000854587  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2315  30S ribosomal protein S17  47.37 
 
 
87 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0524873  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  50.63 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  49.3 
 
 
86 aa  75.5  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  50.63 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  50.63 
 
 
88 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  50.63 
 
 
88 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1842  30S ribosomal protein S17  47.37 
 
 
89 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0587769  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  50.7 
 
 
85 aa  74.7  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  50.7 
 
 
84 aa  74.3  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1355  30S ribosomal protein S17  43.21 
 
 
85 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.132856  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0190  30S ribosomal protein S17  49.3 
 
 
94 aa  73.9  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00542058  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2160  30S ribosomal protein S17  46.67 
 
 
88 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0103749  normal  0.166866 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00454  30S ribosomal protein S17  49.37 
 
 
85 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.301377  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1565  ribosomal protein S17  46.58 
 
 
86 aa  72.8  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00149156  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1845  30S ribosomal protein S17  45.45 
 
 
120 aa  72  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.48409e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06340  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
88 aa  71.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.543967  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2941  30S ribosomal protein S17  45 
 
 
89 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00001015  hitchhiker  0.00000362348 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3288  30S ribosomal protein S17  45 
 
 
89 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000278806  hitchhiker  0.00000199578 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0328  SSU ribosomal protein S17P  43.21 
 
 
88 aa  70.9  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.11157e-25  unclonable  0.0000000432201 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5070  30S ribosomal protein S17  46.84 
 
 
88 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000035859  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  44.3 
 
 
88 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  44.3 
 
 
88 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0347  30S ribosomal protein S17  50.7 
 
 
89 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.451528  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0263  30S ribosomal protein S17  46.48 
 
 
76 aa  70.5  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.308255  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2287  30S ribosomal protein S17  47.89 
 
 
89 aa  70.1  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000132809  hitchhiker  0.00277508 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  47.37 
 
 
84 aa  70.1  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3010  30S ribosomal protein S17  45 
 
 
89 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000740755  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0635  ribosomal protein S17  45.57 
 
 
88 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000269745  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4539  30S ribosomal protein S17  45.57 
 
 
88 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  47.37 
 
 
84 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  43.42 
 
 
107 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  44 
 
 
86 aa  69.7  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3900  30S ribosomal protein S17  51.43 
 
 
88 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00230536  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0304  ribosomal protein S17  36.99 
 
 
87 aa  68.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000983019  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0776  ribosomal protein S17  47.22 
 
 
88 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000337654  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2650  30S ribosomal protein S17  43.59 
 
 
96 aa  68.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3308  30S ribosomal protein S17  43.75 
 
 
92 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000182432  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1858  30S ribosomal protein S17  40.26 
 
 
94 aa  68.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.147715  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0300  30S ribosomal protein S17  45.95 
 
 
88 aa  68.9  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.633045  unclonable  6.524050000000001e-29 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  47.89 
 
 
89 aa  69.3  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0856  SSU ribosomal protein S17P  47.83 
 
 
83 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5778  30S ribosomal protein S17  46.48 
 
 
120 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274363  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4681  30S ribosomal protein S17  43.24 
 
 
82 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000864007  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1095  30S ribosomal protein S17  42.86 
 
 
93 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4352  30S ribosomal protein S17  46.75 
 
 
87 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186006  normal  0.0710567 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3170  30S ribosomal protein S17  45 
 
 
92 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000175324  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  43.24 
 
 
82 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000114051  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0968  30S ribosomal protein S17  48.57 
 
 
88 aa  68.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132893  hitchhiker  0.000000938527 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3319  30S ribosomal protein S17  44.44 
 
 
85 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000278242 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2055  30S ribosomal protein S17  45.45 
 
 
99 aa  68.6  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000336499  normal  0.395653 
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  45.45 
 
 
84 aa  68.2  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0116  30S ribosomal protein S17  51.35 
 
 
87 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2831  30S ribosomal protein S17  43.75 
 
 
90 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000151537  normal  0.471664 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0781  ribosomal protein S17  43.42 
 
 
110 aa  68.2  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0942  30S ribosomal protein S17  44.44 
 
 
85 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308602  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0167  30S ribosomal protein S17  43.24 
 
 
82 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350413  hitchhiker  0.000281031 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0287  30S ribosomal protein S17  47.56 
 
 
89 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000277089 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1341  30S ribosomal protein S17  47.83 
 
 
79 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173733  normal  0.105866 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1439  30S ribosomal protein S17  47.83 
 
 
79 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329181  normal  0.13779 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0120  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
87 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326224  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0282  30S ribosomal protein S17  47.56 
 
 
89 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000313457  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf433  ribosomal protein S17  47.3 
 
 
94 aa  67.8  0.00000000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1920  30S ribosomal protein S17  46.48 
 
 
85 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.826822 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl132  30S ribosomal protein S17  46.84 
 
 
85 aa  67  0.00000000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4308  30S ribosomal protein S17  41.89 
 
 
82 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000115651  unclonable  0.0000000000430661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  45.83 
 
 
88 aa  67  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0478  30S ribosomal protein S17  44.29 
 
 
83 aa  67  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.112019  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0332  ribosomal protein S17  43.59 
 
 
84 aa  67  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000873863  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3059  30S ribosomal protein S17  42.5 
 
 
90 aa  67  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000184164  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2227  30S ribosomal protein S17  45.07 
 
 
87 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.706142  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0276  30S ribosomal protein S17  41.25 
 
 
90 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000137406  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0285  30S ribosomal protein S17  41.25 
 
 
90 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405514  normal  0.0233018 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  45.71 
 
 
88 aa  67  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0707  30S ribosomal protein S17  47.83 
 
 
80 aa  66.2  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000487385  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0067  30S ribosomal protein S17  44.3 
 
 
86 aa  66.2  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.1837  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16691  30S ribosomal protein S17  42.17 
 
 
88 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0240  30S ribosomal protein S17  43.24 
 
 
82 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3767  30S ribosomal protein S17  42.5 
 
 
90 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000138754  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2315  ribosomal protein S17  42.25 
 
 
86 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000099877  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3487  30S ribosomal protein S17  42.5 
 
 
90 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00115602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>